Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 AC167140.1-201ENSMUST00000224710 403 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Irx1P81068 Gm24204-201ENSMUST00000082950 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Irx1P81068 Mir151-201ENSMUST00000083678 68 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Irx1P81068 Mir374b-201ENSMUST00000102314 95 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Irx1P81068 Mir767-201ENSMUST00000103256 107 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Irx1P81068 Traj37-201ENSMUST00000103705 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.52□□□□□ -2.17
Irx1P81068 Gm14882-201ENSMUST00000117216 218 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Irx1P81068 Gm12797-201ENSMUST00000118645 273 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Irx1P81068 Gm23558-201ENSMUST00000157823 80 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Irx1P81068 Gm24392-201ENSMUST00000158136 103 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Irx1P81068 Gm23852-201ENSMUST00000158376 77 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Irx1P81068 Gm24667-201ENSMUST00000158938 103 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Irx1P81068 Gm25994-201ENSMUST00000175392 101 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Irx1P81068 Snora15-201ENSMUST00000177461 131 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Irx1P81068 Gm21064-202ENSMUST00000190583 278 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Irx1P81068 Gm18546-201ENSMUST00000197245 676 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Irx1P81068 Olfr375-ps1-201ENSMUST00000198131 249 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Irx1P81068 Gm42774-201ENSMUST00000198854 283 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Irx1P81068 AC164086.1-201ENSMUST00000221038 289 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Irx1P81068 CT030687.1-201ENSMUST00000221854 162 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Irx1P81068 1700019M22Rik-201ENSMUST00000073560 354 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Irx1P81068 Gm42862-201ENSMUST00000197494 2621 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Irx1P81068 Gm22195-201ENSMUST00000116861 108 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Irx1P81068 Gm14846-201ENSMUST00000121868 216 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Irx1P81068 Nell1os-202ENSMUST00000136672 491 ntTSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
Irx1P81068 Mir1949-201ENSMUST00000157434 141 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Irx1P81068 Gm22338-201ENSMUST00000157715 129 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Irx1P81068 Gm25333-201ENSMUST00000158035 246 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Irx1P81068 Gm25831-201ENSMUST00000158924 163 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Irx1P81068 Mir3086-201ENSMUST00000175072 87 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Irx1P81068 Gm24333-201ENSMUST00000175101 84 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Irx1P81068 Gm23047-201ENSMUST00000177661 94 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Irx1P81068 Gm25024-201ENSMUST00000179667 104 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Irx1P81068 Gm25235-201ENSMUST00000179933 107 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Irx1P81068 Gm37146-201ENSMUST00000192572 463 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
Irx1P81068 Gm42960-201ENSMUST00000202160 241 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Irx1P81068 Gm45859-201ENSMUST00000212794 214 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Irx1P81068 AC098718.2-201ENSMUST00000226822 285 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Irx1P81068 Rny1-201ENSMUST00000083767 112 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Irx1P81068 Gm43706-201ENSMUST00000198767 2652 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Irx1P81068 Gm43484-201ENSMUST00000198333 5966 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Irx1P81068 Mir881-201ENSMUST00000104844 78 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Irx1P81068 Gm12512-201ENSMUST00000119620 217 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Irx1P81068 Gm23172-201ENSMUST00000157160 124 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Irx1P81068 Gm23536-201ENSMUST00000157541 134 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Irx1P81068 Gm23090-201ENSMUST00000177331 78 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Irx1P81068 Gm21060-201ENSMUST00000179346 168 ntAPPRIS P1 BASIC1.5□□□□□ -2.17
Irx1P81068 Gm27402-201ENSMUST00000183890 120 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Irx1P81068 Defb50-201ENSMUST00000078879 373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
Irx1P81068 Mir320-201ENSMUST00000083594 82 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Irx1P81068 Zfp960-201ENSMUST00000127027 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
Irx1P81068 Gm26135-201ENSMUST00000101993 72 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Irx1P81068 Gm24440-201ENSMUST00000157236 63 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Irx1P81068 Gm22082-201ENSMUST00000157587 161 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Irx1P81068 Gm24902-201ENSMUST00000158126 123 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Irx1P81068 Gm26004-201ENSMUST00000158804 116 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Irx1P81068 Gm24512-201ENSMUST00000174963 65 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Irx1P81068 Snord50b-201ENSMUST00000178497 72 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Irx1P81068 Mir8116-201ENSMUST00000184134 97 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Irx1P81068 AL928567.1-201ENSMUST00000197891 138 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Irx1P81068 Gm35736-201ENSMUST00000203681 313 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Irx1P81068 Gm45456-201ENSMUST00000210841 243 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Irx1P81068 AC159896.1-201ENSMUST00000215264 215 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Irx1P81068 AC165293.1-201ENSMUST00000219669 329 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Irx1P81068 Mir181b-2-201ENSMUST00000083644 89 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Irx1P81068 AC161250.2-201ENSMUST00000215114 3107 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Irx1P81068 Igkv6-13-201ENSMUST00000103395 287 ntAPPRIS P1 BASIC1.48□□□□□ -2.17
Irx1P81068 Gm25541-201ENSMUST00000116888 126 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Irx1P81068 Gm12686-201ENSMUST00000120546 397 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Irx1P81068 Gm22097-201ENSMUST00000157929 278 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Irx1P81068 Gm24510-201ENSMUST00000174965 94 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Irx1P81068 Gm23267-201ENSMUST00000178490 132 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Irx1P81068 Gm23002-201ENSMUST00000179221 107 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Irx1P81068 Gm23714-201ENSMUST00000179259 105 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Irx1P81068 Gm28794-201ENSMUST00000185276 136 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Irx1P81068 Gm29022-201ENSMUST00000190702 225 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Irx1P81068 Gm44352-201ENSMUST00000196358 110 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Irx1P81068 AC132615.1-201ENSMUST00000213873 255 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Irx1P81068 Gm16976-205ENSMUST00000227324 226 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Irx1P81068 Mir429-201ENSMUST00000083493 83 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Irx1P81068 Olfr935-202ENSMUST00000214157 1693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
Irx1P81068 AC124456.1-201ENSMUST00000217391 2597 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Irx1P81068 Gm23705-201ENSMUST00000104370 130 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Irx1P81068 Gm14674-201ENSMUST00000117816 342 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Irx1P81068 Gm26150-201ENSMUST00000157426 151 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Irx1P81068 Gm27579-201ENSMUST00000158113 63 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Irx1P81068 Gm22768-201ENSMUST00000158366 153 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Irx1P81068 Gm26426-201ENSMUST00000177866 123 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Irx1P81068 Gm22510-201ENSMUST00000179304 79 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Irx1P81068 Gm26336-201ENSMUST00000179449 79 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Irx1P81068 Gm26390-201ENSMUST00000179628 79 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Irx1P81068 Gm26060-201ENSMUST00000180094 123 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Irx1P81068 Gm29347-201ENSMUST00000186695 449 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
Irx1P81068 Gm3333-201ENSMUST00000221637 452 ntTSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
Irx1P81068 AC173482.5-201ENSMUST00000224181 327 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Irx1P81068 Gpr174-202ENSMUST00000117310 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
Irx1P81068 Gm22935-201ENSMUST00000103960 104 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Irx1P81068 n-R5s187-201ENSMUST00000122769 111 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Irx1P81068 Gm10722-201ENSMUST00000151376 651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
Irx1P81068 Gm23219-201ENSMUST00000158123 87 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
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