Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Zfp711-201ENSMUST00000071814 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
Chmp3Q9CQ10 Mir499-201ENSMUST00000102357 79 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Chmp3Q9CQ10 Gm24375-201ENSMUST00000104397 132 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Chmp3Q9CQ10 Gm25623-201ENSMUST00000157216 108 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Chmp3Q9CQ10 Gm23599-201ENSMUST00000157261 251 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Chmp3Q9CQ10 Snord11-201ENSMUST00000158468 84 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Chmp3Q9CQ10 Gm23268-201ENSMUST00000175494 78 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Chmp3Q9CQ10 Gm22070-201ENSMUST00000178475 107 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Chmp3Q9CQ10 Gm27668-201ENSMUST00000184188 120 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Chmp3Q9CQ10 Mir7081-201ENSMUST00000184490 75 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Chmp3Q9CQ10 Gm43381-201ENSMUST00000198553 165 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Chmp3Q9CQ10 mt-Tf-201ENSMUST00000082387 68 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Chmp3Q9CQ10 Snora2b-201ENSMUST00000084005 137 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Chmp3Q9CQ10 Gm43032-201ENSMUST00000197967 3123 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Chmp3Q9CQ10 Gpr22-201ENSMUST00000057783 4587 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
Chmp3Q9CQ10 Olfr1039-202ENSMUST00000214364 3925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
Chmp3Q9CQ10 Ifi214-203ENSMUST00000139092 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.85
Chmp3Q9CQ10 Gm33962-201ENSMUST00000182643 2592 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Chmp3Q9CQ10 Gm11253-201ENSMUST00000118486 201 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Chmp3Q9CQ10 Gm22665-201ENSMUST00000158720 275 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Chmp3Q9CQ10 Mir6916-201ENSMUST00000184514 63 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Chmp3Q9CQ10 Gm37377-201ENSMUST00000191733 304 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Chmp3Q9CQ10 Gm43264-201ENSMUST00000202284 325 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Chmp3Q9CQ10 Mir19b-2-201ENSMUST00000083539 84 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Chmp3Q9CQ10 Mir466-201ENSMUST00000093591 73 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Chmp3Q9CQ10 Olfr1450-202ENSMUST00000213587 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
Chmp3Q9CQ10 Olfr1208-202ENSMUST00000214121 2823 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
Chmp3Q9CQ10 Snord64-201ENSMUST00000104003 67 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Chmp3Q9CQ10 Gm25377-201ENSMUST00000104334 129 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Chmp3Q9CQ10 Gm13756-201ENSMUST00000117618 222 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Chmp3Q9CQ10 Gm24632-201ENSMUST00000122770 323 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Chmp3Q9CQ10 Gm22790-201ENSMUST00000157229 129 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Chmp3Q9CQ10 Gm25889-201ENSMUST00000157775 107 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Chmp3Q9CQ10 Rpl31-ps15-201ENSMUST00000181857 375 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Chmp3Q9CQ10 Gm45558-201ENSMUST00000209384 1895 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Chmp3Q9CQ10 Slc16a7-206ENSMUST00000211781 10981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
Chmp3Q9CQ10 CT025538.3-201ENSMUST00000225279 3848 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Chmp3Q9CQ10 Gm12128-201ENSMUST00000131013 2914 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
Chmp3Q9CQ10 Gm36669-201ENSMUST00000201757 3650 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
Chmp3Q9CQ10 Gm25280-201ENSMUST00000157269 101 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Chmp3Q9CQ10 Mir1927-201ENSMUST00000158579 109 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Chmp3Q9CQ10 Gm27792-201ENSMUST00000184031 115 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Chmp3Q9CQ10 Gm27505-201ENSMUST00000185071 110 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Chmp3Q9CQ10 n-R5s183-201ENSMUST00000083939 115 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Chmp3Q9CQ10 Olfr849-202ENSMUST00000217273 6140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
Chmp3Q9CQ10 Olfr898-203ENSMUST00000217063 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
Chmp3Q9CQ10 Gm45844-205ENSMUST00000210333 3861 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
