Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Olfr1098-202ENSMUST00000111574 2885 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
RxraP28700 Gm26077-201ENSMUST00000104064 123 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
RxraP28700 Gm23841-201ENSMUST00000116951 114 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
RxraP28700 Gm22217-201ENSMUST00000157556 313 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
RxraP28700 Gm23901-201ENSMUST00000157570 107 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
RxraP28700 Gm23182-201ENSMUST00000158688 135 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
RxraP28700 Gm17113-201ENSMUST00000170118 171 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
RxraP28700 AC098718.1-201ENSMUST00000226166 175 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
RxraP28700 AC149294.9-201ENSMUST00000227256 164 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
RxraP28700 Mir181b-2-201ENSMUST00000083644 89 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
RxraP28700 Gm23951-201ENSMUST00000104029 132 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
RxraP28700 Gm23011-201ENSMUST00000104148 132 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
RxraP28700 Gm12797-201ENSMUST00000118645 273 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
RxraP28700 Gm23172-201ENSMUST00000157160 124 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
RxraP28700 Gm22097-201ENSMUST00000157929 278 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
RxraP28700 Gm23892-201ENSMUST00000158105 130 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
RxraP28700 Gm23219-201ENSMUST00000158123 87 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
RxraP28700 Gm21903-201ENSMUST00000178039 90 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
RxraP28700 Gm25730-201ENSMUST00000178753 165 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
RxraP28700 Gm27443-201ENSMUST00000184660 98 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
RxraP28700 Gm23370-201ENSMUST00000199545 130 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
RxraP28700 Gm6105-201ENSMUST00000200580 624 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
RxraP28700 AC126672.1-201ENSMUST00000217096 396 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
RxraP28700 CT954323.1-201ENSMUST00000222774 229 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
RxraP28700 Gm25401-201ENSMUST00000082975 106 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
RxraP28700 Mir155-201ENSMUST00000083463 65 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
RxraP28700 Gm43753-201ENSMUST00000196539 3309 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RxraP28700 Mir541-201ENSMUST00000102097 90 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RxraP28700 Gm16328-201ENSMUST00000126985 196 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RxraP28700 Gm15611-201ENSMUST00000146928 406 ntTSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
RxraP28700 U6.1-201ENSMUST00000157443 101 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RxraP28700 Gm23864-201ENSMUST00000177607 107 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RxraP28700 Gm7258-201ENSMUST00000179317 300 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RxraP28700 Gm27511-201ENSMUST00000183502 127 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RxraP28700 Mir6481-201ENSMUST00000184617 110 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RxraP28700 Gm19123-201ENSMUST00000190716 651 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RxraP28700 5430435K18Rik-201ENSMUST00000202597 661 ntTSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
RxraP28700 AC144671.1-201ENSMUST00000215265 99 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RxraP28700 Gm26225-201ENSMUST00000082508 135 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RxraP28700 Snora3-201ENSMUST00000083082 132 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RxraP28700 Mir222-201ENSMUST00000083537 79 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RxraP28700 Gm10217-201ENSMUST00000088080 135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
RxraP28700 Traj37-201ENSMUST00000103705 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.93□□□□□ -2.1
RxraP28700 Gm15162-201ENSMUST00000119325 283 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
RxraP28700 Gm14709-201ENSMUST00000121225 304 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
RxraP28700 Gm23656-201ENSMUST00000122626 112 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
RxraP28700 Gm10722-201ENSMUST00000151376 651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
RxraP28700 Gm22259-201ENSMUST00000178926 107 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
RxraP28700 Gm23002-201ENSMUST00000179221 107 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
RxraP28700 Gm29262-201ENSMUST00000190084 196 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
RxraP28700 Gm20005-201ENSMUST00000202583 299 ntTSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
RxraP28700 AC159896.1-201ENSMUST00000215264 215 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
RxraP28700 Gm23100-201ENSMUST00000083455 141 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
RxraP28700 G2e3-203ENSMUST00000121521 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
RxraP28700 Gm26339-201ENSMUST00000102368 99 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
RxraP28700 Gm22145-201ENSMUST00000157396 148 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
RxraP28700 Mir6379-201ENSMUST00000183392 115 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
RxraP28700 Gm38255-201ENSMUST00000194910 2996 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
RxraP28700 Gm45508-201ENSMUST00000209298 299 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
RxraP28700 AC157476.1-201ENSMUST00000215555 169 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
RxraP28700 Snora19-201ENSMUST00000082962 132 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
RxraP28700 Gm23658-201ENSMUST00000083233 132 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
RxraP28700 Gm42862-201ENSMUST00000197494 2621 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
RxraP28700 Gm22279-201ENSMUST00000157200 93 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
RxraP28700 Gm24006-201ENSMUST00000158462 132 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
RxraP28700 Gm2962-201ENSMUST00000159266 336 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
RxraP28700 Gm17215-201ENSMUST00000170074 277 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
RxraP28700 Mir6950-201ENSMUST00000184438 73 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
RxraP28700 Mir7009-201ENSMUST00000184519 64 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
RxraP28700 Gm29022-201ENSMUST00000190702 225 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
RxraP28700 Olfr797-ps1-201ENSMUST00000203614 415 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
RxraP28700 Gm19855-201ENSMUST00000210145 249 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
RxraP28700 Selenok-ps5-201ENSMUST00000221048 278 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
RxraP28700 Mir322-201ENSMUST00000083484 95 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
RxraP28700 Catsperb-201ENSMUST00000055156 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
RxraP28700 Mir466h-201ENSMUST00000104748 81 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
RxraP28700 Gm13560-201ENSMUST00000121865 329 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
RxraP28700 Gm25720-201ENSMUST00000157503 105 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
RxraP28700 Gm25914-201ENSMUST00000157618 153 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
RxraP28700 Gm23545-201ENSMUST00000158205 104 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
RxraP28700 Mir6901-201ENSMUST00000185062 62 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
RxraP28700 Gm43563-201ENSMUST00000196761 198 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
RxraP28700 Gm24151-201ENSMUST00000082758 141 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
RxraP28700 Gm24457-201ENSMUST00000083196 105 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
RxraP28700 Gm12080-201ENSMUST00000119821 1883 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
RxraP28700 Vmn2r69-201ENSMUST00000171213 2553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
RxraP28700 Gm24867-201ENSMUST00000104161 107 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
RxraP28700 Gm14838-201ENSMUST00000118913 248 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
RxraP28700 Gm25654-201ENSMUST00000158467 88 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
RxraP28700 Mir6406-201ENSMUST00000183592 120 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
RxraP28700 Gm27803-201ENSMUST00000183763 119 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
RxraP28700 Mir7017-201ENSMUST00000184894 62 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
RxraP28700 Gm28912-201ENSMUST00000189001 234 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
RxraP28700 Igkv14-118-1-201ENSMUST00000198645 334 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
RxraP28700 Gm22169-201ENSMUST00000083229 107 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
RxraP28700 Gm21876-201ENSMUST00000096511 282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
RxraP28700 Gm25090-201ENSMUST00000104000 132 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RxraP28700 Gm24594-201ENSMUST00000122502 99 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RxraP28700 Gm24478-201ENSMUST00000157439 158 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RxraP28700 Gm23101-201ENSMUST00000157550 137 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
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