Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1U1

Ccdc171, Coiled-coil domain-containing protein 171, mousemouse

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Length 1,324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc171E9Q1U1 Gm23126-201ENSMUST00000104260 134 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
Ccdc171E9Q1U1 Gm15632-201ENSMUST00000135936 246 ntTSL 1 (best) BASIC0.36□□□□□ -2.35
Ccdc171E9Q1U1 Gm12068-201ENSMUST00000153153 376 ntTSL 3 BASIC0.36□□□□□ -2.35
Ccdc171E9Q1U1 Gm22809-201ENSMUST00000082743 156 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
Ccdc171E9Q1U1 Gm10730-201ENSMUST00000194097 2723 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
Ccdc171E9Q1U1 Gm25968-201ENSMUST00000157167 100 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
Ccdc171E9Q1U1 Gm26116-201ENSMUST00000175600 77 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
Ccdc171E9Q1U1 Il6st-202ENSMUST00000183513 201 ntTSL 5 BASIC0.35□□□□□ -2.35
Ccdc171E9Q1U1 Mir6389-201ENSMUST00000183661 102 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
Ccdc171E9Q1U1 Gm29014-201ENSMUST00000191422 326 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
Ccdc171E9Q1U1 Smr2-203ENSMUST00000196477 676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.35□□□□□ -2.35
Ccdc171E9Q1U1 Smr2-204ENSMUST00000199635 680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.35□□□□□ -2.35
Ccdc171E9Q1U1 AC124542.1-201ENSMUST00000205588 908 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
Ccdc171E9Q1U1 AC167192.2-201ENSMUST00000224794 198 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
Ccdc171E9Q1U1 Gm43885-201ENSMUST00000204928 2542 ntBASIC0.34□□□□□ -2.35
Ccdc171E9Q1U1 Gm14782-201ENSMUST00000120151 195 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
Ccdc171E9Q1U1 Gm25109-201ENSMUST00000122474 114 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
Ccdc171E9Q1U1 Gm25393-201ENSMUST00000157336 285 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
Ccdc171E9Q1U1 Gm22447-201ENSMUST00000158155 92 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
Ccdc171E9Q1U1 Gm25138-201ENSMUST00000083248 136 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
Ccdc171E9Q1U1 Gm16032-201ENSMUST00000118534 168 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
Ccdc171E9Q1U1 Gm25434-201ENSMUST00000158278 167 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
Ccdc171E9Q1U1 Gm24487-201ENSMUST00000178017 63 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
Ccdc171E9Q1U1 Gm27957-201ENSMUST00000184054 127 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
Ccdc171E9Q1U1 AC153930.1-201ENSMUST00000220016 358 ntTSL 3 BASIC0.33□□□□□ -2.36
Ccdc171E9Q1U1 AC122905.2-201ENSMUST00000220325 269 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
Ccdc171E9Q1U1 Gm26326-201ENSMUST00000083070 129 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
Ccdc171E9Q1U1 Gm382-201ENSMUST00000096332 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.33□□□□□ -2.36
Ccdc171E9Q1U1 Gm22771-201ENSMUST00000104449 91 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
Ccdc171E9Q1U1 Gm6657-203ENSMUST00000188791 531 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.32□□□□□ -2.36
Ccdc171E9Q1U1 Gm37468-201ENSMUST00000194767 854 ntTSL 1 (best) BASIC0.32□□□□□ -2.36
Ccdc171E9Q1U1 Gm44052-201ENSMUST00000203382 396 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
Ccdc171E9Q1U1 Gm36546-201ENSMUST00000206372 230 ntTSL 5 BASIC0.32□□□□□ -2.36
Ccdc171E9Q1U1 Gm33654-201ENSMUST00000221704 215 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
Ccdc171E9Q1U1 AC132918.1-201ENSMUST00000227877 925 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
Ccdc171E9Q1U1 Gm15379-201ENSMUST00000121224 648 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
Ccdc171E9Q1U1 Mup-ps22-201ENSMUST00000121611 243 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
Ccdc171E9Q1U1 Gm24963-201ENSMUST00000157916 144 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
Ccdc171E9Q1U1 Gm44948-201ENSMUST00000209050 149 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
Ccdc171E9Q1U1 Gm18113-201ENSMUST00000220630 303 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
Ccdc171E9Q1U1 Gm22685-201ENSMUST00000082848 106 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
Ccdc171E9Q1U1 Mir34a-201ENSMUST00000083559 102 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
Ccdc171E9Q1U1 Gm44560-201ENSMUST00000207816 3115 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
Ccdc171E9Q1U1 Olfr1154-203ENSMUST00000215862 2624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.3□□□□□ -2.36
Ccdc171E9Q1U1 Trgj3-201ENSMUST00000103562 60 ntAPPRIS P1 BASIC0.3□□□□□ -2.36
Ccdc171E9Q1U1 Mir654-201ENSMUST00000104787 84 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
Ccdc171E9Q1U1 Gm26303-201ENSMUST00000116845 119 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
Ccdc171E9Q1U1 Gm14946-201ENSMUST00000119859 296 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
Ccdc171E9Q1U1 Gm26424-201ENSMUST00000122530 104 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
