Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX13

Ube3d, E3 ubiquitin-protein ligase E3D, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3dQ8BX13 Zfp988-201ENSMUST00000148762 2800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
Ube3dQ8BX13 Olfr789-202ENSMUST00000213992 4421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
Ube3dQ8BX13 Igkv4-63-201ENSMUST00000103351 286 ntAPPRIS P1 BASIC2.6□□□□□ -1.99
Ube3dQ8BX13 Gm25376-201ENSMUST00000104340 133 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Ube3dQ8BX13 Snord90-201ENSMUST00000104568 111 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Ube3dQ8BX13 Gm23470-201ENSMUST00000157129 120 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Ube3dQ8BX13 Gm22338-201ENSMUST00000157715 129 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Ube3dQ8BX13 Gm23113-201ENSMUST00000158477 99 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Ube3dQ8BX13 Gm22946-201ENSMUST00000158558 82 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Ube3dQ8BX13 Gm27672-201ENSMUST00000183751 204 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Ube3dQ8BX13 Gm29613-201ENSMUST00000185846 313 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Ube3dQ8BX13 Gm29544-201ENSMUST00000188860 313 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Ube3dQ8BX13 Gm28808-201ENSMUST00000190978 313 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Ube3dQ8BX13 Gm44028-201ENSMUST00000205205 355 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
Ube3dQ8BX13 Gm44921-201ENSMUST00000205290 301 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Ube3dQ8BX13 Gpr174-202ENSMUST00000117310 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
Ube3dQ8BX13 Olfr166-202ENSMUST00000213531 4205 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
Ube3dQ8BX13 Zfp729b-201ENSMUST00000012873 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
Ube3dQ8BX13 Olfr1218-203ENSMUST00000215048 3900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Ube3dQ8BX13 Olfr1437-202ENSMUST00000207241 3751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Ube3dQ8BX13 Gm25879-201ENSMUST00000104330 107 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Ube3dQ8BX13 Gm14567-201ENSMUST00000117155 174 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Ube3dQ8BX13 Gm23390-201ENSMUST00000157393 106 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Ube3dQ8BX13 Gm26088-201ENSMUST00000157896 131 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Ube3dQ8BX13 Gm22966-201ENSMUST00000157957 129 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Ube3dQ8BX13 Gm24736-201ENSMUST00000158862 130 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Ube3dQ8BX13 Gm22775-201ENSMUST00000177630 120 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Ube3dQ8BX13 Gm23569-201ENSMUST00000180120 120 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Ube3dQ8BX13 Mir6350-201ENSMUST00000183639 105 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Ube3dQ8BX13 Mir6405-201ENSMUST00000184584 124 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Ube3dQ8BX13 Olfr880-ps1-201ENSMUST00000212344 229 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Ube3dQ8BX13 n-R5s183-201ENSMUST00000083939 115 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Ube3dQ8BX13 Gm44680-201ENSMUST00000208414 2910 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Ube3dQ8BX13 Vmn1r75-206ENSMUST00000228463 6508 ntAPPRIS P2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Ube3dQ8BX13 Gm42445-201ENSMUST00000196996 2893 ntBASIC2.59□□□□□ -2
Ube3dQ8BX13 Gm24049-201ENSMUST00000102409 100 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Ube3dQ8BX13 Gm25407-201ENSMUST00000104102 134 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Ube3dQ8BX13 Gm16021-201ENSMUST00000121176 219 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Ube3dQ8BX13 Gm11334-201ENSMUST00000121969 156 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Ube3dQ8BX13 Gm25828-201ENSMUST00000157087 95 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Ube3dQ8BX13 Gm27934-201ENSMUST00000158795 63 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Ube3dQ8BX13 Gm25996-201ENSMUST00000175393 117 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Ube3dQ8BX13 Gm22249-201ENSMUST00000082485 136 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Ube3dQ8BX13 Olfr124-204ENSMUST00000217365 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
Ube3dQ8BX13 Gm15069-201ENSMUST00000117792 192 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Ube3dQ8BX13 Gm15068-201ENSMUST00000119796 192 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Ube3dQ8BX13 Gm25373-201ENSMUST00000158156 115 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Ube3dQ8BX13 Gm26157-201ENSMUST00000158974 126 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Ube3dQ8BX13 Gm28282-201ENSMUST00000186072 186 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Ube3dQ8BX13 Gm29347-201ENSMUST00000186695 449 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
