Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ04

Gm21887, Predicted gene, 21887, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21887J3QQ04 Gm42993-201ENSMUST00000196856 7325 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Gm21887J3QQ04 Gm43753-201ENSMUST00000196539 3309 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Gm21887J3QQ04 AC158605.2-201ENSMUST00000220287 2726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.1
Gm21887J3QQ04 Gm42770-201ENSMUST00000199657 4155 ntBASIC1.9□□□□□ -2.1
Gm21887J3QQ04 Dnah7b-201ENSMUST00000069293 12314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.1
Gm21887J3QQ04 Zfp40-203ENSMUST00000140313 2754 ntTSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.1
Gm21887J3QQ04 Pak3-210ENSMUST00000172330 8135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.1
Gm21887J3QQ04 Gm24578-201ENSMUST00000103970 129 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Gm21887J3QQ04 Gm22899-201ENSMUST00000104540 131 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Gm21887J3QQ04 Gm14389-201ENSMUST00000140453 241 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Gm21887J3QQ04 Gm23327-201ENSMUST00000157420 78 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Gm21887J3QQ04 Gm25342-201ENSMUST00000157459 122 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Gm21887J3QQ04 Gm22845-201ENSMUST00000157712 104 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Gm21887J3QQ04 Mir3110-201ENSMUST00000175053 80 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Gm21887J3QQ04 Gm26828-201ENSMUST00000180640 172 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Gm21887J3QQ04 Gm27849-201ENSMUST00000183673 125 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Gm21887J3QQ04 Mir6715-201ENSMUST00000184990 57 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Gm21887J3QQ04 Gm42567-201ENSMUST00000199268 352 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
Gm21887J3QQ04 AC122428.1-201ENSMUST00000213709 217 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
Gm21887J3QQ04 AC145731.1-201ENSMUST00000214083 344 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
Gm21887J3QQ04 Gm23626-201ENSMUST00000082458 133 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Gm21887J3QQ04 Gm43484-201ENSMUST00000198333 5966 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Gm21887J3QQ04 Macf1-206ENSMUST00000106224 23402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
Gm21887J3QQ04 Wnk3-201ENSMUST00000096285 8551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
Gm21887J3QQ04 Gabra2-203ENSMUST00000197284 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
Gm21887J3QQ04 Vmn1r79-203ENSMUST00000227530 5581 ntAPPRIS P1 BASIC1.89□□□□□ -2.11
Gm21887J3QQ04 Olfr1039-203ENSMUST00000216566 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
Gm21887J3QQ04 Gm23594-201ENSMUST00000104307 134 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Gm21887J3QQ04 Gm15799-201ENSMUST00000120899 289 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Gm21887J3QQ04 Gm26153-201ENSMUST00000157433 127 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Gm21887J3QQ04 Gm22200-201ENSMUST00000158614 67 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Gm21887J3QQ04 Mog-202ENSMUST00000167275 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
Gm21887J3QQ04 Gm22403-201ENSMUST00000174919 84 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Gm21887J3QQ04 Snora24-201ENSMUST00000174989 130 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Gm21887J3QQ04 Mir3061-201ENSMUST00000175129 91 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Gm21887J3QQ04 Gm21885-201ENSMUST00000178891 327 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Gm21887J3QQ04 Mir7235-201ENSMUST00000183796 56 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Gm21887J3QQ04 Sult1c2-ps2-201ENSMUST00000196414 276 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Gm21887J3QQ04 Gm39147-201ENSMUST00000211376 465 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Gm21887J3QQ04 Rpl18a-205ENSMUST00000212494 473 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
Gm21887J3QQ04 mt-Tv-201ENSMUST00000082389 69 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Gm21887J3QQ04 Gm23514-201ENSMUST00000082827 130 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Gm21887J3QQ04 Gm37602-201ENSMUST00000195187 3310 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Gm21887J3QQ04 Gm42664-201ENSMUST00000199417 3239 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Gm21887J3QQ04 Gm44560-201ENSMUST00000207816 3115 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Gm21887J3QQ04 Olfr640-202ENSMUST00000218535 4009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
