Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Gm44811-201ENSMUST00000209120 228 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
Usp9yF8VPU6 AC166358.10-201ENSMUST00000220556 144 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
Usp9yF8VPU6 Gm25137-201ENSMUST00000083251 110 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
Usp9yF8VPU6 Mir702-201ENSMUST00000102285 109 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
Usp9yF8VPU6 Traj6-201ENSMUST00000103734 62 ntAPPRIS P1 BASIC-0.58□□□□□ -2.5
Usp9yF8VPU6 Gm13482-201ENSMUST00000119842 254 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
Usp9yF8VPU6 Gm14623-201ENSMUST00000121398 603 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
Usp9yF8VPU6 Gm10177-202ENSMUST00000161698 207 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
Usp9yF8VPU6 Gm20405-201ENSMUST00000174002 229 ntTSL 5 BASIC-0.58□□□□□ -2.5
Usp9yF8VPU6 Gm24390-201ENSMUST00000179578 62 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
Usp9yF8VPU6 Bsph2-ps-201ENSMUST00000183795 241 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
Usp9yF8VPU6 Gm37750-201ENSMUST00000193563 129 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
Usp9yF8VPU6 Gm35212-201ENSMUST00000196672 606 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
Usp9yF8VPU6 Mir3065-201ENSMUST00000198674 87 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
Usp9yF8VPU6 CT033781.2-201ENSMUST00000221113 153 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
Usp9yF8VPU6 AC159093.2-201ENSMUST00000227881 297 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
Usp9yF8VPU6 Gm24977-201ENSMUST00000083106 163 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
Usp9yF8VPU6 Mir129-2-201ENSMUST00000083577 90 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
Usp9yF8VPU6 Rgs13-202ENSMUST00000111941 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.59□□□□□ -2.5
Usp9yF8VPU6 Mir208b-201ENSMUST00000104735 77 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
Usp9yF8VPU6 Gm14629-201ENSMUST00000122428 144 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
Usp9yF8VPU6 Gm22452-201ENSMUST00000122804 104 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
Usp9yF8VPU6 Gm18417-201ENSMUST00000176564 648 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
Usp9yF8VPU6 Gm24308-201ENSMUST00000177773 114 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
Usp9yF8VPU6 Gm25935-201ENSMUST00000178746 107 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
Usp9yF8VPU6 Gm44807-201ENSMUST00000206115 154 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
Usp9yF8VPU6 CT954323.1-201ENSMUST00000222774 229 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
Usp9yF8VPU6 CT030194.2-201ENSMUST00000225752 379 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
Usp9yF8VPU6 Gm25801-201ENSMUST00000082638 106 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
Usp9yF8VPU6 Gm24460-201ENSMUST00000082731 106 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
Usp9yF8VPU6 Mir30a-201ENSMUST00000083471 71 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
Usp9yF8VPU6 Gm22004-201ENSMUST00000101884 107 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
Usp9yF8VPU6 Gm23202-201ENSMUST00000104376 129 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
Usp9yF8VPU6 Gm11334-201ENSMUST00000121969 156 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
Usp9yF8VPU6 Gm24726-201ENSMUST00000158232 121 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
Usp9yF8VPU6 Gm22435-201ENSMUST00000158552 128 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
Usp9yF8VPU6 Gm24884-201ENSMUST00000158784 119 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
Usp9yF8VPU6 Prol1-201ENSMUST00000170832 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.59□□□□□ -2.5
Usp9yF8VPU6 Gm27599-201ENSMUST00000183758 174 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
Usp9yF8VPU6 Gm29535-201ENSMUST00000185723 109 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
Usp9yF8VPU6 Gm28143-201ENSMUST00000191082 109 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
Usp9yF8VPU6 Ighv1-6-201ENSMUST00000193849 293 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
Usp9yF8VPU6 1700014F14Rik-201ENSMUST00000199566 197 ntTSL 1 (best) BASIC-0.59□□□□□ -2.5
Usp9yF8VPU6 Olfr1470-ps1-201ENSMUST00000208620 949 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
Usp9yF8VPU6 Gm26055-201ENSMUST00000083038 107 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
Usp9yF8VPU6 Gm23989-201ENSMUST00000117030 66 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
Usp9yF8VPU6 Gm15010-201ENSMUST00000117153 407 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
Usp9yF8VPU6 Gm25783-201ENSMUST00000122525 190 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
Usp9yF8VPU6 n-R5s188-201ENSMUST00000122646 105 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
Usp9yF8VPU6 Ranbp2-ps6-201ENSMUST00000183722 381 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
