Protein–RNA interactions for Protein: Q3U827

Rnf180, E3 ubiquitin-protein ligase RNF180, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf180Q3U827 Gm14491-201ENSMUST00000121919 199 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Rnf180Q3U827 Gm21903-201ENSMUST00000178039 90 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Rnf180Q3U827 Gm44564-201ENSMUST00000207985 180 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Rnf180Q3U827 AC154328.1-201ENSMUST00000225875 307 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Rnf180Q3U827 AC158982.2-201ENSMUST00000226283 184 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Rnf180Q3U827 Gm25204-201ENSMUST00000082843 106 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Rnf180Q3U827 Gm22421-201ENSMUST00000083058 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Rnf180Q3U827 Gm22972-201ENSMUST00000083297 131 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Rnf180Q3U827 Gm24762-201ENSMUST00000083689 104 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Rnf180Q3U827 Olfr791-202ENSMUST00000217228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Rnf180Q3U827 Gm19965-201ENSMUST00000179777 3030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Rnf180Q3U827 Gm6325-201ENSMUST00000122015 3114 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Rnf180Q3U827 Gm24598-201ENSMUST00000122510 74 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Rnf180Q3U827 Gm23967-201ENSMUST00000175062 78 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Rnf180Q3U827 Gm24573-201ENSMUST00000175499 112 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Rnf180Q3U827 Gm15235-201ENSMUST00000200572 194 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Rnf180Q3U827 Gm5002-201ENSMUST00000207145 223 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Rnf180Q3U827 Gm44666-201ENSMUST00000208544 391 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Rnf180Q3U827 AC153964.2-201ENSMUST00000217704 2474 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Rnf180Q3U827 Zfp966-201ENSMUST00000108949 2939 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Rnf180Q3U827 Gm42862-201ENSMUST00000197494 2621 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Rnf180Q3U827 Gm25496-201ENSMUST00000104430 120 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Rnf180Q3U827 Gm26412-201ENSMUST00000157666 55 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Rnf180Q3U827 Gm26482-201ENSMUST00000158015 62 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Rnf180Q3U827 Gm22159-201ENSMUST00000158412 130 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Rnf180Q3U827 Gm24001-201ENSMUST00000158463 85 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Rnf180Q3U827 Gm26405-201ENSMUST00000158495 100 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Rnf180Q3U827 AC164086.1-201ENSMUST00000221038 289 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Rnf180Q3U827 Gm22704-201ENSMUST00000083027 137 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Rnf180Q3U827 Mir340-201ENSMUST00000083483 98 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Rnf180Q3U827 AL645643.1-201ENSMUST00000222438 3897 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Rnf180Q3U827 Olfr109-203ENSMUST00000214938 5550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
Rnf180Q3U827 Gm2869-201ENSMUST00000124359 2621 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Rnf180Q3U827 Gm12449-201ENSMUST00000117572 234 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Rnf180Q3U827 Gm2830-201ENSMUST00000140330 385 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Rnf180Q3U827 Gm12869-201ENSMUST00000156265 344 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Rnf180Q3U827 Gm24015-201ENSMUST00000157725 232 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Rnf180Q3U827 Gm22483-201ENSMUST00000157986 274 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Rnf180Q3U827 Gm22535-201ENSMUST00000158174 119 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Rnf180Q3U827 Gm26022-201ENSMUST00000158663 108 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Rnf180Q3U827 Gm24106-201ENSMUST00000175498 127 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Rnf180Q3U827 Gm27668-201ENSMUST00000184188 120 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Rnf180Q3U827 Gm45116-201ENSMUST00000207392 275 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Rnf180Q3U827 AC122828.3-201ENSMUST00000223019 3915 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Rnf180Q3U827 Gm37063-201ENSMUST00000194678 3520 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Rnf180Q3U827 Gm37331-201ENSMUST00000192367 3375 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Rnf180Q3U827 Zfp953-201ENSMUST00000081582 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
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Rnf180Q3U827 Mir1951-201ENSMUST00000157981 89 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
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Rnf180Q3U827 Gm22129-201ENSMUST00000179034 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
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Rnf180Q3U827 Mir721-201ENSMUST00000200230 88 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Rnf180Q3U827 Mucl1-202ENSMUST00000226484 758 ntAPPRIS P5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
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Rnf180Q3U827 Gm23101-201ENSMUST00000157550 137 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Rnf180Q3U827 Gm34139-201ENSMUST00000196166 294 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
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Rnf180Q3U827 AC133934.2-201ENSMUST00000221729 4129 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Rnf180Q3U827 Zfp960-201ENSMUST00000127027 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
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Rnf180Q3U827 Mir669k-201ENSMUST00000177742 127 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Rnf180Q3U827 Rnu6-ps2-201ENSMUST00000178059 107 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
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Rnf180Q3U827 Gm28344-201ENSMUST00000185704 279 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Rnf180Q3U827 Igkv5-40-1-201ENSMUST00000196457 359 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
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Rnf180Q3U827 Gm46993-201ENSMUST00000220708 259 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Rnf180Q3U827 Gm25895-201ENSMUST00000083714 100 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Rnf180Q3U827 Olfr1202-202ENSMUST00000214703 3665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Rnf180Q3U827 Olfr166-203ENSMUST00000216465 4371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Rnf180Q3U827 Gm23990-201ENSMUST00000117031 117 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Rnf180Q3U827 Gm23642-201ENSMUST00000157858 258 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Rnf180Q3U827 Gm22075-201ENSMUST00000158599 192 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Rnf180Q3U827 Snord80-202ENSMUST00000199023 77 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Rnf180Q3U827 AC160863.1-201ENSMUST00000218412 317 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Rnf180Q3U827 Gm25813-201ENSMUST00000082748 191 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Rnf180Q3U827 Gm25124-201ENSMUST00000083345 164 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Rnf180Q3U827 Tlr3-202ENSMUST00000167106 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
Rnf180Q3U827 Gm44527-201ENSMUST00000182210 2945 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Rnf180Q3U827 Olfr801-203ENSMUST00000213294 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Rnf180Q3U827 Olfr339-202ENSMUST00000216645 4867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Rnf180Q3U827 Gm14748-201ENSMUST00000119819 411 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Rnf180Q3U827 Gm25945-201ENSMUST00000122484 135 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Rnf180Q3U827 Gm23324-201ENSMUST00000157421 131 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
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