Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

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Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Snord53-201ENSMUST00000175146 78 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
VdrP48281 Mir3965-201ENSMUST00000175570 69 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
VdrP48281 Gm27722-201ENSMUST00000183908 76 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
VdrP48281 Mir6916-201ENSMUST00000184514 63 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
VdrP48281 Gm43021-201ENSMUST00000198692 337 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
VdrP48281 AC126691.1-201ENSMUST00000226534 202 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
VdrP48281 Gm24412-201ENSMUST00000083426 109 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
VdrP48281 Tlr7-202ENSMUST00000112161 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
VdrP48281 Gpr174-201ENSMUST00000101294 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
VdrP48281 Gm22674-201ENSMUST00000104413 131 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
VdrP48281 Gm24907-201ENSMUST00000116932 128 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
VdrP48281 Gm14567-201ENSMUST00000117155 174 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
VdrP48281 Gm22554-201ENSMUST00000157798 147 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
VdrP48281 Gm22163-201ENSMUST00000158408 135 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
VdrP48281 Gm25368-201ENSMUST00000158847 131 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
VdrP48281 Snord93-201ENSMUST00000175580 71 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
VdrP48281 Ighv15-1-201ENSMUST00000194450 276 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
VdrP48281 AC167721.1-201ENSMUST00000217088 279 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
VdrP48281 Gm30534-201ENSMUST00000217928 207 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
VdrP48281 Gm22306-201ENSMUST00000082692 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
VdrP48281 Snora3-201ENSMUST00000083082 132 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
VdrP48281 Snora33-201ENSMUST00000093556 129 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
VdrP48281 Tex16-201ENSMUST00000038546 3972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
VdrP48281 Zfp638-212ENSMUST00000203891 3968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
VdrP48281 Gm25466-201ENSMUST00000103995 132 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
VdrP48281 Gm24171-201ENSMUST00000104126 131 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
VdrP48281 Gm13246-201ENSMUST00000120994 315 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
VdrP48281 Gm22651-201ENSMUST00000157872 94 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
VdrP48281 Gm23033-201ENSMUST00000157996 134 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
VdrP48281 Gm17020-201ENSMUST00000172274 274 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
VdrP48281 Mir6353-201ENSMUST00000183596 113 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
VdrP48281 Gm42623-201ENSMUST00000197225 379 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
VdrP48281 AC129202.1-201ENSMUST00000224895 526 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
VdrP48281 Gm25697-201ENSMUST00000082902 98 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
VdrP48281 Olfr124-204ENSMUST00000217365 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
VdrP48281 Olfr1162-202ENSMUST00000183862 4800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
VdrP48281 Olfr791-202ENSMUST00000217228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
VdrP48281 Gm15391-201ENSMUST00000147509 257 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
VdrP48281 Gm24475-201ENSMUST00000157435 143 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
VdrP48281 Gm37557-201ENSMUST00000191640 139 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
VdrP48281 Gm2511-201ENSMUST00000205521 457 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
VdrP48281 CAAA01090905.1-201ENSMUST00000219056 426 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
VdrP48281 AC153646.2-201ENSMUST00000220516 109 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
VdrP48281 AC120540.2-201ENSMUST00000221716 387 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
VdrP48281 AC151902.2-201ENSMUST00000226419 301 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
VdrP48281 Gm24044-201ENSMUST00000083107 156 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
VdrP48281 Gm22738-201ENSMUST00000083440 147 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
VdrP48281 Olfr394-203ENSMUST00000216608 5628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
VdrP48281 Olfr1193-202ENSMUST00000213893 3519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
VdrP48281 Gm26339-201ENSMUST00000102368 99 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
VdrP48281 Gm25113-201ENSMUST00000157185 143 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
VdrP48281 Gm19257-201ENSMUST00000186121 183 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
VdrP48281 Gm36551-201ENSMUST00000196787 300 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
VdrP48281 Gm42988-201ENSMUST00000198116 225 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
VdrP48281 Igkv13-78-1-201ENSMUST00000199298 200 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
VdrP48281 Trav5-2-201ENSMUST00000199855 280 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
VdrP48281 Gm44966-201ENSMUST00000208096 157 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
VdrP48281 AC152979.2-201ENSMUST00000219702 3814 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
VdrP48281 Gm24474-201ENSMUST00000220504 469 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
VdrP48281 AC124537.1-201ENSMUST00000222890 159 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
VdrP48281 Olfr394-202ENSMUST00000214284 5562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
VdrP48281 Zfp729b-201ENSMUST00000012873 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
VdrP48281 Gm42445-201ENSMUST00000196996 2893 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
VdrP48281 Olfr509-202ENSMUST00000213756 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
VdrP48281 Gm16021-201ENSMUST00000121176 219 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
VdrP48281 Gm25828-201ENSMUST00000157087 95 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
VdrP48281 Gm24958-201ENSMUST00000158009 97 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
VdrP48281 Mir3092-201ENSMUST00000174954 96 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
VdrP48281 Mir107-201ENSMUST00000083660 87 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
VdrP48281 Olfr65-203ENSMUST00000214300 2855 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
VdrP48281 Olfr1161-203ENSMUST00000217006 3647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
VdrP48281 Zfp966-201ENSMUST00000108949 2939 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
VdrP48281 Olfr1442-203ENSMUST00000208494 3593 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
VdrP48281 Gm24263-201ENSMUST00000104059 107 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
VdrP48281 Gm23320-201ENSMUST00000104462 127 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
VdrP48281 Rhox11-ps3-201ENSMUST00000121166 233 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
VdrP48281 Gm24443-201ENSMUST00000157242 132 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
VdrP48281 Gm22967-201ENSMUST00000157956 239 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
VdrP48281 Gm25558-201ENSMUST00000158083 106 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
VdrP48281 Gm22612-201ENSMUST00000158293 101 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
VdrP48281 Gm26214-201ENSMUST00000158581 107 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
VdrP48281 Gm16584-201ENSMUST00000159267 189 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
VdrP48281 Gm27532-201ENSMUST00000183726 113 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
VdrP48281 Gm28669-201ENSMUST00000188400 100 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
VdrP48281 Gm44859-201ENSMUST00000207831 94 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
VdrP48281 Gm44938-201ENSMUST00000208614 427 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
VdrP48281 AC171206.2-201ENSMUST00000215252 389 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
VdrP48281 Gm23847-201ENSMUST00000083829 110 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
VdrP48281 Olfr1253-203ENSMUST00000215185 4984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
VdrP48281 Olfr623-202ENSMUST00000213840 3980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
VdrP48281 Olfr592-202ENSMUST00000106893 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
VdrP48281 N4bp2l2-201ENSMUST00000118316 8982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
VdrP48281 Traj44-201ENSMUST00000103698 61 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
VdrP48281 Gm23772-201ENSMUST00000104433 102 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
VdrP48281 Gm15272-201ENSMUST00000120865 233 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
VdrP48281 Gm22946-201ENSMUST00000158558 82 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
VdrP48281 Gm44325-201ENSMUST00000196757 77 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
VdrP48281 AL627387.1-201ENSMUST00000226063 250 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
VdrP48281 8030445P17Rik-201ENSMUST00000192614 2741 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
VdrP48281 Vmn1r76-203ENSMUST00000226947 8145 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
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