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| Cpne9 | Q1RLL3 | Gm23095-201 | ENSMUST00000083446 | 107 nt | BASIC | 0.71 | □□□□□ -2.3 | | |
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| Cpne9 | Q1RLL3 | Gm24283-201 | ENSMUST00000104233 | 107 nt | BASIC | 0.7 | □□□□□ -2.3 | | |
| Cpne9 | Q1RLL3 | Gm22673-201 | ENSMUST00000104415 | 131 nt | BASIC | 0.7 | □□□□□ -2.3 | | |
| Cpne9 | Q1RLL3 | Gm22149-201 | ENSMUST00000104442 | 136 nt | BASIC | 0.7 | □□□□□ -2.3 | | |
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| Cpne9 | Q1RLL3 | Trav5d-3-201 | ENSMUST00000170041 | 270 nt | BASIC | 0.7 | □□□□□ -2.3 | | |
| Cpne9 | Q1RLL3 | Gm22802-201 | ENSMUST00000175621 | 89 nt | BASIC | 0.7 | □□□□□ -2.3 | | |
| Cpne9 | Q1RLL3 | Gm21954-201 | ENSMUST00000179544 | 51 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 0.7 | □□□□□ -2.3 | | |
| Cpne9 | Q1RLL3 | Gm19777-201 | ENSMUST00000191940 | 358 nt | BASIC | 0.7 | □□□□□ -2.3 | | |
| Cpne9 | Q1RLL3 | Gm42533-201 | ENSMUST00000196247 | 157 nt | BASIC | 0.7 | □□□□□ -2.3 | | |
| Cpne9 | Q1RLL3 | Gm44358-201 | ENSMUST00000196301 | 98 nt | BASIC | 0.7 | □□□□□ -2.3 | | |
| Cpne9 | Q1RLL3 | AC125311.1-201 | ENSMUST00000226950 | 220 nt | BASIC | 0.7 | □□□□□ -2.3 | | |
| Cpne9 | Q1RLL3 | Gm23625-201 | ENSMUST00000082457 | 100 nt | BASIC | 0.7 | □□□□□ -2.3 | | |
| Cpne9 | Q1RLL3 | Gm24042-201 | ENSMUST00000083114 | 103 nt | BASIC | 0.7 | □□□□□ -2.3 | | |
| Cpne9 | Q1RLL3 | Gm6377-201 | ENSMUST00000060013 | 2793 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 0.7 | □□□□□ -2.3 | | |
| Cpne9 | Q1RLL3 | Gm24379-201 | ENSMUST00000122695 | 86 nt | BASIC | 0.69 | □□□□□ -2.3 | | |
| Cpne9 | Q1RLL3 | Gm13565-201 | ENSMUST00000133596 | 700 nt | TSL 1 (best) BASIC | 0.69 | □□□□□ -2.3 | | |
| Cpne9 | Q1RLL3 | Vmn2r-ps65-201 | ENSMUST00000173309 | 220 nt | BASIC | 0.69 | □□□□□ -2.3 | | |
| Cpne9 | Q1RLL3 | Mir344d-3-201 | ENSMUST00000175458 | 80 nt | BASIC | 0.69 | □□□□□ -2.3 | | |
| Cpne9 | Q1RLL3 | Gm25750-201 | ENSMUST00000175483 | 112 nt | BASIC | 0.69 | □□□□□ -2.3 | | |
| Cpne9 | Q1RLL3 | Il6st-202 | ENSMUST00000183513 | 201 nt | TSL 5 BASIC | 0.69 | □□□□□ -2.3 | | |
| Cpne9 | Q1RLL3 | Gm28921-201 | ENSMUST00000190219 | 378 nt | BASIC | 0.69 | □□□□□ -2.3 | | |
| Cpne9 | Q1RLL3 | Gm29022-201 | ENSMUST00000190702 | 225 nt | BASIC | 0.69 | □□□□□ -2.3 | | |
| Cpne9 | Q1RLL3 | Gm44396-201 | ENSMUST00000199843 | 114 nt | BASIC | 0.69 | □□□□□ -2.3 | | |
| Cpne9 | Q1RLL3 | Gm25929-201 | ENSMUST00000082784 | 107 nt | BASIC | 0.69 | □□□□□ -2.3 | | |
| Cpne9 | Q1RLL3 | Gm26329-201 | ENSMUST00000093723 | 110 nt | BASIC | 0.69 | □□□□□ -2.3 | | |
| Cpne9 | Q1RLL3 | Gm21897-201 | ENSMUST00000178312 | 1500 nt | APPRIS P1 BASIC | 0.69 | □□□□□ -2.3 | | |