Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGQ1

Vipas39, Spermatogenesis-defective protein 39 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vipas39Q8BGQ1 Gm44373-201ENSMUST00000196112 169 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Vipas39Q8BGQ1 Gm44491-201ENSMUST00000196794 96 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Vipas39Q8BGQ1 4930598N05Rik-207ENSMUST00000208997 83 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
Vipas39Q8BGQ1 Gm45616-201ENSMUST00000211711 319 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Vipas39Q8BGQ1 AC129202.1-201ENSMUST00000224895 526 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Vipas39Q8BGQ1 Gm24536-201ENSMUST00000083144 107 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Vipas39Q8BGQ1 Gm24764-201ENSMUST00000083686 199 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Vipas39Q8BGQ1 Rps24-ps2-201ENSMUST00000091375 395 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Vipas39Q8BGQ1 Gm11794-201ENSMUST00000119446 237 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Vipas39Q8BGQ1 Gm13967-201ENSMUST00000120404 380 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Vipas39Q8BGQ1 Mir1904-201ENSMUST00000122702 80 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Vipas39Q8BGQ1 Defb44-ps-201ENSMUST00000126871 219 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Vipas39Q8BGQ1 Gm24510-201ENSMUST00000174965 94 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Vipas39Q8BGQ1 Gm25730-201ENSMUST00000178753 165 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Vipas39Q8BGQ1 Tmem167-ps2-201ENSMUST00000190251 214 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Vipas39Q8BGQ1 Gm42594-201ENSMUST00000199511 246 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Vipas39Q8BGQ1 Gm29818-201ENSMUST00000218070 165 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Vipas39Q8BGQ1 AC154552.1-201ENSMUST00000222969 202 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Vipas39Q8BGQ1 Gm26447-201ENSMUST00000082448 129 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Vipas39Q8BGQ1 Gm24164-201ENSMUST00000093663 104 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Vipas39Q8BGQ1 4921511C20Rik-201ENSMUST00000051530 1606 ntAPPRIS P1 BASIC1.3□□□□□ -2.2
Vipas39Q8BGQ1 Gm26624-201ENSMUST00000181486 3769 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
Vipas39Q8BGQ1 Mir223-201ENSMUST00000102112 110 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Vipas39Q8BGQ1 Igkv13-84-201ENSMUST00000103339 347 ntAPPRIS P1 BASIC1.3□□□□□ -2.2
Vipas39Q8BGQ1 Igkv4-63-201ENSMUST00000103351 286 ntAPPRIS P1 BASIC1.3□□□□□ -2.2
Vipas39Q8BGQ1 Gm23336-201ENSMUST00000117023 123 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Vipas39Q8BGQ1 Gm24851-201ENSMUST00000158028 103 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Vipas39Q8BGQ1 Mir6419-201ENSMUST00000184784 113 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Vipas39Q8BGQ1 Gm45907-201ENSMUST00000213023 193 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Vipas39Q8BGQ1 Olfr1070-ps1-201ENSMUST00000215939 388 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Vipas39Q8BGQ1 Gm31447-201ENSMUST00000222345 384 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
Vipas39Q8BGQ1 AC239878.2-201ENSMUST00000224048 464 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Vipas39Q8BGQ1 Gm9772-201ENSMUST00000075018 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
Vipas39Q8BGQ1 Gm25409-201ENSMUST00000083764 131 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Vipas39Q8BGQ1 Olfr1151-202ENSMUST00000217376 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
Vipas39Q8BGQ1 Trgj3-201ENSMUST00000103562 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.29□□□□□ -2.2
Vipas39Q8BGQ1 Gm22935-201ENSMUST00000103960 104 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Vipas39Q8BGQ1 Gm15213-201ENSMUST00000122098 216 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Vipas39Q8BGQ1 Gm12869-201ENSMUST00000156265 344 ntTSL 2 BASIC1.29□□□□□ -2.2
Vipas39Q8BGQ1 Gm27723-201ENSMUST00000157398 63 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Vipas39Q8BGQ1 Gm27905-201ENSMUST00000184005 207 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Vipas39Q8BGQ1 Mir465d-201ENSMUST00000196314 58 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Vipas39Q8BGQ1 Gm29865-201ENSMUST00000197726 451 ntTSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
Vipas39Q8BGQ1 CU062626.2-201ENSMUST00000223953 274 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Vipas39Q8BGQ1 Mucl1-202ENSMUST00000226484 758 ntAPPRIS P5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
Vipas39Q8BGQ1 Gm22980-201ENSMUST00000082608 70 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Vipas39Q8BGQ1 Snora3-201ENSMUST00000083082 132 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Vipas39Q8BGQ1 AC161250.2-201ENSMUST00000215114 3107 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Vipas39Q8BGQ1 Olfr188-ps1-201ENSMUST00000205766 4706 ntTSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
