Protein–RNA interactions for Protein: P23813

Hoxd11, Homeobox protein Hox-D11, mousemouse

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Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd11P23813 Gm23300-201ENSMUST00000082712 125 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxd11P23813 Mir29c-201ENSMUST00000083614 88 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxd11P23813 Vmn1r82-201ENSMUST00000072801 4784 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxd11P23813 Olfr984-203ENSMUST00000214856 5025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxd11P23813 Nop58-215ENSMUST00000191142 9507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxd11P23813 Mtx3-201ENSMUST00000076169 6275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxd11P23813 Gm19965-201ENSMUST00000179777 3030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxd11P23813 Fam46d-201ENSMUST00000101292 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxd11P23813 Vwc2l-203ENSMUST00000161937 4323 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxd11P23813 Gm43268-201ENSMUST00000201536 4055 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxd11P23813 Gm13868-201ENSMUST00000122411 294 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxd11P23813 Gm24850-201ENSMUST00000158029 119 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxd11P23813 Mir3471-1-201ENSMUST00000175139 131 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxd11P23813 Gm36776-201ENSMUST00000207006 203 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxd11P23813 Gm14295-202ENSMUST00000132883 2505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxd11P23813 Syt14-205ENSMUST00000215093 9274 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxd11P23813 Gm20826-202ENSMUST00000185348 4605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxd11P23813 Adgb-205ENSMUST00000179956 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxd11P23813 Vmn1r6-202ENSMUST00000226689 8453 ntAPPRIS P2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxd11P23813 Cntnap5c-201ENSMUST00000076038 3931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxd11P23813 Tet2-201ENSMUST00000098603 9179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxd11P23813 Calcrl-202ENSMUST00000099944 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxd11P23813 CT009754.3-201ENSMUST00000220739 3661 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxd11P23813 Iqub-201ENSMUST00000052277 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxd11P23813 Mir1934-201ENSMUST00000158127 83 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxd11P23813 Gm25835-201ENSMUST00000158917 144 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxd11P23813 Gm28358-202ENSMUST00000189292 223 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxd11P23813 Gm44602-201ENSMUST00000205948 132 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxd11P23813 Gm23686-201ENSMUST00000083241 164 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxd11P23813 Gm43753-201ENSMUST00000196539 3309 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxd11P23813 Ppm1k-201ENSMUST00000042766 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Hoxd11P23813 CT009733.2-202ENSMUST00000224171 4748 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Hoxd11P23813 Bclaf1-201ENSMUST00000043881 5437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Hoxd11P23813 Olfr1123-203ENSMUST00000216208 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Hoxd11P23813 Mdn1-211ENSMUST00000178134 17959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Hoxd11P23813 Gm12185-201ENSMUST00000059930 5252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Hoxd11P23813 Scarna9-201ENSMUST00000104318 70 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Hoxd11P23813 Gm6985-201ENSMUST00000121255 271 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Hoxd11P23813 Gm37998-201ENSMUST00000195699 166 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Hoxd11P23813 Gm25357-201ENSMUST00000082745 72 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Hoxd11P23813 Gm22127-201ENSMUST00000083239 106 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Hoxd11P23813 Herc2-202ENSMUST00000164095 15261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Hoxd11P23813 Acer3-201ENSMUST00000033020 11340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Hoxd11P23813 Atr-213ENSMUST00000215311 8102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Hoxd11P23813 Samd12-201ENSMUST00000078673 9019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Hoxd11P23813 Ryr3-204ENSMUST00000134358 14958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Hoxd11P23813 Gm14062-201ENSMUST00000134795 4134 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Hoxd11P23813 Gm23697-201ENSMUST00000103897 110 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Hoxd11P23813 Gm22717-201ENSMUST00000122703 171 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Hoxd11P23813 Gm22551-201ENSMUST00000157795 103 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Hoxd11P23813 Gm28383-201ENSMUST00000187563 139 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Hoxd11P23813 Gm25820-201ENSMUST00000198589 127 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Hoxd11P23813 Gm45392-201ENSMUST00000210441 214 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Hoxd11P23813 Olfr394-202ENSMUST00000214284 5562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Hoxd11P23813 Gria2-201ENSMUST00000075316 10371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Hoxd11P23813 Olfr769-202ENSMUST00000215453 4143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Hoxd11P23813 Olfr1118-202ENSMUST00000216396 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Hoxd11P23813 Olfr805-204ENSMUST00000217219 3314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd11P23813 Olfr948-202ENSMUST00000216132 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd11P23813 Csrnp3-204ENSMUST00000122912 10672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd11P23813 Gm15737-201ENSMUST00000113434 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd11P23813 Kmt2d-202ENSMUST00000178486 19805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd11P23813 Gm27582-201ENSMUST00000184084 126 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd11P23813 Gm28862-201ENSMUST00000188246 163 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd11P23813 Gm23370-201ENSMUST00000199545 130 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd11P23813 AC164612.2-202ENSMUST00000216314 253 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd11P23813 Gm22245-201ENSMUST00000082479 103 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd11P23813 Olfr17-202ENSMUST00000210568 3666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd11P23813 Abcc9-203ENSMUST00000100827 7306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd11P23813 Olfr586-204ENSMUST00000215304 6169 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd11P23813 Olfr1309-205ENSMUST00000216948 5168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd11P23813 AC121870.1-201ENSMUST00000216279 4879 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd11P23813 Usp29-204ENSMUST00000200535 7540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxd11P23813 Ehf-201ENSMUST00000090475 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxd11P23813 Pak3-201ENSMUST00000033640 8348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxd11P23813 Zfp966-201ENSMUST00000108949 2939 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxd11P23813 Olfr1438-ps1-201ENSMUST00000208398 4761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxd11P23813 Gm4631-202ENSMUST00000121393 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxd11P23813 Gm11356-201ENSMUST00000118974 192 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxd11P23813 Gm24727-201ENSMUST00000158231 144 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxd11P23813 Gm24668-201ENSMUST00000158935 104 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxd11P23813 Nfia-204ENSMUST00000107057 8913 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxd11P23813 Vmn1r51-205ENSMUST00000227109 4214 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxd11P23813 Vmn1r219-203ENSMUST00000227388 7948 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxd11P23813 Tet1-206ENSMUST00000174189 14369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxd11P23813 Olfr1273-ps-201ENSMUST00000214356 4698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Hoxd11P23813 Gm25105-201ENSMUST00000122477 130 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Hoxd11P23813 Gm24949-201ENSMUST00000183609 215 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Hoxd11P23813 Gm33424-201ENSMUST00000222317 257 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Hoxd11P23813 Gm24313-201ENSMUST00000082561 133 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Hoxd11P23813 Gm25800-201ENSMUST00000082636 134 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Hoxd11P23813 Snord7-201ENSMUST00000083781 97 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Hoxd11P23813 Vmn1r75-205ENSMUST00000228268 4376 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Hoxd11P23813 Heph-202ENSMUST00000079322 3904 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
Hoxd11P23813 Dnah3-204ENSMUST00000209154 12265 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Hoxd11P23813 Atp1b4-202ENSMUST00000115134 4189 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Hoxd11P23813 Xpo7-202ENSMUST00000167242 15121 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Hoxd11P23813 Gm44842-201ENSMUST00000209173 3372 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Hoxd11P23813 Gm23791-201ENSMUST00000122553 293 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Hoxd11P23813 n-R5s15-201ENSMUST00000122635 111 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.7 ms