Ube3dQ8BX13 Gm24350-202ENSMUST00000198309 132 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Ube3dQ8BX13 Mir184-201ENSMUST00000083662 69 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Ube3dQ8BX13 Gm42785-201ENSMUST00000202316 3835 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Ube3dQ8BX13 Slc16a7-206ENSMUST00000211781 10981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
Ube3dQ8BX13 n-R5s15-201ENSMUST00000122635 111 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Ube3dQ8BX13 Gm22279-201ENSMUST00000157200 93 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Ube3dQ8BX13 Gm23854-201ENSMUST00000158378 108 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Ube3dQ8BX13 Gm26215-201ENSMUST00000158584 139 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Ube3dQ8BX13 Trav6-3-202ENSMUST00000183604 305 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
Ube3dQ8BX13 Gm30534-201ENSMUST00000217928 207 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Ube3dQ8BX13 AC124537.1-201ENSMUST00000222890 159 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Ube3dQ8BX13 AC130477.2-201ENSMUST00000228158 274 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Ube3dQ8BX13 mt-Ta-201ENSMUST00000082398 69 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Ube3dQ8BX13 Gm23249-201ENSMUST00000083369 161 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Ube3dQ8BX13 Mir301-201ENSMUST00000083655 86 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Ube3dQ8BX13 AL645643.1-201ENSMUST00000222438 3897 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Ube3dQ8BX13 Ccdc18-201ENSMUST00000047677 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
Ube3dQ8BX13 Olfr1442-204ENSMUST00000208657 3148 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
Ube3dQ8BX13 AC161250.2-201ENSMUST00000215114 3107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ube3dQ8BX13 Olfr921-202ENSMUST00000213958 4012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
Ube3dQ8BX13 Gm14626-201ENSMUST00000117619 216 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ube3dQ8BX13 Gm23044-201ENSMUST00000157891 100 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ube3dQ8BX13 Gm26897-201ENSMUST00000180627 93 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Ube3dQ8BX13 Gm43379-201ENSMUST00000196253 7726 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ube3dQ8BX13 Gm45027-201ENSMUST00000207081 78 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
Ube3dQ8BX13 AC165415.1-201ENSMUST00000228924 273 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ube3dQ8BX13 Gm22306-201ENSMUST00000082692 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ube3dQ8BX13 Olfr1450-202ENSMUST00000213587 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Ube3dQ8BX13 Traj44-201ENSMUST00000103698 61 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
Ube3dQ8BX13 Gm13246-201ENSMUST00000120994 315 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Ube3dQ8BX13 Gm7209-201ENSMUST00000122339 333 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Ube3dQ8BX13 Gm25270-201ENSMUST00000122606 138 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Ube3dQ8BX13 Gm25884-201ENSMUST00000157782 62 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Ube3dQ8BX13 Gm23409-201ENSMUST00000158516 237 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Ube3dQ8BX13 Gm18665-201ENSMUST00000189783 270 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Ube3dQ8BX13 Gm44903-201ENSMUST00000206840 130 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Ube3dQ8BX13 AC129085.1-201ENSMUST00000225263 165 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Ube3dQ8BX13 Gm24038-201ENSMUST00000082872 159 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Ube3dQ8BX13 Gm24616-201ENSMUST00000083274 139 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Ube3dQ8BX13 Ranbp2-201ENSMUST00000003310 9608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Ube3dQ8BX13 Zfp953-201ENSMUST00000081582 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Ube3dQ8BX13 Olfr1225-202ENSMUST00000216961 3231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
Ube3dQ8BX13 Gm42801-201ENSMUST00000202562 2865 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ube3dQ8BX13 Vmn1r29-203ENSMUST00000227761 4671 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
Ube3dQ8BX13 Vmn1r29-205ENSMUST00000228909 4658 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
Ube3dQ8BX13 Mir5123-201ENSMUST00000177794 83 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ube3dQ8BX13 Gm27700-201ENSMUST00000185003 81 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ube3dQ8BX13 Gm37007-201ENSMUST00000194234 319 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ube3dQ8BX13 Gm44976-201ENSMUST00000205543 261 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ube3dQ8BX13 Gm45492-201ENSMUST00000211611 288 ntBASIC2.53□□□□□ -2
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