Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Gm20391-201ENSMUST00000174722 106 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
Ggta1P23336 Gm25314-201ENSMUST00000178810 79 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
Ggta1P23336 Mir7039-201ENSMUST00000183852 85 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
Ggta1P23336 Gm29014-201ENSMUST00000191422 326 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
Ggta1P23336 Gm37997-201ENSMUST00000193515 267 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
Ggta1P23336 Mir468-201ENSMUST00000197332 78 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
Ggta1P23336 Gm44465-201ENSMUST00000199536 114 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
Ggta1P23336 Gm45402-201ENSMUST00000211796 223 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
Ggta1P23336 Gm16032-201ENSMUST00000118534 168 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
Ggta1P23336 Gm15379-201ENSMUST00000121224 648 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
Ggta1P23336 Gm25643-201ENSMUST00000158874 103 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
Ggta1P23336 Trgj4-201ENSMUST00000184430 61 ntAPPRIS P1 BASIC0.38□□□□□ -2.35
Ggta1P23336 Gm20257-202ENSMUST00000188643 130 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
Ggta1P23336 Gm43432-201ENSMUST00000196352 121 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
Ggta1P23336 Gm33654-201ENSMUST00000221704 215 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
Ggta1P23336 AC110380.1-201ENSMUST00000226987 389 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
Ggta1P23336 AC160115.1-201ENSMUST00000224678 1574 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
Ggta1P23336 Gm22759-201ENSMUST00000102276 96 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
Ggta1P23336 Trgj3-201ENSMUST00000103562 60 ntAPPRIS P1 BASIC0.37□□□□□ -2.35
Ggta1P23336 Gm15632-201ENSMUST00000135936 246 ntTSL 1 (best) BASIC0.37□□□□□ -2.35
Ggta1P23336 AI847159-201ENSMUST00000137728 305 ntTSL 2 BASIC0.37□□□□□ -2.35
Ggta1P23336 Gm25559-201ENSMUST00000157182 74 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
Ggta1P23336 Gm22914-201ENSMUST00000175195 77 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
Ggta1P23336 Gm25284-201ENSMUST00000180345 141 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
Ggta1P23336 Gm27289-201ENSMUST00000183341 82 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
Ggta1P23336 Gm43487-201ENSMUST00000200331 1031 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
Ggta1P23336 Gm42857-201ENSMUST00000200823 339 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
Ggta1P23336 Gm45119-201ENSMUST00000207612 199 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
Ggta1P23336 AC122298.1-201ENSMUST00000222574 165 ntTSL 5 BASIC0.37□□□□□ -2.35
Ggta1P23336 2210407C18Rik-201ENSMUST00000048801 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.37□□□□□ -2.35
Ggta1P23336 Gm20939-201ENSMUST00000108007 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.36□□□□□ -2.35
Ggta1P23336 Olfr872-201ENSMUST00000086474 1897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.36□□□□□ -2.35
Ggta1P23336 Gm14392-201ENSMUST00000120332 401 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
Ggta1P23336 Mup-ps22-201ENSMUST00000121611 243 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
Ggta1P23336 Gm14413-201ENSMUST00000122158 408 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
Ggta1P23336 Gm12068-201ENSMUST00000153153 376 ntTSL 3 BASIC0.36□□□□□ -2.35
Ggta1P23336 Gm23672-201ENSMUST00000157471 107 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
Ggta1P23336 Gm22945-201ENSMUST00000158557 157 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
Ggta1P23336 Gm44726-201ENSMUST00000203427 217 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
Ggta1P23336 Gm45704-201ENSMUST00000212582 403 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
Ggta1P23336 Gm22809-201ENSMUST00000082743 156 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
Ggta1P23336 Gm26164-201ENSMUST00000083793 104 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
Ggta1P23336 Gm26135-201ENSMUST00000101993 72 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
Ggta1P23336 Gm11386-201ENSMUST00000117761 347 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
Ggta1P23336 Gm14884-201ENSMUST00000120456 196 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
Ggta1P23336 Gm25825-201ENSMUST00000157091 124 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
Ggta1P23336 Snord50b-201ENSMUST00000178497 72 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
Ggta1P23336 Olfr1435-ps1-201ENSMUST00000207773 249 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
Ggta1P23336 AC113441.1-201ENSMUST00000223464 134 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
Ggta1P23336 AC129208.2-201ENSMUST00000228506 320 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