Gm21887J3QQ04 Gm24650-201ENSMUST00000157105 103 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Gm21887J3QQ04 Gm24787-201ENSMUST00000157380 123 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Gm21887J3QQ04 Gm22536-201ENSMUST00000158171 134 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Gm21887J3QQ04 Mir7022-201ENSMUST00000183749 61 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Gm21887J3QQ04 Mir6911-201ENSMUST00000184241 69 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Gm21887J3QQ04 Gm27330-201ENSMUST00000184689 132 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Gm21887J3QQ04 Mir7674-201ENSMUST00000184964 63 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Gm21887J3QQ04 Gm44474-201ENSMUST00000196525 127 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
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Gm21887J3QQ04 Gm24525-201ENSMUST00000082917 151 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Gm21887J3QQ04 Gm24805-201ENSMUST00000082931 104 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Gm21887J3QQ04 Mir188-201ENSMUST00000083464 68 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Gm21887J3QQ04 Mir337-201ENSMUST00000083592 97 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Gm21887J3QQ04 Ifi203-205ENSMUST00000129829 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
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Gm21887J3QQ04 Gm22988-201ENSMUST00000122759 144 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Gm21887J3QQ04 Gm24649-201ENSMUST00000157106 134 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
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Gm21887J3QQ04 Gm25393-201ENSMUST00000157336 285 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
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Gm21887J3QQ04 Mir5110-201ENSMUST00000175537 87 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
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Gm21887J3QQ04 Rps26-ps1-202ENSMUST00000212102 351 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Gm21887J3QQ04 Mir17-201ENSMUST00000083574 84 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Gm21887J3QQ04 Olfr748-202ENSMUST00000213101 3632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
Gm21887J3QQ04 AC152979.2-201ENSMUST00000219702 3814 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Gm21887J3QQ04 Usp9y-201ENSMUST00000091188 8094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
Gm21887J3QQ04 Snord78-201ENSMUST00000104032 66 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Gm21887J3QQ04 Gm11248-201ENSMUST00000119568 201 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Gm21887J3QQ04 Gm12854-201ENSMUST00000128518 297 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
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Gm21887J3QQ04 Gm24751-201ENSMUST00000157844 102 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Gm21887J3QQ04 Gm28976-201ENSMUST00000188070 144 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Gm21887J3QQ04 Trbv7-201ENSMUST00000193339 402 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Gm21887J3QQ04 Gm43020-201ENSMUST00000197178 372 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
Gm21887J3QQ04 Gm44734-201ENSMUST00000206025 237 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
Gm21887J3QQ04 AC141438.3-201ENSMUST00000215632 202 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Gm21887J3QQ04 Gm7665-201ENSMUST00000076710 297 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Gm21887J3QQ04 Gm22220-201ENSMUST00000082671 149 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Gm21887J3QQ04 Gm23244-201ENSMUST00000083375 92 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Gm21887J3QQ04 Olfr681-203ENSMUST00000215517 4324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
Gm21887J3QQ04 Vmn1r80-205ENSMUST00000227755 10455 ntAPPRIS P1 BASIC1.85□□□□□ -2.11
Gm21887J3QQ04 Gm43032-201ENSMUST00000197967 3123 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Gm21887J3QQ04 Gm22498-201ENSMUST00000104497 86 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Gm21887J3QQ04 Gm22106-201ENSMUST00000122544 127 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Gm21887J3QQ04 Gm26310-201ENSMUST00000157766 117 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Gm21887J3QQ04 Gm24947-201ENSMUST00000158334 110 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Gm21887J3QQ04 Gm25977-201ENSMUST00000158697 85 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Gm21887J3QQ04 Gm22501-201ENSMUST00000158981 127 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
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