Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Gm44325-201ENSMUST00000196757 77 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Ccl20O89093 Olfr1366-204ENSMUST00000218154 1054 ntAPPRIS P2 BASIC0.98□□□□□ -2.25
Ccl20O89093 Snord14a-201ENSMUST00000082807 87 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Ccl20O89093 Mir181a-2-201ENSMUST00000083489 76 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Ccl20O89093 Gm6377-201ENSMUST00000060013 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.97□□□□□ -2.25
Ccl20O89093 Gm25068-201ENSMUST00000103895 110 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Ccl20O89093 Gm23951-201ENSMUST00000104029 132 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Ccl20O89093 Gm14491-201ENSMUST00000121919 199 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Ccl20O89093 Gm15214-201ENSMUST00000122155 470 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Ccl20O89093 Gm23982-201ENSMUST00000157141 106 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Ccl20O89093 Traj60-201ENSMUST00000167781 54 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Ccl20O89093 Mir7225-201ENSMUST00000184178 54 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Ccl20O89093 Gm38060-201ENSMUST00000194822 464 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Ccl20O89093 Gm42719-201ENSMUST00000197393 355 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Ccl20O89093 Gm18617-201ENSMUST00000222311 259 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Ccl20O89093 Gm22248-201ENSMUST00000082482 150 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Ccl20O89093 Gm22571-201ENSMUST00000082984 70 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Ccl20O89093 Gm24261-201ENSMUST00000083744 104 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Ccl20O89093 Gm14917-201ENSMUST00000118872 2105 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Ccl20O89093 Gm23336-201ENSMUST00000117023 123 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Ccl20O89093 Gm11857-201ENSMUST00000119817 324 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Ccl20O89093 Rhox11-ps3-201ENSMUST00000121166 233 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Ccl20O89093 Gm22984-201ENSMUST00000122751 122 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Ccl20O89093 Gm22559-201ENSMUST00000157329 134 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Ccl20O89093 Gm25392-201ENSMUST00000157335 297 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Ccl20O89093 Gm23277-201ENSMUST00000157914 136 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Ccl20O89093 Gm22099-201ENSMUST00000157925 123 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Ccl20O89093 Gm24638-201ENSMUST00000179807 132 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Ccl20O89093 Gm43406-201ENSMUST00000200356 334 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Ccl20O89093 Gm36546-201ENSMUST00000206372 230 ntTSL 5 BASIC0.96□□□□□ -2.26
Ccl20O89093 AC157476.1-201ENSMUST00000215555 169 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Ccl20O89093 Gm40604-202ENSMUST00000219541 522 ntTSL 5 BASIC0.96□□□□□ -2.26
Ccl20O89093 CT025630.1-201ENSMUST00000227901 172 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Ccl20O89093 Gm24204-201ENSMUST00000082950 107 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Ccl20O89093 Gm24764-201ENSMUST00000083686 199 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Ccl20O89093 Olfr1225-203ENSMUST00000217054 5517 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.95□□□□□ -2.26
Ccl20O89093 Mir653-201ENSMUST00000102402 85 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Ccl20O89093 Gm25832-201ENSMUST00000104140 130 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Ccl20O89093 Gm22545-201ENSMUST00000104350 132 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Ccl20O89093 Gm23705-201ENSMUST00000104370 130 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Ccl20O89093 Gm22216-201ENSMUST00000157557 114 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Ccl20O89093 Gm22862-201ENSMUST00000178593 121 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Ccl20O89093 Gm27419-201ENSMUST00000184576 109 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Ccl20O89093 Gm6105-201ENSMUST00000200580 624 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Ccl20O89093 CT025689.3-201ENSMUST00000223817 301 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Ccl20O89093 Olfr183-201ENSMUST00000073320 2040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.94□□□□□ -2.26
Ccl20O89093 AC133934.2-201ENSMUST00000221729 4129 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Ccl20O89093 Traj37-201ENSMUST00000103705 60 ntAPPRIS P1 BASIC0.94□□□□□ -2.26
Ccl20O89093 Gm14919-201ENSMUST00000120839 390 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Ccl20O89093 Gm24595-201ENSMUST00000122501 110 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Ccl20O89093 Gm26479-201ENSMUST00000122620 106 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Ccl20O89093 Gm13467-201ENSMUST00000145568 281 ntTSL 5 BASIC0.94□□□□□ -2.26
