Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Gm33962-201ENSMUST00000182643 2592 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
ptchd1Q14B62 Gm1980-201ENSMUST00000123131 2306 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
ptchd1Q14B62 Tlr3-202ENSMUST00000167106 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
ptchd1Q14B62 Tex16-201ENSMUST00000038546 3972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
ptchd1Q14B62 Uty-201ENSMUST00000069309 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
ptchd1Q14B62 Gm16171-201ENSMUST00000118004 324 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ptchd1Q14B62 Cox20-ps-201ENSMUST00000119872 353 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ptchd1Q14B62 Gm23983-201ENSMUST00000157142 114 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ptchd1Q14B62 Gm24291-201ENSMUST00000157633 162 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ptchd1Q14B62 Rnu7-201ENSMUST00000158458 62 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ptchd1Q14B62 Mir7039-201ENSMUST00000183852 85 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ptchd1Q14B62 Mir8103-201ENSMUST00000183945 107 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ptchd1Q14B62 Gm27991-201ENSMUST00000184804 137 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ptchd1Q14B62 Gm43381-201ENSMUST00000198553 165 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ptchd1Q14B62 Gm42807-201ENSMUST00000200141 329 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ptchd1Q14B62 AC125350.4-201ENSMUST00000225895 273 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ptchd1Q14B62 Gm26458-201ENSMUST00000082832 128 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ptchd1Q14B62 n-R5s183-201ENSMUST00000083939 115 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ptchd1Q14B62 Vmn1r185-208ENSMUST00000228004 5682 ntAPPRIS P1 BASIC2.61□□□□□ -1.99
ptchd1Q14B62 Gm45104-201ENSMUST00000208748 4350 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ptchd1Q14B62 Olfr479-202ENSMUST00000209805 2902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
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ptchd1Q14B62 Gm24681-201ENSMUST00000158760 107 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ptchd1Q14B62 Gm16111-201ENSMUST00000162128 285 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ptchd1Q14B62 Snord53-201ENSMUST00000175146 78 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ptchd1Q14B62 Gm23090-201ENSMUST00000177331 78 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
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ptchd1Q14B62 Gm26390-201ENSMUST00000179628 79 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
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ptchd1Q14B62 Gm38407-201ENSMUST00000218017 474 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
ptchd1Q14B62 AC098718.1-201ENSMUST00000226166 175 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
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ptchd1Q14B62 Zfp985-201ENSMUST00000081742 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
ptchd1Q14B62 Slitrk6-201ENSMUST00000078386 4240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
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ptchd1Q14B62 Olfr1044-202ENSMUST00000215171 3266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
ptchd1Q14B62 Gm43373-201ENSMUST00000202552 2870 ntBASIC2.58□□□□□ -2
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ptchd1Q14B62 Mir1195-201ENSMUST00000116818 98 ntBASIC2.57□□□□□ -2
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ptchd1Q14B62 Gm26084-201ENSMUST00000157903 104 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ptchd1Q14B62 Gm22731-201ENSMUST00000158086 94 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ptchd1Q14B62 Gm25470-201ENSMUST00000175576 111 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ptchd1Q14B62 CAAA01090905.1-201ENSMUST00000219056 426 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
ptchd1Q14B62 Snord118-201ENSMUST00000082965 135 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ptchd1Q14B62 N4bp2l2-201ENSMUST00000118316 8982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
ptchd1Q14B62 Olfr229-202ENSMUST00000214904 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
ptchd1Q14B62 Acer3-202ENSMUST00000120520 3964 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
ptchd1Q14B62 C630028M04Rik-201ENSMUST00000141452 3387 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
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