Ggta1P23336 Mir34a-201ENSMUST00000083559 102 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
Ggta1P23336 Mir200b-201ENSMUST00000083615 70 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
Ggta1P23336 Gm25416-201ENSMUST00000104221 107 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
Ggta1P23336 Mir654-201ENSMUST00000104787 84 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
Ggta1P23336 Gm14293-201ENSMUST00000118528 577 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
Ggta1P23336 Gm25968-201ENSMUST00000157167 100 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
Ggta1P23336 Gm22888-201ENSMUST00000158640 77 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
Ggta1P23336 Mir7j-201ENSMUST00000184427 122 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
Ggta1P23336 Gm10717-205ENSMUST00000177601 645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.33□□□□□ -2.36
Ggta1P23336 Gm21060-201ENSMUST00000179346 168 ntAPPRIS P1 BASIC0.33□□□□□ -2.36
Ggta1P23336 Gm23379-201ENSMUST00000180026 107 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
Ggta1P23336 Il6st-202ENSMUST00000183513 201 ntTSL 5 BASIC0.33□□□□□ -2.36
Ggta1P23336 Mir6389-201ENSMUST00000183661 102 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
Ggta1P23336 Gm6657-203ENSMUST00000188791 531 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.33□□□□□ -2.36
Ggta1P23336 Gm29276-201ENSMUST00000190453 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.33□□□□□ -2.36
Ggta1P23336 Gm44462-201ENSMUST00000199696 129 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
Ggta1P23336 Vmn1r230-201ENSMUST00000053974 951 ntAPPRIS P1 BASIC0.33□□□□□ -2.36
Ggta1P23336 Mir465b-1-201ENSMUST00000103940 79 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
Ggta1P23336 Mir465b-2-201ENSMUST00000104662 79 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
Ggta1P23336 Gm14491-201ENSMUST00000121919 199 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
Ggta1P23336 Gm14773-201ENSMUST00000125932 451 ntTSL 2 BASIC0.32□□□□□ -2.36
Ggta1P23336 Gm24818-201ENSMUST00000175093 161 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
Ggta1P23336 Gm25949-201ENSMUST00000175333 114 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
Ggta1P23336 Gm26116-201ENSMUST00000175600 77 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
Ggta1P23336 Gm28597-201ENSMUST00000187664 666 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
Ggta1P23336 Gm44828-201ENSMUST00000203745 106 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
Ggta1P23336 Gm44948-201ENSMUST00000209050 149 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
Ggta1P23336 Gm45543-201ENSMUST00000209327 88 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
Ggta1P23336 Gm25579-201ENSMUST00000083407 106 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
Ggta1P23336 Gm23097-201ENSMUST00000083448 105 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
Ggta1P23336 Gm24283-201ENSMUST00000104233 107 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
Ggta1P23336 Gm23126-201ENSMUST00000104260 134 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
Ggta1P23336 Mir880-201ENSMUST00000104809 78 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
Ggta1P23336 Gm14761-201ENSMUST00000121363 262 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
Ggta1P23336 Gm18291-201ENSMUST00000190791 301 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
Ggta1P23336 AC116589.3-202ENSMUST00000221770 649 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
Ggta1P23336 AC116589.6-201ENSMUST00000222252 649 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
Ggta1P23336 AC114916.1-201ENSMUST00000228465 494 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
Ggta1P23336 Gm23969-201ENSMUST00000083324 74 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
Ggta1P23336 Olfr1154-203ENSMUST00000215862 2624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.3□□□□□ -2.36
Ggta1P23336 Gm22656-201ENSMUST00000104199 171 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
Ggta1P23336 Gm14946-201ENSMUST00000119859 296 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
Ggta1P23336 Gm6272-201ENSMUST00000121256 171 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
Ggta1P23336 Gm25393-201ENSMUST00000157336 285 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
Ggta1P23336 Gm24963-201ENSMUST00000157916 144 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
Ggta1P23336 Gm22200-201ENSMUST00000158614 67 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
Ggta1P23336 Gm25838-201ENSMUST00000158920 120 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
Ggta1P23336 Gm16546-201ENSMUST00000159442 355 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
Ggta1P23336 Gm44052-201ENSMUST00000203382 396 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
Ggta1P23336 Mir32-201ENSMUST00000083610 70 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.5 ms