Ccdc171E9Q1U1 Gm25825-201ENSMUST00000157091 124 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
Ccdc171E9Q1U1 Gm23016-201ENSMUST00000158431 62 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
Ccdc171E9Q1U1 Gm20257-202ENSMUST00000188643 130 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
Ccdc171E9Q1U1 Mir219b-201ENSMUST00000198317 65 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
Ccdc171E9Q1U1 AC153541.1-201ENSMUST00000213786 294 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
Ccdc171E9Q1U1 2210407C18Rik-201ENSMUST00000048801 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.3□□□□□ -2.36
Ccdc171E9Q1U1 Gm22888-201ENSMUST00000158640 77 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
Ccdc171E9Q1U1 Gm20462-201ENSMUST00000172623 408 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
Ccdc171E9Q1U1 Gm18185-201ENSMUST00000186725 667 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
Ccdc171E9Q1U1 Gm28217-201ENSMUST00000188613 648 ntTSL 5 BASIC0.29□□□□□ -2.36
Ccdc171E9Q1U1 AC165092.3-201ENSMUST00000223602 282 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
Ccdc171E9Q1U1 Gm22841-201ENSMUST00000158443 62 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
Ccdc171E9Q1U1 Gm22435-201ENSMUST00000158552 128 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
Ccdc171E9Q1U1 Gm25949-201ENSMUST00000175333 114 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
Ccdc171E9Q1U1 Gm25284-201ENSMUST00000180345 141 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
Ccdc171E9Q1U1 Gm11392-201ENSMUST00000181419 710 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
Ccdc171E9Q1U1 Gm27717-201ENSMUST00000183933 151 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
Ccdc171E9Q1U1 AC129208.2-201ENSMUST00000228506 320 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
Ccdc171E9Q1U1 AC159625.1-201ENSMUST00000220994 2625 ntBASIC0.28□□□□□ -2.37
Ccdc171E9Q1U1 Gm20939-201ENSMUST00000108007 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.27□□□□□ -2.37
Ccdc171E9Q1U1 Gm15327-202ENSMUST00000153958 467 ntTSL 1 (best) BASIC0.27□□□□□ -2.37
Ccdc171E9Q1U1 Gm24476-201ENSMUST00000157437 131 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
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Ccdc171E9Q1U1 Gm22200-201ENSMUST00000158614 67 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
Ccdc171E9Q1U1 Gm25838-201ENSMUST00000158920 120 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
Ccdc171E9Q1U1 4930511M18Rik-201ENSMUST00000197811 679 ntTSL 1 (best) BASIC0.27□□□□□ -2.37
Ccdc171E9Q1U1 Gm44488-201ENSMUST00000199467 119 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
Ccdc171E9Q1U1 Gm30155-201ENSMUST00000223458 339 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
Ccdc171E9Q1U1 Gm26164-201ENSMUST00000083793 104 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
Ccdc171E9Q1U1 AC160115.1-201ENSMUST00000224678 1574 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
Ccdc171E9Q1U1 Gm26135-201ENSMUST00000101993 72 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
Ccdc171E9Q1U1 Mir880-201ENSMUST00000104809 78 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
Ccdc171E9Q1U1 Gm22706-201ENSMUST00000157907 112 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
Ccdc171E9Q1U1 Snord50b-201ENSMUST00000178497 72 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
Ccdc171E9Q1U1 Gm25314-201ENSMUST00000178810 79 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
Ccdc171E9Q1U1 Olfr872-201ENSMUST00000086474 1897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.26□□□□□ -2.37
Ccdc171E9Q1U1 Gm14761-201ENSMUST00000121363 262 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
Ccdc171E9Q1U1 Olfr375-ps1-201ENSMUST00000198131 249 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
Ccdc171E9Q1U1 Gm45543-201ENSMUST00000209327 88 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
Ccdc171E9Q1U1 AC192616.1-201ENSMUST00000221922 132 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
Ccdc171E9Q1U1 Mir710-201ENSMUST00000102088 110 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
Ccdc171E9Q1U1 Gm22786-201ENSMUST00000104086 122 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
Ccdc171E9Q1U1 Gm11407-201ENSMUST00000120362 1058 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
Ccdc171E9Q1U1 Gm14773-201ENSMUST00000125932 451 ntTSL 2 BASIC0.24□□□□□ -2.37
Ccdc171E9Q1U1 Gm21060-201ENSMUST00000179346 168 ntAPPRIS P1 BASIC0.24□□□□□ -2.37
Ccdc171E9Q1U1 Gm29640-201ENSMUST00000187972 278 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
Ccdc171E9Q1U1 Gm28256-201ENSMUST00000188953 139 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
Ccdc171E9Q1U1 Gm28559-201ENSMUST00000190532 139 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
Ccdc171E9Q1U1 Gm45119-201ENSMUST00000207612 199 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
Ccdc171E9Q1U1 Gm45402-201ENSMUST00000211796 223 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
Ccdc171E9Q1U1 Mir224-201ENSMUST00000083608 82 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 138.9 ms