Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 AC101945.1-201ENSMUST00000226734 466 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Sh3bp1P55194 Gm22248-201ENSMUST00000082482 150 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Sh3bp1P55194 Snora19-201ENSMUST00000082962 132 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Sh3bp1P55194 Gm23658-201ENSMUST00000083233 132 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Sh3bp1P55194 Gm25410-201ENSMUST00000083758 137 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Sh3bp1P55194 AC133934.2-201ENSMUST00000221729 4129 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Sh3bp1P55194 Vmn1r78-203ENSMUST00000228664 8100 ntAPPRIS P1 BASIC2.13□□□□□ -2.07
Sh3bp1P55194 Gm42664-201ENSMUST00000199417 3239 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Sh3bp1P55194 AC161250.2-201ENSMUST00000215114 3107 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Sh3bp1P55194 Gm23950-201ENSMUST00000104026 129 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Sh3bp1P55194 Gm24867-201ENSMUST00000104161 107 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Sh3bp1P55194 Gm6897-201ENSMUST00000117714 138 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Sh3bp1P55194 Gm14758-201ENSMUST00000119104 138 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Sh3bp1P55194 Gm14491-201ENSMUST00000121919 199 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Sh3bp1P55194 Gm25390-201ENSMUST00000157341 103 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Sh3bp1P55194 Gm26022-201ENSMUST00000158663 108 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Sh3bp1P55194 Mir8090-201ENSMUST00000185078 136 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Sh3bp1P55194 Eif4e-206ENSMUST00000200239 526 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
Sh3bp1P55194 Gm35736-201ENSMUST00000203681 313 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Sh3bp1P55194 Gm44853-201ENSMUST00000209070 250 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Sh3bp1P55194 Gm45456-201ENSMUST00000210841 243 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Sh3bp1P55194 Gm9805-201ENSMUST00000055305 171 ntAPPRIS P1 BASIC2.12□□□□□ -2.07
Sh3bp1P55194 Olfr1002-202ENSMUST00000215548 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
Sh3bp1P55194 Gm6444-201ENSMUST00000119611 458 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Sh3bp1P55194 Gm12771-201ENSMUST00000120246 135 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Sh3bp1P55194 Gm22603-201ENSMUST00000157603 96 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Sh3bp1P55194 Gm23090-201ENSMUST00000177331 78 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Sh3bp1P55194 Gm27476-201ENSMUST00000183366 104 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Sh3bp1P55194 Mir6901-201ENSMUST00000185062 62 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Sh3bp1P55194 Mir7021-201ENSMUST00000197026 63 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Sh3bp1P55194 Gm44320-201ENSMUST00000199276 86 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Sh3bp1P55194 Gm25204-201ENSMUST00000082843 106 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Sh3bp1P55194 Gm24805-201ENSMUST00000082931 104 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Sh3bp1P55194 Gm10719-202ENSMUST00000099049 675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
Sh3bp1P55194 Gm14674-201ENSMUST00000117816 342 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Sh3bp1P55194 Gm14838-201ENSMUST00000118913 248 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Sh3bp1P55194 n-R5s159-201ENSMUST00000122681 120 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Sh3bp1P55194 Gm16328-201ENSMUST00000126985 196 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Sh3bp1P55194 Gm25654-201ENSMUST00000158467 88 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Sh3bp1P55194 Gm24277-201ENSMUST00000158661 104 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Sh3bp1P55194 Gm24510-201ENSMUST00000174965 94 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Sh3bp1P55194 Mir7017-201ENSMUST00000184894 62 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Sh3bp1P55194 1700016B01Rik-201ENSMUST00000197688 270 ntTSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
Sh3bp1P55194 Gm43512-201ENSMUST00000198495 176 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Sh3bp1P55194 Olfr797-ps1-201ENSMUST00000203614 415 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Sh3bp1P55194 Gm22935-201ENSMUST00000103960 104 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Sh3bp1P55194 Gm11204-201ENSMUST00000122438 147 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Sh3bp1P55194 Gm24594-201ENSMUST00000122502 99 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Sh3bp1P55194 Gm26150-201ENSMUST00000157426 151 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Sh3bp1P55194 Gm24262-201ENSMUST00000157431 144 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Sh3bp1P55194 Mir1951-201ENSMUST00000157981 89 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Sh3bp1P55194 Gm45508-201ENSMUST00000209298 299 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Sh3bp1P55194 CU062626.2-201ENSMUST00000223953 274 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Sh3bp1P55194 Olfr948-202ENSMUST00000216132 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.08