Chmp3Q9CQ10 Gm14502-201ENSMUST00000118154 113 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Chmp3Q9CQ10 Gm24842-201ENSMUST00000158681 54 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Chmp3Q9CQ10 Gm27700-201ENSMUST00000185003 81 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Chmp3Q9CQ10 Gm37081-201ENSMUST00000192034 196 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Chmp3Q9CQ10 Gm44223-201ENSMUST00000204854 114 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Chmp3Q9CQ10 Gm9967-203ENSMUST00000206903 408 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Chmp3Q9CQ10 Gm46233-201ENSMUST00000217831 449 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Chmp3Q9CQ10 n-R5s40-201ENSMUST00000082475 124 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Chmp3Q9CQ10 Adgrg4-204ENSMUST00000153784 9329 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Chmp3Q9CQ10 Olfr652-204ENSMUST00000219111 5329 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Chmp3Q9CQ10 Olfr1168-202ENSMUST00000215996 2322 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Chmp3Q9CQ10 Gm13479-201ENSMUST00000130773 4722 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
Chmp3Q9CQ10 Olfr1270-204ENSMUST00000215975 4854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
Chmp3Q9CQ10 Naaladl2-202ENSMUST00000203414 9330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
Chmp3Q9CQ10 Gm38162-201ENSMUST00000195562 4597 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Chmp3Q9CQ10 Gm37320-201ENSMUST00000192781 4953 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Chmp3Q9CQ10 Gm25500-201ENSMUST00000104426 123 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Chmp3Q9CQ10 Gm12086-201ENSMUST00000120863 228 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Chmp3Q9CQ10 Gm24691-201ENSMUST00000157762 140 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Chmp3Q9CQ10 Gm24879-201ENSMUST00000158386 143 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Chmp3Q9CQ10 Gm25380-201ENSMUST00000175463 107 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Chmp3Q9CQ10 Gm23567-201ENSMUST00000178005 107 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Chmp3Q9CQ10 Gm24641-201ENSMUST00000178055 107 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Chmp3Q9CQ10 Gm25484-201ENSMUST00000178217 107 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Chmp3Q9CQ10 Gm26138-201ENSMUST00000179236 107 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Chmp3Q9CQ10 Gm22821-201ENSMUST00000179288 107 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Chmp3Q9CQ10 1700112D23Rik-202ENSMUST00000193387 299 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
Chmp3Q9CQ10 Gm23140-201ENSMUST00000082487 107 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Chmp3Q9CQ10 Gm23298-201ENSMUST00000083181 107 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Chmp3Q9CQ10 Gm24614-201ENSMUST00000083269 107 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Chmp3Q9CQ10 Gm22057-201ENSMUST00000083387 107 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Chmp3Q9CQ10 Gm25006-201ENSMUST00000083813 107 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Chmp3Q9CQ10 Gm25516-201ENSMUST00000083857 107 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Chmp3Q9CQ10 Olfr1245-202ENSMUST00000217402 2610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
Chmp3Q9CQ10 Gm42684-201ENSMUST00000197663 3615 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Chmp3Q9CQ10 Gm44489-201ENSMUST00000104619 97 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Chmp3Q9CQ10 Gm12954-201ENSMUST00000118610 611 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Chmp3Q9CQ10 Tnfaip8-206ENSMUST00000145726 632 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
Chmp3Q9CQ10 Gm26105-201ENSMUST00000157253 190 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Chmp3Q9CQ10 Gm45652-201ENSMUST00000210926 3831 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Chmp3Q9CQ10 Gm44177-201ENSMUST00000204338 2667 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Chmp3Q9CQ10 Olfr509-204ENSMUST00000215075 3418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
Chmp3Q9CQ10 Vmn1r29-204ENSMUST00000228038 4520 ntAPPRIS P1 BASIC3.46□□□□□ -1.86
Chmp3Q9CQ10 Gm24358-201ENSMUST00000158424 288 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Chmp3Q9CQ10 Gm23113-201ENSMUST00000158477 99 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Chmp3Q9CQ10 Gm25444-201ENSMUST00000158999 113 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Chmp3Q9CQ10 Gm8739-201ENSMUST00000185962 181 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
Chmp3Q9CQ10 Gm44491-201ENSMUST00000196794 96 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Chmp3Q9CQ10 Gm43521-201ENSMUST00000197838 255 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Chmp3Q9CQ10 Gm43107-201ENSMUST00000198729 255 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Chmp3Q9CQ10 Gm34314-201ENSMUST00000203622 367 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Chmp3Q9CQ10 AC125350.4-201ENSMUST00000225895 273 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Chmp3Q9CQ10 Gm25684-201ENSMUST00000083941 107 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
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