Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Gm27640-201ENSMUST00000184580 147 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Usp27Q8CEG8 Igkv15-102-201ENSMUST00000197885 287 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Usp27Q8CEG8 CT025689.3-201ENSMUST00000223817 301 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Usp27Q8CEG8 CT025630.1-201ENSMUST00000227901 172 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Usp27Q8CEG8 Defb50-201ENSMUST00000078879 373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.23
Usp27Q8CEG8 Mir448-201ENSMUST00000083516 112 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Usp27Q8CEG8 Gm23345-201ENSMUST00000083817 150 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Usp27Q8CEG8 Gm25512-201ENSMUST00000083863 107 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Usp27Q8CEG8 n-R5s67-201ENSMUST00000104336 114 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Usp27Q8CEG8 Snord71-201ENSMUST00000104361 85 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Usp27Q8CEG8 Gm23836-201ENSMUST00000104434 129 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Usp27Q8CEG8 Vmn1r-ps125-201ENSMUST00000117767 290 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Usp27Q8CEG8 Gm23339-201ENSMUST00000158962 139 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Usp27Q8CEG8 Gm22242-201ENSMUST00000175224 118 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Usp27Q8CEG8 Mir6381-201ENSMUST00000183426 87 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Usp27Q8CEG8 Mir6951-201ENSMUST00000183910 75 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Usp27Q8CEG8 Gm37338-201ENSMUST00000191986 127 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Usp27Q8CEG8 Gm44473-201ENSMUST00000204039 152 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Usp27Q8CEG8 CT009696.1-201ENSMUST00000215745 256 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Usp27Q8CEG8 Gm24966-201ENSMUST00000082443 79 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Usp27Q8CEG8 Gm10542-201ENSMUST00000097586 273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
Usp27Q8CEG8 8030445P17Rik-201ENSMUST00000192614 2741 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Usp27Q8CEG8 CT030170.3-201ENSMUST00000221205 1815 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Usp27Q8CEG8 Gm26339-201ENSMUST00000102368 99 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Usp27Q8CEG8 Mir544-201ENSMUST00000103813 78 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Usp27Q8CEG8 Gm12647-201ENSMUST00000118977 265 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Usp27Q8CEG8 Gm11572-201ENSMUST00000119164 120 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Usp27Q8CEG8 Gm13967-201ENSMUST00000120404 380 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Usp27Q8CEG8 Gm14761-201ENSMUST00000121363 262 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Usp27Q8CEG8 Gm15214-201ENSMUST00000122155 470 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Usp27Q8CEG8 Gm14773-201ENSMUST00000125932 451 ntTSL 2 BASIC1.07□□□□□ -2.24
Usp27Q8CEG8 Gm24915-201ENSMUST00000157288 78 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Usp27Q8CEG8 Vmn2r-ps65-201ENSMUST00000173309 220 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Usp27Q8CEG8 Gm25069-201ENSMUST00000175238 86 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Usp27Q8CEG8 Vmn1r-ps6-202ENSMUST00000202526 135 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
Usp27Q8CEG8 Gm44419-201ENSMUST00000203338 229 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Usp27Q8CEG8 Vmn1r-ps13-201ENSMUST00000204697 134 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Usp27Q8CEG8 Gm44858-201ENSMUST00000207360 154 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Usp27Q8CEG8 Gm19572-201ENSMUST00000214326 338 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Usp27Q8CEG8 AC145736.2-201ENSMUST00000216305 365 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Usp27Q8CEG8 Gm25079-201ENSMUST00000082529 203 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Usp27Q8CEG8 Gm25038-201ENSMUST00000082928 130 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Usp27Q8CEG8 Mir196b-201ENSMUST00000083509 85 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Usp27Q8CEG8 Mir219a-2-201ENSMUST00000083551 97 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Usp27Q8CEG8 Gm23851-201ENSMUST00000083831 103 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Usp27Q8CEG8 Gm25683-201ENSMUST00000083940 131 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Usp27Q8CEG8 Gm26111-201ENSMUST00000083969 106 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Usp27Q8CEG8 Gm25170-201ENSMUST00000104191 129 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Usp27Q8CEG8 Gm25274-201ENSMUST00000104296 135 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Usp27Q8CEG8 Gm14922-201ENSMUST00000121131 163 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Usp27Q8CEG8 Gm22164-201ENSMUST00000158413 106 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Usp27Q8CEG8 Gm22114-201ENSMUST00000177756 107 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Usp27Q8CEG8 Ranbp2-ps7-201ENSMUST00000183924 384 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Usp27Q8CEG8 Gm45673-201ENSMUST00000210293 358 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Usp27Q8CEG8 Gm38407-201ENSMUST00000218017 474 ntTSL 2 BASIC1.06□□□□□ -2.24
