Protein–RNA interactions for Protein: E9Q414

Apob, Apolipoprotein B-100, mousemouse

Predictions only

Length 4,505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobE9Q414 Gm11334-201ENSMUST00000121969 156 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
ApobE9Q414 Gm25325-201ENSMUST00000122559 86 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
ApobE9Q414 Gm22466-201ENSMUST00000175278 69 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
ApobE9Q414 Gm22265-201ENSMUST00000082947 116 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
ApobE9Q414 Gm26415-201ENSMUST00000157673 292 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
ApobE9Q414 Gm17906-201ENSMUST00000202480 901 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
ApobE9Q414 Mir1298-201ENSMUST00000116681 98 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
ApobE9Q414 C030015E24Rik-201ENSMUST00000198148 828 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
ApobE9Q414 Gm15529-201ENSMUST00000121833 994 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
ApobE9Q414 Gm25522-201ENSMUST00000158394 105 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
ApobE9Q414 Gm17148-201ENSMUST00000164702 249 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
ApobE9Q414 Gm44811-201ENSMUST00000209120 228 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
ApobE9Q414 Gm12640-201ENSMUST00000120097 310 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
ApobE9Q414 Gm25884-201ENSMUST00000157782 62 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
ApobE9Q414 Gm22611-201ENSMUST00000158288 150 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
ApobE9Q414 Gm12105-201ENSMUST00000120846 779 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
ApobE9Q414 Gm22038-201ENSMUST00000157277 242 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
ApobE9Q414 Gm24510-201ENSMUST00000174965 94 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
ApobE9Q414 Rpl23a-ps9-201ENSMUST00000188369 463 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
ApobE9Q414 Rpl23a-ps11-201ENSMUST00000191583 463 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
ApobE9Q414 CT030194.2-201ENSMUST00000225752 379 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
ApobE9Q414 Gm24233-201ENSMUST00000104317 122 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
ApobE9Q414 Gm14001-201ENSMUST00000118847 247 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
ApobE9Q414 Rgs13-202ENSMUST00000111941 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.96□□□□□ -2.56
ApobE9Q414 Gm24283-201ENSMUST00000104233 107 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
ApobE9Q414 Gm25510-201ENSMUST00000116986 123 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
ApobE9Q414 Gm25600-201ENSMUST00000158357 106 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
ApobE9Q414 Gm43472-201ENSMUST00000200175 154 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
ApobE9Q414 Gm23184-201ENSMUST00000122594 131 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
ApobE9Q414 Gm24649-201ENSMUST00000157106 134 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
ApobE9Q414 Gm26073-201ENSMUST00000179906 127 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
ApobE9Q414 Gm25257-201ENSMUST00000083907 110 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
ApobE9Q414 Gm14626-201ENSMUST00000117619 216 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
ApobE9Q414 Gm4910-201ENSMUST00000119605 366 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
ApobE9Q414 Gm23892-201ENSMUST00000158105 130 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
ApobE9Q414 Gm25015-201ENSMUST00000158400 128 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
ApobE9Q414 Scgb1b13-ps-201ENSMUST00000187330 273 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
ApobE9Q414 AC130821.1-201ENSMUST00000221997 293 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
ApobE9Q414 Gm10717-201ENSMUST00000075573 684 ntTSL 5 BASIC-0.97□□□□□ -2.56
ApobE9Q414 Gm22091-201ENSMUST00000116908 127 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.57
ApobE9Q414 Gm11936-201ENSMUST00000118323 160 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.57
ApobE9Q414 Gm24909-201ENSMUST00000157290 280 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.57
ApobE9Q414 Mir3068-202ENSMUST00000197755 79 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.57
ApobE9Q414 Esp31-201ENSMUST00000174742 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.97□□□□□ -2.57
ApobE9Q414 Gm15010-201ENSMUST00000117153 407 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.57
ApobE9Q414 n-R5s188-201ENSMUST00000122646 105 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.57
ApobE9Q414 Esp24-201ENSMUST00000180245 207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.97□□□□□ -2.57
ApobE9Q414 Gm9227-201ENSMUST00000194733 566 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.57
ApobE9Q414 Gm5010-201ENSMUST00000213131 260 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.57