Vipas39Q8BGQ1 Gm25914-201ENSMUST00000157618 153 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Vipas39Q8BGQ1 Gm26402-201ENSMUST00000158499 113 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Vipas39Q8BGQ1 Gm17196-201ENSMUST00000164074 345 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
Vipas39Q8BGQ1 Gm23267-201ENSMUST00000178490 132 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Vipas39Q8BGQ1 Gm28881-201ENSMUST00000187710 470 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
Vipas39Q8BGQ1 Gm28849-201ENSMUST00000188127 174 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Vipas39Q8BGQ1 Gm28330-201ENSMUST00000190353 171 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Vipas39Q8BGQ1 AC127371.3-201ENSMUST00000228129 415 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Vipas39Q8BGQ1 AC170600.1-201ENSMUST00000228763 277 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Vipas39Q8BGQ1 Olfr307-203ENSMUST00000217494 4515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
Vipas39Q8BGQ1 Traj20-201ENSMUST00000103721 58 ntAPPRIS P1 BASIC1.27□□□□□ -2.21
Vipas39Q8BGQ1 Gm25541-201ENSMUST00000116888 126 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Vipas39Q8BGQ1 Gm12837-201ENSMUST00000120131 373 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Vipas39Q8BGQ1 Gm11606-201ENSMUST00000120706 617 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Vipas39Q8BGQ1 Gm22027-201ENSMUST00000122737 127 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Vipas39Q8BGQ1 Gm22883-201ENSMUST00000157376 106 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Vipas39Q8BGQ1 Gm24277-201ENSMUST00000158661 104 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Vipas39Q8BGQ1 Gm25936-201ENSMUST00000179952 114 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Vipas39Q8BGQ1 AC168056.1-201ENSMUST00000225270 180 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Vipas39Q8BGQ1 AC115735.2-201ENSMUST00000227135 351 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Vipas39Q8BGQ1 Mir221-201ENSMUST00000083488 95 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Vipas39Q8BGQ1 Gm24283-201ENSMUST00000104233 107 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Vipas39Q8BGQ1 Gm11322-201ENSMUST00000118095 435 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Vipas39Q8BGQ1 Gm23390-201ENSMUST00000157393 106 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Vipas39Q8BGQ1 Gm23579-201ENSMUST00000158528 103 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Vipas39Q8BGQ1 Gm24677-201ENSMUST00000158755 150 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Vipas39Q8BGQ1 Mir3098-201ENSMUST00000175416 87 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Vipas39Q8BGQ1 Gm27326-201ENSMUST00000183504 95 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Vipas39Q8BGQ1 Gm20923-201ENSMUST00000190009 319 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Vipas39Q8BGQ1 Gm21088-201ENSMUST00000190875 316 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Vipas39Q8BGQ1 Gm37146-201ENSMUST00000192572 463 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
Vipas39Q8BGQ1 AC125167.1-201ENSMUST00000198698 141 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Vipas39Q8BGQ1 AC160863.1-201ENSMUST00000218412 317 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Vipas39Q8BGQ1 Gm25357-201ENSMUST00000082745 72 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Vipas39Q8BGQ1 Zfp600-201ENSMUST00000092750 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
Vipas39Q8BGQ1 Mir767-201ENSMUST00000103256 107 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Vipas39Q8BGQ1 Gm14919-201ENSMUST00000120839 390 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Vipas39Q8BGQ1 Gm24847-201ENSMUST00000158032 108 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Vipas39Q8BGQ1 Gm23967-201ENSMUST00000175062 78 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Vipas39Q8BGQ1 Gm27521-201ENSMUST00000184022 64 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Vipas39Q8BGQ1 Gm28912-201ENSMUST00000189001 234 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Vipas39Q8BGQ1 Gm38060-201ENSMUST00000194822 464 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Vipas39Q8BGQ1 Olfr454-ps1-201ENSMUST00000205206 348 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Vipas39Q8BGQ1 AC163295.1-201ENSMUST00000227840 314 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Vipas39Q8BGQ1 Gm10092-201ENSMUST00000077110 180 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Vipas39Q8BGQ1 Defb50-201ENSMUST00000078879 373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
Vipas39Q8BGQ1 Mir211-201ENSMUST00000083651 106 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Vipas39Q8BGQ1 AC133934.2-201ENSMUST00000221729 4129 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Vipas39Q8BGQ1 Gm13231-201ENSMUST00000119218 2850 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Vipas39Q8BGQ1 Mir293-201ENSMUST00000104841 80 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Vipas39Q8BGQ1 Fau-ps1-201ENSMUST00000119675 252 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
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