Usp27Q8CEG8 AC132437.1-201ENSMUST00000218308 320 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Usp27Q8CEG8 Hspe1-ps2-201ENSMUST00000051437 312 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Usp27Q8CEG8 Gm25078-201ENSMUST00000082530 107 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Usp27Q8CEG8 Gm24038-201ENSMUST00000082872 159 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Usp27Q8CEG8 Gm25513-201ENSMUST00000083861 162 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Usp27Q8CEG8 Olfr618-202ENSMUST00000214883 3304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
Usp27Q8CEG8 Trgj3-201ENSMUST00000103562 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.05□□□□□ -2.24
Usp27Q8CEG8 Gm23705-201ENSMUST00000104370 130 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Usp27Q8CEG8 Gm14917-201ENSMUST00000118872 2105 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Usp27Q8CEG8 Gm22279-201ENSMUST00000157200 93 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Usp27Q8CEG8 Gm22215-201ENSMUST00000157558 96 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Usp27Q8CEG8 Gm22537-201ENSMUST00000158172 199 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Usp27Q8CEG8 Gm24942-201ENSMUST00000158328 114 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Usp27Q8CEG8 Gm23759-201ENSMUST00000158351 268 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Usp27Q8CEG8 Gm22425-201ENSMUST00000158532 138 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Usp27Q8CEG8 Gm23340-201ENSMUST00000158955 123 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Usp27Q8CEG8 Gm27540-201ENSMUST00000184950 187 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Usp27Q8CEG8 Gm28579-201ENSMUST00000186143 369 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Usp27Q8CEG8 Mir376a-201ENSMUST00000197584 68 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Usp27Q8CEG8 Gm45543-201ENSMUST00000209327 88 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Usp27Q8CEG8 Gm23055-201ENSMUST00000082805 94 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Usp27Q8CEG8 Gm22294-201ENSMUST00000083308 104 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Usp27Q8CEG8 Gm23245-201ENSMUST00000083370 135 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Usp27Q8CEG8 Mir155-201ENSMUST00000083463 65 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Usp27Q8CEG8 Mir22-201ENSMUST00000083595 95 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Usp27Q8CEG8 Olfr820-203ENSMUST00000215791 3956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
Usp27Q8CEG8 Gm10945-201ENSMUST00000105596 60 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
Usp27Q8CEG8 Gm24630-201ENSMUST00000122768 106 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Usp27Q8CEG8 Gm26038-201ENSMUST00000158151 106 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Usp27Q8CEG8 Gm22434-201ENSMUST00000158549 122 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Usp27Q8CEG8 Obox4-ps37-201ENSMUST00000177223 276 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Usp27Q8CEG8 Gm16399-201ENSMUST00000181423 219 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Usp27Q8CEG8 Gm42719-201ENSMUST00000197393 355 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Usp27Q8CEG8 Snord96a-201ENSMUST00000082791 81 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Usp27Q8CEG8 Mir181a-2-201ENSMUST00000083489 76 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Usp27Q8CEG8 Gm24261-201ENSMUST00000083744 104 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Usp27Q8CEG8 Gm42718-201ENSMUST00000197319 2681 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Usp27Q8CEG8 mt-Nd4-201ENSMUST00000082414 1378 ntAPPRIS P1 BASIC1.04□□□□□ -2.24
Usp27Q8CEG8 Gm18795-202ENSMUST00000223373 2920 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Usp27Q8CEG8 Mir669i-201ENSMUST00000117007 127 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Usp27Q8CEG8 Gm11794-201ENSMUST00000119446 237 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Usp27Q8CEG8 Gm12924-201ENSMUST00000121747 318 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Usp27Q8CEG8 Gm22479-201ENSMUST00000122566 81 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Usp27Q8CEG8 Gm24629-201ENSMUST00000122762 89 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Usp27Q8CEG8 Gm25884-201ENSMUST00000157782 62 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 163.3 ms