Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 AL645643.1-201ENSMUST00000222438 3897 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Pggt1bQ8BUY9 AC154515.1-201ENSMUST00000226085 2841 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Pggt1bQ8BUY9 Lrrc19-202ENSMUST00000107101 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
Pggt1bQ8BUY9 Gm15214-201ENSMUST00000122155 470 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Pggt1bQ8BUY9 n-R5s189-201ENSMUST00000122675 114 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Pggt1bQ8BUY9 Gm25460-201ENSMUST00000157954 127 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Pggt1bQ8BUY9 Gm22483-201ENSMUST00000157986 274 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Pggt1bQ8BUY9 Gm22989-201ENSMUST00000158313 86 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Pggt1bQ8BUY9 Gm24277-201ENSMUST00000158661 104 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Pggt1bQ8BUY9 Gm44666-201ENSMUST00000208544 391 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Pggt1bQ8BUY9 Gm34276-201ENSMUST00000222558 439 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
Pggt1bQ8BUY9 CT025579.1-201ENSMUST00000223779 366 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Pggt1bQ8BUY9 AC124182.1-201ENSMUST00000227091 321 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Pggt1bQ8BUY9 Gm25130-201ENSMUST00000082650 156 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Pggt1bQ8BUY9 Mir423-201ENSMUST00000083584 109 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Pggt1bQ8BUY9 Snord7-201ENSMUST00000083781 97 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Pggt1bQ8BUY9 Gm22154-201ENSMUST00000083844 131 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Pggt1bQ8BUY9 Olfr561-202ENSMUST00000213432 2498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
Pggt1bQ8BUY9 Olfr1148-202ENSMUST00000215230 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
Pggt1bQ8BUY9 Zfy2-201ENSMUST00000115891 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.09
Pggt1bQ8BUY9 Zfp273-201ENSMUST00000012725 2277 ntTSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
Pggt1bQ8BUY9 Gm14914-201ENSMUST00000117576 2031 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Pggt1bQ8BUY9 n-R5s158-201ENSMUST00000104095 118 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Pggt1bQ8BUY9 Gm14775-201ENSMUST00000122089 310 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Pggt1bQ8BUY9 Gm24237-201ENSMUST00000157790 132 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Pggt1bQ8BUY9 Gm25642-201ENSMUST00000175137 66 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Pggt1bQ8BUY9 Gm24813-201ENSMUST00000175310 84 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Pggt1bQ8BUY9 Gm23963-201ENSMUST00000179603 77 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Pggt1bQ8BUY9 Gm27979-201ENSMUST00000185126 56 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Pggt1bQ8BUY9 Snord80-202ENSMUST00000199023 77 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Pggt1bQ8BUY9 Gm44482-201ENSMUST00000199232 103 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Pggt1bQ8BUY9 Gm44256-201ENSMUST00000203304 335 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Pggt1bQ8BUY9 AC164561.1-201ENSMUST00000220414 115 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Pggt1bQ8BUY9 AC154282.1-201ENSMUST00000223154 265 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Pggt1bQ8BUY9 Gm25895-201ENSMUST00000083714 100 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Pggt1bQ8BUY9 Gm42862-201ENSMUST00000197494 2621 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Pggt1bQ8BUY9 Usp9y-201ENSMUST00000091188 8094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
Pggt1bQ8BUY9 Tlr8-202ENSMUST00000112170 3431 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
Pggt1bQ8BUY9 Gm26293-201ENSMUST00000104170 84 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Pggt1bQ8BUY9 Gm13801-201ENSMUST00000120750 160 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Pggt1bQ8BUY9 Gm11192-201ENSMUST00000127017 151 ntTSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
Pggt1bQ8BUY9 Gm22535-201ENSMUST00000158174 119 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Pggt1bQ8BUY9 Mir21b-201ENSMUST00000184317 108 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Pggt1bQ8BUY9 Gm44182-201ENSMUST00000204052 115 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Pggt1bQ8BUY9 AC150901.1-201ENSMUST00000208407 145 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Pggt1bQ8BUY9 Gm25081-201ENSMUST00000082534 108 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Pggt1bQ8BUY9 Olfr1046-202ENSMUST00000213987 2770 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
Pggt1bQ8BUY9 Gm15314-201ENSMUST00000120740 1887 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
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Pggt1bQ8BUY9 Mir344e-201ENSMUST00000104677 66 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Pggt1bQ8BUY9 Cox20-ps-201ENSMUST00000119872 353 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Pggt1bQ8BUY9 Gm15861-201ENSMUST00000120979 339 ntBASIC2□□□□□ -2.09
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Pggt1bQ8BUY9 Gm17020-201ENSMUST00000172274 274 ntBASIC2□□□□□ -2.09
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Pggt1bQ8BUY9 Gm43587-201ENSMUST00000199590 204 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Pggt1bQ8BUY9 Mir7215-201ENSMUST00000200383 51 ntBASIC2□□□□□ -2.09
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Pggt1bQ8BUY9 AC151902.2-201ENSMUST00000226419 301 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Pggt1bQ8BUY9 Skint5-203ENSMUST00000170105 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
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Pggt1bQ8BUY9 Gm17490-201ENSMUST00000166779 63 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
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Pggt1bQ8BUY9 Gm24358-201ENSMUST00000158424 288 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Pggt1bQ8BUY9 Gm27443-201ENSMUST00000184660 98 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Pggt1bQ8BUY9 Gm25142-201ENSMUST00000082698 107 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Pggt1bQ8BUY9 Gm25124-201ENSMUST00000083345 164 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Pggt1bQ8BUY9 Gm44114-201ENSMUST00000203270 2727 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Pggt1bQ8BUY9 Ifi203-205ENSMUST00000129829 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
Pggt1bQ8BUY9 Knl1-202ENSMUST00000028802 7800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
Pggt1bQ8BUY9 Gm22051-201ENSMUST00000117002 127 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Pggt1bQ8BUY9 Gm3788-201ENSMUST00000119949 136 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Pggt1bQ8BUY9 Gm20438-201ENSMUST00000174441 329 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Pggt1bQ8BUY9 Gm26097-201ENSMUST00000179642 93 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Pggt1bQ8BUY9 Gm23966-201ENSMUST00000179823 107 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Pggt1bQ8BUY9 Mir7016-201ENSMUST00000184308 72 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Pggt1bQ8BUY9 Gm27991-201ENSMUST00000184804 137 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Pggt1bQ8BUY9 Gm44564-201ENSMUST00000207985 180 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Pggt1bQ8BUY9 Gm45791-201ENSMUST00000212908 352 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
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