Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Gm42801-201ENSMUST00000202562 2865 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Chmp3Q9CQ10 Olfr143-202ENSMUST00000213129 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
Chmp3Q9CQ10 Zfp735-201ENSMUST00000080407 3746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
Chmp3Q9CQ10 Zfp40-206ENSMUST00000172177 2736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
Chmp3Q9CQ10 AC154386.1-201ENSMUST00000222753 2871 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Chmp3Q9CQ10 Gm24068-201ENSMUST00000104513 132 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Chmp3Q9CQ10 Gm25528-201ENSMUST00000180264 132 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Chmp3Q9CQ10 B230207O21Rik-201ENSMUST00000198634 321 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Chmp3Q9CQ10 AC147101.2-201ENSMUST00000219756 184 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Chmp3Q9CQ10 Gm25588-201ENSMUST00000082501 140 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Chmp3Q9CQ10 Gm22306-201ENSMUST00000082692 107 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Chmp3Q9CQ10 Olfr801-203ENSMUST00000213294 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
Chmp3Q9CQ10 Agmo-201ENSMUST00000049874 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
Chmp3Q9CQ10 Muc16-204ENSMUST00000208663 25437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Chmp3Q9CQ10 Gm26074-201ENSMUST00000104063 129 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Chmp3Q9CQ10 Gm14602-201ENSMUST00000118625 340 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Chmp3Q9CQ10 Gm24443-201ENSMUST00000157242 132 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Chmp3Q9CQ10 Gm26214-201ENSMUST00000158581 107 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Chmp3Q9CQ10 Mir669j-201ENSMUST00000179023 121 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Chmp3Q9CQ10 Gm27532-201ENSMUST00000183726 113 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Chmp3Q9CQ10 Pak3-202ENSMUST00000112863 8657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Chmp3Q9CQ10 Olfr1369-ps1-205ENSMUST00000215941 3597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
Chmp3Q9CQ10 Gm24890-201ENSMUST00000104389 102 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Chmp3Q9CQ10 Gm15069-201ENSMUST00000117792 192 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Chmp3Q9CQ10 Gm15068-201ENSMUST00000119796 192 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Chmp3Q9CQ10 Gm13246-201ENSMUST00000120994 315 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Chmp3Q9CQ10 Gm22558-201ENSMUST00000157326 95 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Chmp3Q9CQ10 Rnu7-201ENSMUST00000158458 62 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Chmp3Q9CQ10 Gm25646-201ENSMUST00000178527 79 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Chmp3Q9CQ10 Gm3333-201ENSMUST00000221637 452 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
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Chmp3Q9CQ10 Gm26175-201ENSMUST00000083794 131 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Chmp3Q9CQ10 Olfr1454-202ENSMUST00000213806 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
Chmp3Q9CQ10 Olfr1132-202ENSMUST00000216082 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
Chmp3Q9CQ10 Olfr58-202ENSMUST00000215112 2454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
Chmp3Q9CQ10 Olfr229-202ENSMUST00000214904 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
Chmp3Q9CQ10 Gm23128-201ENSMUST00000104257 132 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Chmp3Q9CQ10 Gm25270-201ENSMUST00000122606 138 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Chmp3Q9CQ10 Gm22708-201ENSMUST00000158987 103 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Chmp3Q9CQ10 Snord93-201ENSMUST00000175580 71 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Chmp3Q9CQ10 Gm23090-201ENSMUST00000177331 78 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Chmp3Q9CQ10 Gm26741-201ENSMUST00000180473 87 ntAPPRIS P1 BASIC3.42□□□□□ -1.86
Chmp3Q9CQ10 Gm23128-202ENSMUST00000196578 133 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Chmp3Q9CQ10 Gm38407-201ENSMUST00000218017 474 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
Chmp3Q9CQ10 Gm45104-201ENSMUST00000208748 4350 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Chmp3Q9CQ10 Zfp979-201ENSMUST00000037565 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
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Chmp3Q9CQ10 Gm11414-201ENSMUST00000121795 263 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Chmp3Q9CQ10 Gm24559-201ENSMUST00000157519 121 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Chmp3Q9CQ10 Gm44526-201ENSMUST00000204664 121 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
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Chmp3Q9CQ10 AC129085.1-201ENSMUST00000225263 165 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Chmp3Q9CQ10 Gm23738-201ENSMUST00000082828 171 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Chmp3Q9CQ10 Ctdspl2-202ENSMUST00000110572 4160 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
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Chmp3Q9CQ10 Gm13588-201ENSMUST00000120026 135 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
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Chmp3Q9CQ10 Gm24894-201ENSMUST00000122744 118 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
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Chmp3Q9CQ10 Gm25910-201ENSMUST00000157620 140 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Chmp3Q9CQ10 Gm22163-201ENSMUST00000158408 135 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Chmp3Q9CQ10 Gm27991-201ENSMUST00000184804 137 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
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Chmp3Q9CQ10 Olfr794-202ENSMUST00000204820 3044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
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Chmp3Q9CQ10 Olfr881-202ENSMUST00000212489 4237 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
Chmp3Q9CQ10 Olfr394-203ENSMUST00000216608 5628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
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Chmp3Q9CQ10 Gm15272-201ENSMUST00000120865 233 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
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Chmp3Q9CQ10 Gm22511-201ENSMUST00000177628 79 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Chmp3Q9CQ10 Gm22630-201ENSMUST00000177781 79 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
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Chmp3Q9CQ10 Gm26059-201ENSMUST00000177865 79 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Chmp3Q9CQ10 Gm22255-201ENSMUST00000177933 79 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
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Chmp3Q9CQ10 Gm25523-201ENSMUST00000178044 79 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Chmp3Q9CQ10 Gm24585-201ENSMUST00000178104 79 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
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Chmp3Q9CQ10 Gm22912-201ENSMUST00000178242 79 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Chmp3Q9CQ10 Gm24866-201ENSMUST00000178338 79 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Chmp3Q9CQ10 Gm22524-201ENSMUST00000178357 79 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Chmp3Q9CQ10 Gm25710-201ENSMUST00000178367 79 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
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Chmp3Q9CQ10 Gm24872-201ENSMUST00000178434 79 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
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Chmp3Q9CQ10 Gm24702-201ENSMUST00000178965 79 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Chmp3Q9CQ10 Gm24206-201ENSMUST00000179011 79 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Chmp3Q9CQ10 Gm24528-201ENSMUST00000179164 79 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Chmp3Q9CQ10 Gm22909-201ENSMUST00000179190 79 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Chmp3Q9CQ10 Gm26334-201ENSMUST00000179403 79 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Chmp3Q9CQ10 Gm25463-201ENSMUST00000179405 79 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
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