Usp9yF8VPU6 Mir3068-202ENSMUST00000197755 79 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
Usp9yF8VPU6 AC154562.1-201ENSMUST00000226140 966 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
Usp9yF8VPU6 Gm22247-201ENSMUST00000082476 131 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
Usp9yF8VPU6 Gm12162-202ENSMUST00000129432 127 ntTSL 5 BASIC-0.6□□□□□ -2.51
Usp9yF8VPU6 Gm26150-201ENSMUST00000157426 151 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
Usp9yF8VPU6 Gm23068-201ENSMUST00000158239 293 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
Usp9yF8VPU6 Gm25750-201ENSMUST00000175483 112 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
Usp9yF8VPU6 Gm23002-201ENSMUST00000179221 107 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
Usp9yF8VPU6 Gm27421-201ENSMUST00000184729 167 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
Usp9yF8VPU6 Gm38019-201ENSMUST00000195133 380 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
Usp9yF8VPU6 Gm10717-201ENSMUST00000075573 684 ntTSL 5 BASIC-0.6□□□□□ -2.51
Usp9yF8VPU6 Mir599-201ENSMUST00000102378 88 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
Usp9yF8VPU6 B230307C23Rik-201ENSMUST00000113729 192 ntTSL 5 BASIC-0.61□□□□□ -2.51
Usp9yF8VPU6 Gm11936-201ENSMUST00000118323 160 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
Usp9yF8VPU6 Gm25325-201ENSMUST00000122559 86 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
Usp9yF8VPU6 Mir1936-201ENSMUST00000158699 93 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
Usp9yF8VPU6 Gm25598-201ENSMUST00000179031 107 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
Usp9yF8VPU6 Gm29229-201ENSMUST00000188874 323 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
Usp9yF8VPU6 Gm28256-201ENSMUST00000188953 139 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
Usp9yF8VPU6 Gm28559-201ENSMUST00000190532 139 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
Usp9yF8VPU6 Gm22443-201ENSMUST00000082890 107 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
Usp9yF8VPU6 Gm22576-201ENSMUST00000083733 104 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
Usp9yF8VPU6 Mir297b-201ENSMUST00000102268 109 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
Usp9yF8VPU6 Gm25756-201ENSMUST00000103990 136 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
Usp9yF8VPU6 Gm12044-201ENSMUST00000120335 213 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
Usp9yF8VPU6 Gm23676-201ENSMUST00000157314 105 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
Usp9yF8VPU6 Gm23390-201ENSMUST00000157393 106 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
Usp9yF8VPU6 Mir1933-201ENSMUST00000158930 88 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
Usp9yF8VPU6 Gm22183-201ENSMUST00000175420 73 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
Usp9yF8VPU6 Gm27342-201ENSMUST00000183530 109 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
Usp9yF8VPU6 Olfr950-ps1-201ENSMUST00000213804 878 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
Usp9yF8VPU6 AC156560.1-201ENSMUST00000221425 256 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
Usp9yF8VPU6 AC167019.1-201ENSMUST00000227913 106 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
Usp9yF8VPU6 AC125523.1-201ENSMUST00000228018 934 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
Usp9yF8VPU6 Gm25081-201ENSMUST00000082534 108 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
Usp9yF8VPU6 Gm14417-201ENSMUST00000120036 1074 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
Usp9yF8VPU6 Gm29247-202ENSMUST00000148542 571 ntTSL 2 BASIC-0.62□□□□□ -2.51
Usp9yF8VPU6 Gm23219-201ENSMUST00000158123 87 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
Usp9yF8VPU6 Gm15446-203ENSMUST00000170826 192 ntTSL 5 BASIC-0.62□□□□□ -2.51
Usp9yF8VPU6 Gm23379-201ENSMUST00000180026 107 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
Usp9yF8VPU6 Mir7094-2-201ENSMUST00000184622 60 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
Usp9yF8VPU6 Gm42773-201ENSMUST00000196962 148 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
Usp9yF8VPU6 Mir7094-1-201ENSMUST00000199671 60 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
Usp9yF8VPU6 Gm22062-201ENSMUST00000082563 107 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
Usp9yF8VPU6 Gm22829-201ENSMUST00000083771 106 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
Usp9yF8VPU6 Gm22031-201ENSMUST00000116945 126 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
Usp9yF8VPU6 Gm22541-201ENSMUST00000158165 127 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
Usp9yF8VPU6 Gm11168-201ENSMUST00000177722 684 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC-0.62□□□□□ -2.51
Usp9yF8VPU6 Gm22392-201ENSMUST00000177971 107 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
Usp9yF8VPU6 Gm11168-202ENSMUST00000178077 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC-0.62□□□□□ -2.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 149.6 ms