ApobE9Q414 Gm22771-201ENSMUST00000104449 91 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
ApobE9Q414 Mir654-201ENSMUST00000104787 84 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
ApobE9Q414 Gm25750-201ENSMUST00000175483 112 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
ApobE9Q414 Gm37910-201ENSMUST00000194770 217 ntTSL 5 BASIC-0.98□□□□□ -2.57
ApobE9Q414 Gm43487-201ENSMUST00000200331 1031 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
ApobE9Q414 Gm43943-201ENSMUST00000204201 113 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
ApobE9Q414 AC157476.1-201ENSMUST00000215555 169 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
ApobE9Q414 Gm21750-201ENSMUST00000098874 1497 ntAPPRIS P1 BASIC-0.98□□□□□ -2.57
ApobE9Q414 Gm22732-201ENSMUST00000158093 121 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
ApobE9Q414 Gm22769-201ENSMUST00000158367 98 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
ApobE9Q414 Gm37709-201ENSMUST00000195074 600 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
ApobE9Q414 AC125523.1-201ENSMUST00000228018 934 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
ApobE9Q414 Olfr1485-ps1-201ENSMUST00000208420 370 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
ApobE9Q414 Gm11792-201ENSMUST00000120640 168 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
ApobE9Q414 Gm5269-201ENSMUST00000183590 138 ntAPPRIS P1 BASIC-0.99□□□□□ -2.57
ApobE9Q414 Gm25225-201ENSMUST00000158197 102 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
ApobE9Q414 Gm28412-201ENSMUST00000187243 177 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
ApobE9Q414 Gm24894-201ENSMUST00000122744 118 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
ApobE9Q414 Gm43993-201ENSMUST00000203972 247 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
ApobE9Q414 Gm5899-201ENSMUST00000071770 270 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
ApobE9Q414 Gm22097-201ENSMUST00000157929 278 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
ApobE9Q414 Vmn2r-ps78-201ENSMUST00000173350 308 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
ApobE9Q414 Mir377-201ENSMUST00000083504 68 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
ApobE9Q414 Gm15193-201ENSMUST00000120224 865 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
ApobE9Q414 Gm22263-201ENSMUST00000180060 104 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
ApobE9Q414 Gm23805-201ENSMUST00000180129 107 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
ApobE9Q414 Gm23477-201ENSMUST00000158882 128 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
ApobE9Q414 AC153541.1-201ENSMUST00000213786 294 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
ApobE9Q414 Gm29140-201ENSMUST00000190187 476 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
ApobE9Q414 Gm34073-201ENSMUST00000195736 212 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
ApobE9Q414 CT030662.3-201ENSMUST00000228751 476 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
ApobE9Q414 Gm10297-201ENSMUST00000207136 651 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
ApobE9Q414 Gm24704-201ENSMUST00000093715 107 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
ApobE9Q414 Gm22496-201ENSMUST00000104493 88 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
ApobE9Q414 Gm25473-201ENSMUST00000180191 107 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
ApobE9Q414 Gm44352-201ENSMUST00000196358 110 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
ApobE9Q414 Gm25897-201ENSMUST00000083709 107 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
ApobE9Q414 Trbj1-4-201ENSMUST00000103287 51 ntAPPRIS P1 BASIC-1.01□□□□□ -2.57
ApobE9Q414 Gm44125-201ENSMUST00000203068 448 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
ApobE9Q414 Prl8a6-201ENSMUST00000018392 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC-1.02□□□□□ -2.57
ApobE9Q414 AC156795.1-201ENSMUST00000214655 414 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
ApobE9Q414 Gm25610-201ENSMUST00000104016 129 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
ApobE9Q414 Gm23012-201ENSMUST00000104149 83 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
ApobE9Q414 Gm14298-201ENSMUST00000139032 237 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
ApobE9Q414 Gm26104-201ENSMUST00000157250 108 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
ApobE9Q414 Gm23473-201ENSMUST00000158883 116 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
ApobE9Q414 4930440C22Rik-202ENSMUST00000190754 512 ntTSL 3 BASIC-1.02□□□□□ -2.57
ApobE9Q414 Gm37116-201ENSMUST00000195161 147 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
ApobE9Q414 AC154552.7-201ENSMUST00000222824 156 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
ApobE9Q414 Gm22193-201ENSMUST00000116868 76 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
ApobE9Q414 Gm14922-201ENSMUST00000121131 163 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
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