Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 mt-Ta-201ENSMUST00000082398 69 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Cntn3Q07409 Gm26456-201ENSMUST00000082831 111 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Cntn3Q07409 Olfr1193-202ENSMUST00000213893 3519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Cntn3Q07409 Gm24443-201ENSMUST00000157242 132 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Cntn3Q07409 Gm25882-201ENSMUST00000157784 85 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Cntn3Q07409 Rnu7-201ENSMUST00000158458 62 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Cntn3Q07409 Gm23409-201ENSMUST00000158516 237 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Cntn3Q07409 Gm25528-201ENSMUST00000180264 132 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Cntn3Q07409 Mir6405-201ENSMUST00000184584 124 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Cntn3Q07409 Mir9-1-201ENSMUST00000199907 89 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Cntn3Q07409 Snord118-201ENSMUST00000082965 135 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Cntn3Q07409 Mir155-201ENSMUST00000083463 65 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Cntn3Q07409 Gm43379-201ENSMUST00000196253 7726 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Cntn3Q07409 Olfr623-202ENSMUST00000213840 3980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Cntn3Q07409 CT025538.3-201ENSMUST00000225279 3848 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
Cntn3Q07409 Olfr1450-202ENSMUST00000213587 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Cntn3Q07409 n-R5s15-201ENSMUST00000122635 111 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Cntn3Q07409 Gm25828-201ENSMUST00000157087 95 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Cntn3Q07409 Snord93-201ENSMUST00000175580 71 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Cntn3Q07409 Gm27672-201ENSMUST00000183751 204 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Cntn3Q07409 mt-Tt-201ENSMUST00000082422 67 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Cntn3Q07409 Mir201-201ENSMUST00000083470 66 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Cntn3Q07409 Vmn1r29-203ENSMUST00000227761 4671 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Cntn3Q07409 Vmn1r29-205ENSMUST00000228909 4658 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Cntn3Q07409 Olfr1153-202ENSMUST00000217436 2144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Cntn3Q07409 Pak3-205ENSMUST00000112868 8163 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Cntn3Q07409 Olfr1206-202ENSMUST00000216950 3303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Cntn3Q07409 Olfr800-202ENSMUST00000217094 3831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Cntn3Q07409 AC161250.2-201ENSMUST00000215114 3107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Cntn3Q07409 Zfp735-201ENSMUST00000080407 3746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Cntn3Q07409 Olfr896-ps1-202ENSMUST00000215219 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Cntn3Q07409 Gm23128-201ENSMUST00000104257 132 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Cntn3Q07409 Gm14567-201ENSMUST00000117155 174 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Cntn3Q07409 Gm13200-201ENSMUST00000138802 258 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Cntn3Q07409 Mir7242-201ENSMUST00000183710 79 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Cntn3Q07409 Gm27379-201ENSMUST00000183730 123 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Cntn3Q07409 Gm29604-201ENSMUST00000187176 163 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Cntn3Q07409 Gm38298-201ENSMUST00000193578 118 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Cntn3Q07409 Gm23128-202ENSMUST00000196578 133 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Cntn3Q07409 Gm42719-201ENSMUST00000197393 355 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Cntn3Q07409 Gm45791-201ENSMUST00000212908 352 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Cntn3Q07409 AC120540.2-201ENSMUST00000221716 387 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Cntn3Q07409 Gm8508-201ENSMUST00000061226 363 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Cntn3Q07409 Gm25797-201ENSMUST00000082640 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Cntn3Q07409 Gm44680-201ENSMUST00000208414 2910 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Cntn3Q07409 Gm22946-201ENSMUST00000158558 82 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Cntn3Q07409 Gm27330-201ENSMUST00000184689 132 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Cntn3Q07409 Gm9156-201ENSMUST00000189660 463 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Cntn3Q07409 Gm38407-201ENSMUST00000218017 474 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Cntn3Q07409 Zbtb37-203ENSMUST00000162226 18814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Cntn3Q07409 AC124456.1-201ENSMUST00000217391 2597 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Cntn3Q07409 Gm38706-201ENSMUST00000182397 2617 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Cntn3Q07409 Zfy2-201ENSMUST00000115891 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
Cntn3Q07409 Olfr1437-202ENSMUST00000207241 3751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Cntn3Q07409 Gm24068-201ENSMUST00000104513 132 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Cntn3Q07409 Mir293-201ENSMUST00000104841 80 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Cntn3Q07409 Gm24634-201ENSMUST00000158672 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Cntn3Q07409 Gm19257-201ENSMUST00000186121 183 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
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Cntn3Q07409 Gm44921-201ENSMUST00000205290 301 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Cntn3Q07409 Gm23847-201ENSMUST00000083829 110 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Cntn3Q07409 Olfr166-202ENSMUST00000213531 4205 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Cntn3Q07409 Olfr1225-202ENSMUST00000216961 3231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Cntn3Q07409 Gm26624-201ENSMUST00000181486 3769 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Cntn3Q07409 Traj30-201ENSMUST00000103711 59 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Cntn3Q07409 Gm24632-201ENSMUST00000122770 323 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Cntn3Q07409 Gm22338-201ENSMUST00000157715 129 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Cntn3Q07409 Gm25371-201ENSMUST00000158162 101 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Cntn3Q07409 Gm26157-201ENSMUST00000158974 126 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Cntn3Q07409 Gm23504-201ENSMUST00000158988 95 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Cntn3Q07409 Gm22858-201ENSMUST00000174972 76 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Cntn3Q07409 Gm25996-201ENSMUST00000175393 117 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Cntn3Q07409 Gm18665-201ENSMUST00000189783 270 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Cntn3Q07409 Gm37027-201ENSMUST00000194642 256 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
Cntn3Q07409 AC098718.1-201ENSMUST00000226166 175 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Cntn3Q07409 Muc16-204ENSMUST00000208663 25437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
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Cntn3Q07409 Gm24375-201ENSMUST00000104397 132 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Cntn3Q07409 Gm13136-201ENSMUST00000121031 2950 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Cntn3Q07409 Gm24291-201ENSMUST00000157633 162 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Cntn3Q07409 Mir6917-201ENSMUST00000184111 61 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Cntn3Q07409 Gm44358-201ENSMUST00000196301 98 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Cntn3Q07409 Gm23095-201ENSMUST00000083446 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Cntn3Q07409 Mirlet7f-2-201ENSMUST00000083668 83 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Cntn3Q07409 n-R5s183-201ENSMUST00000083939 115 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Cntn3Q07409 Nlrp9c-202ENSMUST00000085944 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
Cntn3Q07409 Skint5-203ENSMUST00000170105 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
Cntn3Q07409 Mir344c-201ENSMUST00000103919 92 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Cntn3Q07409 Gm3848-201ENSMUST00000136693 299 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
Cntn3Q07409 Gm25153-201ENSMUST00000157118 156 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Cntn3Q07409 Gm23090-201ENSMUST00000177331 78 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Cntn3Q07409 Gm26897-201ENSMUST00000180627 93 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Cntn3Q07409 Gm35736-201ENSMUST00000203681 313 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Cntn3Q07409 Gm44028-201ENSMUST00000205205 355 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Cntn3Q07409 n-R5s176-201ENSMUST00000082683 109 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Cntn3Q07409 Mir429-201ENSMUST00000083493 83 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Cntn3Q07409 Olfr229-202ENSMUST00000214904 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
Cntn3Q07409 Gpr174-201ENSMUST00000101294 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Cntn3Q07409 Gm11644-201ENSMUST00000119735 150 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Cntn3Q07409 Gm3788-201ENSMUST00000119949 136 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.2 ms