Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ19

Gm379, Predicted gene 379, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm379J3QQ19 Gm25138-201ENSMUST00000083248 136 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
Gm379J3QQ19 Gm25170-201ENSMUST00000104191 129 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
Gm379J3QQ19 Gm11248-201ENSMUST00000119568 201 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
Gm379J3QQ19 Gm6985-201ENSMUST00000121255 271 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
Gm379J3QQ19 Gm23212-201ENSMUST00000122718 60 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
Gm379J3QQ19 Gm27668-201ENSMUST00000184188 120 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
Gm379J3QQ19 Rpl23a-ps9-201ENSMUST00000188369 463 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
Gm379J3QQ19 Rpl23a-ps11-201ENSMUST00000191583 463 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
Gm379J3QQ19 Olfr872-201ENSMUST00000086474 1897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.24□□□□□ -2.37
Gm379J3QQ19 Gm10033-201ENSMUST00000072427 1813 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
Gm379J3QQ19 Gm14782-201ENSMUST00000120151 195 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
Gm379J3QQ19 Gm14287-201ENSMUST00000121060 117 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
Gm379J3QQ19 Gm12068-201ENSMUST00000153153 376 ntTSL 3 BASIC0.23□□□□□ -2.37
Gm379J3QQ19 Gm22706-201ENSMUST00000157907 112 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
Gm379J3QQ19 Gm22983-201ENSMUST00000158308 104 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
Gm379J3QQ19 Gm21060-201ENSMUST00000179346 168 ntAPPRIS P1 BASIC0.23□□□□□ -2.37
Gm379J3QQ19 Gm25284-201ENSMUST00000180345 141 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
Gm379J3QQ19 Gm44828-201ENSMUST00000203745 106 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
Gm379J3QQ19 Olfr1035-ps1-202ENSMUST00000213364 288 ntTSL 5 BASIC0.23□□□□□ -2.37
Gm379J3QQ19 Mir10b-201ENSMUST00000083566 68 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
Gm379J3QQ19 Mir500-201ENSMUST00000093600 92 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
Gm379J3QQ19 Gm44560-201ENSMUST00000207816 3115 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
Gm379J3QQ19 Gm25507-201ENSMUST00000116981 144 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
Gm379J3QQ19 Gm11798-201ENSMUST00000119150 421 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
Gm379J3QQ19 Gm25109-201ENSMUST00000122474 114 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
Gm379J3QQ19 Gm20462-201ENSMUST00000172623 408 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
Gm379J3QQ19 Gm37997-201ENSMUST00000193515 267 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
Gm379J3QQ19 Gm42506-201ENSMUST00000202009 150 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
Gm379J3QQ19 Gm44948-201ENSMUST00000209050 149 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
Gm379J3QQ19 Gm5023-201ENSMUST00000217442 587 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
Gm379J3QQ19 Mir34a-201ENSMUST00000083559 102 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
Gm379J3QQ19 Mup-ps22-201ENSMUST00000121611 243 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
Gm379J3QQ19 Gm29276-201ENSMUST00000190453 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.21□□□□□ -2.38
Gm379J3QQ19 Klk1b28-ps-201ENSMUST00000206374 217 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
Gm379J3QQ19 Gm8219-201ENSMUST00000218309 242 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
Gm379J3QQ19 AC154747.1-201ENSMUST00000225265 239 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
Gm379J3QQ19 Gm24527-201ENSMUST00000082920 107 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
Gm379J3QQ19 Trgj3-201ENSMUST00000103562 60 ntAPPRIS P1 BASIC0.2□□□□□ -2.38
Gm379J3QQ19 Gm10715-202ENSMUST00000177969 681 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC0.2□□□□□ -2.38
Gm379J3QQ19 Gm19777-201ENSMUST00000191940 358 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
Gm379J3QQ19 Smr2-203ENSMUST00000196477 676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.2□□□□□ -2.38
Gm379J3QQ19 Smr2-204ENSMUST00000199635 680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.2□□□□□ -2.38
Gm379J3QQ19 Mir709-201ENSMUST00000102190 88 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
Gm379J3QQ19 Gm23024-201ENSMUST00000158770 292 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
Gm379J3QQ19 Gm23008-201ENSMUST00000158946 80 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
Gm379J3QQ19 Gm27717-201ENSMUST00000183933 151 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
Gm379J3QQ19 Mir6365-201ENSMUST00000183990 101 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
Gm379J3QQ19 Mir6394-201ENSMUST00000184738 99 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
Gm379J3QQ19 Gm29014-201ENSMUST00000191422 326 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