Sh3bp1P55194 Olfr389-203ENSMUST00000215418 3417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
Sh3bp1P55194 AC124456.1-201ENSMUST00000217391 2597 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Sh3bp1P55194 Olfr1448-203ENSMUST00000213713 4336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
Sh3bp1P55194 Knl1-203ENSMUST00000099542 6525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
Sh3bp1P55194 Gm12080-201ENSMUST00000119821 1883 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Sh3bp1P55194 Gm26026-201ENSMUST00000122726 123 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Sh3bp1P55194 Mir1967-201ENSMUST00000157789 82 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Sh3bp1P55194 Gm25015-201ENSMUST00000158400 128 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Sh3bp1P55194 Gm24177-201ENSMUST00000158927 131 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Sh3bp1P55194 Gm22259-201ENSMUST00000178926 107 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Sh3bp1P55194 Gm44491-201ENSMUST00000196794 96 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Sh3bp1P55194 AC129085.5-201ENSMUST00000225468 400 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Sh3bp1P55194 Tcrg-V4-201ENSMUST00000103554 426 ntAPPRIS P1 BASIC2.07□□□□□ -2.08
Sh3bp1P55194 Snord19-201ENSMUST00000104609 76 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Sh3bp1P55194 Gm24478-201ENSMUST00000157439 158 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Sh3bp1P55194 Gm25491-201ENSMUST00000158733 308 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Sh3bp1P55194 Gm21903-201ENSMUST00000178039 90 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
Sh3bp1P55194 Gm22510-201ENSMUST00000179304 79 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Sh3bp1P55194 Gm26336-201ENSMUST00000179449 79 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Sh3bp1P55194 Gm26390-201ENSMUST00000179628 79 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Sh3bp1P55194 Gm28376-201ENSMUST00000186604 176 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
Sh3bp1P55194 AC125167.1-201ENSMUST00000198698 141 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Sh3bp1P55194 Gm42960-201ENSMUST00000202160 241 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Sh3bp1P55194 AC153964.2-201ENSMUST00000217704 2474 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Sh3bp1P55194 Gm24079-201ENSMUST00000104352 132 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Sh3bp1P55194 Gm23101-201ENSMUST00000157550 137 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Sh3bp1P55194 Gm25424-201ENSMUST00000157612 58 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Sh3bp1P55194 Gm26482-201ENSMUST00000158015 62 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Sh3bp1P55194 Gm27585-201ENSMUST00000183717 199 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Sh3bp1P55194 Gm37746-201ENSMUST00000193249 198 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Sh3bp1P55194 Gm6105-201ENSMUST00000200580 624 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Sh3bp1P55194 Gm20005-201ENSMUST00000202583 299 ntTSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
Sh3bp1P55194 Gm24536-201ENSMUST00000083144 107 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Sh3bp1P55194 Gm22744-201ENSMUST00000083444 65 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Sh3bp1P55194 AC164629.4-201ENSMUST00000218505 3247 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Sh3bp1P55194 Olfr790-202ENSMUST00000203966 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
Sh3bp1P55194 Vmn1r75-204ENSMUST00000227611 4336 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
Sh3bp1P55194 Gm23011-201ENSMUST00000104148 132 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Sh3bp1P55194 Gm10563-201ENSMUST00000115821 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
Sh3bp1P55194 Gm25541-201ENSMUST00000116888 126 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Sh3bp1P55194 Gm25783-201ENSMUST00000122525 190 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Sh3bp1P55194 Gm24632-201ENSMUST00000122770 323 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Sh3bp1P55194 Gm23545-201ENSMUST00000158205 104 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Sh3bp1P55194 Mir7026-201ENSMUST00000184384 67 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Sh3bp1P55194 Gm3333-201ENSMUST00000221637 452 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
Sh3bp1P55194 Gm42862-201ENSMUST00000197494 2621 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
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