Ccl20O89093 Gm22556-201ENSMUST00000157803 100 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Ccl20O89093 Gm22664-201ENSMUST00000158719 105 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Ccl20O89093 Gm26004-201ENSMUST00000158804 116 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Ccl20O89093 Ranbp2-ps5-201ENSMUST00000185141 379 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Ccl20O89093 Gm29613-201ENSMUST00000185846 313 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Ccl20O89093 Gm29544-201ENSMUST00000188860 313 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Ccl20O89093 Gm28808-201ENSMUST00000190978 313 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Ccl20O89093 Gm43563-201ENSMUST00000196761 198 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Ccl20O89093 Gm42774-201ENSMUST00000198854 283 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Ccl20O89093 Gm26447-201ENSMUST00000082448 129 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Ccl20O89093 Gm25038-201ENSMUST00000082928 130 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Ccl20O89093 BC022960-201ENSMUST00000119987 1815 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Ccl20O89093 Olfr1002-202ENSMUST00000215548 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.94□□□□□ -2.26
Ccl20O89093 Gm25495-201ENSMUST00000104431 131 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Ccl20O89093 Gm15379-201ENSMUST00000121224 648 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Ccl20O89093 Gm25825-201ENSMUST00000157091 124 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Ccl20O89093 Mir6381-201ENSMUST00000183426 87 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Ccl20O89093 Gm27521-201ENSMUST00000184022 64 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Ccl20O89093 Gm29014-201ENSMUST00000191422 326 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Ccl20O89093 Gm44373-201ENSMUST00000196112 169 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Ccl20O89093 Gm43602-201ENSMUST00000196772 300 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Ccl20O89093 Gm40331-201ENSMUST00000198430 217 ntTSL 3 BASIC0.93□□□□□ -2.26
Ccl20O89093 Gm44055-201ENSMUST00000204376 247 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Ccl20O89093 Gm45268-201ENSMUST00000210046 370 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Ccl20O89093 AC132615.1-201ENSMUST00000213873 255 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Ccl20O89093 AC159896.1-201ENSMUST00000215264 215 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Ccl20O89093 AC098718.2-201ENSMUST00000226822 285 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Ccl20O89093 Gm9795-201ENSMUST00000062156 693 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Ccl20O89093 Gm22306-201ENSMUST00000082692 107 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Ccl20O89093 Gm25697-201ENSMUST00000082902 98 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Ccl20O89093 Gm45461-201ENSMUST00000211726 4535 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
Ccl20O89093 Olfr136-205ENSMUST00000216963 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.92□□□□□ -2.26
Ccl20O89093 Gm25875-201ENSMUST00000104323 107 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
Ccl20O89093 n-R5s67-201ENSMUST00000104336 114 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
Ccl20O89093 Mir875-201ENSMUST00000104698 78 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
Ccl20O89093 Mir669i-201ENSMUST00000117007 127 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
Ccl20O89093 Gm22321-201ENSMUST00000157152 104 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
Ccl20O89093 Gm23579-201ENSMUST00000158528 103 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
Ccl20O89093 Gm25615-201ENSMUST00000177836 94 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
Ccl20O89093 Gm28849-201ENSMUST00000188127 174 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
Ccl20O89093 Olfr277-ps1-201ENSMUST00000205749 285 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
Ccl20O89093 Gm44959-201ENSMUST00000209127 231 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
Ccl20O89093 Gm26497-201ENSMUST00000083146 107 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
Ccl20O89093 Gm10217-201ENSMUST00000088080 135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.92□□□□□ -2.26
Ccl20O89093 Olfr832-202ENSMUST00000218385 4435 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.92□□□□□ -2.26
Ccl20O89093 AC164297.1-201ENSMUST00000224484 1561 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
Ccl20O89093 Gm14536-201ENSMUST00000118324 138 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
Ccl20O89093 Gm15027-201ENSMUST00000120922 138 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.5 ms