Gm379J3QQ19 Gm24616-201ENSMUST00000083274 139 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
Gm379J3QQ19 Gm13723-201ENSMUST00000130722 5036 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.19□□□□□ -2.38
Gm379J3QQ19 Gm26500-201ENSMUST00000101867 106 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
Gm379J3QQ19 Gm23321-201ENSMUST00000104465 126 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
Gm379J3QQ19 Gm13577-201ENSMUST00000121365 205 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
Gm379J3QQ19 AI847159-201ENSMUST00000137728 305 ntTSL 2 BASIC0.18□□□□□ -2.38
Gm379J3QQ19 Gm23853-201ENSMUST00000158375 104 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
Gm379J3QQ19 Gm28256-201ENSMUST00000188953 139 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
Gm379J3QQ19 Gm28559-201ENSMUST00000190532 139 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
Gm379J3QQ19 Gm28288-201ENSMUST00000191019 214 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
Gm379J3QQ19 Gm45119-201ENSMUST00000207612 199 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
Gm379J3QQ19 Gm30155-201ENSMUST00000223458 339 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
Gm379J3QQ19 AC167192.2-201ENSMUST00000224794 198 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
Gm379J3QQ19 AC117202.2-201ENSMUST00000226491 1101 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
Gm379J3QQ19 Gm22685-201ENSMUST00000082848 106 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
Gm379J3QQ19 Ighv1-47-201ENSMUST00000103518 294 ntAPPRIS P1 BASIC0.17□□□□□ -2.38
Gm379J3QQ19 Gm25274-201ENSMUST00000104296 135 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
Gm379J3QQ19 Gm24438-201ENSMUST00000157893 115 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
Gm379J3QQ19 Gm16539-201ENSMUST00000160086 327 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
Gm379J3QQ19 Gm24487-201ENSMUST00000178017 63 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
Gm379J3QQ19 Gm27475-201ENSMUST00000183420 61 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
Gm379J3QQ19 Mir7065-201ENSMUST00000185110 61 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
Gm379J3QQ19 Gm44726-201ENSMUST00000203427 217 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
Gm379J3QQ19 Gm26108-201ENSMUST00000083973 191 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
Gm379J3QQ19 Gm382-201ENSMUST00000096332 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.16□□□□□ -2.38
Gm379J3QQ19 Trbv17-201ENSMUST00000103275 374 ntAPPRIS P1 BASIC0.16□□□□□ -2.38
Gm379J3QQ19 Gm22786-201ENSMUST00000104086 122 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
Gm379J3QQ19 Gm6272-201ENSMUST00000121256 171 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
Gm379J3QQ19 Olfr277-ps1-201ENSMUST00000205749 285 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
Gm379J3QQ19 Olfr1435-ps1-201ENSMUST00000207773 249 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
Gm379J3QQ19 Mir30c-2-201ENSMUST00000083633 84 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
Gm379J3QQ19 Gm14413-201ENSMUST00000122158 408 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
Gm379J3QQ19 Gm24818-201ENSMUST00000175093 161 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
Gm379J3QQ19 Gm26430-201ENSMUST00000178054 107 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
Gm379J3QQ19 Gm44458-201ENSMUST00000196594 143 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
Gm379J3QQ19 4930511M18Rik-201ENSMUST00000197811 679 ntTSL 1 (best) BASIC0.15□□□□□ -2.39
Gm379J3QQ19 Gm19572-201ENSMUST00000214326 338 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
Gm379J3QQ19 Gm21897-201ENSMUST00000178312 1500 ntAPPRIS P1 BASIC0.14□□□□□ -2.39
Gm379J3QQ19 Mir710-201ENSMUST00000102088 110 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
Gm379J3QQ19 Mir767-201ENSMUST00000103256 107 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
Gm379J3QQ19 Gm22469-201ENSMUST00000104118 133 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
Gm379J3QQ19 Gm13711-201ENSMUST00000119708 453 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
Gm379J3QQ19 Gm22435-201ENSMUST00000158552 128 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
Gm379J3QQ19 Obox4-ps37-201ENSMUST00000177223 276 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
Gm379J3QQ19 Gm44211-201ENSMUST00000204867 145 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
Gm379J3QQ19 Gm10217-201ENSMUST00000088080 135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.14□□□□□ -2.39
Gm379J3QQ19 Gm24283-201ENSMUST00000104233 107 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Gm379J3QQ19 Gm25558-201ENSMUST00000158083 106 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Gm379J3QQ19 Gm10717-205ENSMUST00000177601 645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.13□□□□□ -2.39
Gm379J3QQ19 Mir6985-201ENSMUST00000184641 61 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Gm379J3QQ19 Gm42988-201ENSMUST00000198116 225 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.1 ms