Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Gm23836-201ENSMUST00000104434 129 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
Cpne9Q1RLL3 Gm25663-201ENSMUST00000157698 135 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
Cpne9Q1RLL3 Gm24498-201ENSMUST00000158445 102 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
Cpne9Q1RLL3 Gm16405-201ENSMUST00000169247 468 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC0.74□□□□□ -2.29
Cpne9Q1RLL3 Mir3061-201ENSMUST00000175129 91 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
Cpne9Q1RLL3 Mir5104-201ENSMUST00000175319 94 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
Cpne9Q1RLL3 Gm7958-201ENSMUST00000178255 468 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
Cpne9Q1RLL3 Gm7950-201ENSMUST00000179633 468 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
Cpne9Q1RLL3 Gm26200-201ENSMUST00000180273 79 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
Cpne9Q1RLL3 Gm10105-201ENSMUST00000184601 270 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
Cpne9Q1RLL3 Gm10421-202ENSMUST00000186114 132 ntTSL 3 BASIC0.74□□□□□ -2.29
Cpne9Q1RLL3 Gm29276-201ENSMUST00000190453 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.74□□□□□ -2.29
Cpne9Q1RLL3 Gm44325-201ENSMUST00000196757 77 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
Cpne9Q1RLL3 Gm42719-201ENSMUST00000197393 355 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
Cpne9Q1RLL3 Gm44410-201ENSMUST00000203151 341 ntTSL 3 BASIC0.74□□□□□ -2.29
Cpne9Q1RLL3 Gm43898-201ENSMUST00000204456 424 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
Cpne9Q1RLL3 Gm44085-201ENSMUST00000205056 372 ntTSL 3 BASIC0.74□□□□□ -2.29
Cpne9Q1RLL3 Gm23735-201ENSMUST00000082551 134 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
Cpne9Q1RLL3 Gm22306-201ENSMUST00000082692 107 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
Cpne9Q1RLL3 Gm24579-201ENSMUST00000103964 144 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
Cpne9Q1RLL3 Gm22545-201ENSMUST00000104350 132 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
Cpne9Q1RLL3 Gm26301-201ENSMUST00000104813 95 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
Cpne9Q1RLL3 Gm12432-201ENSMUST00000119540 186 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
Cpne9Q1RLL3 Gm13518-201ENSMUST00000120018 233 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
Cpne9Q1RLL3 Gm11835-201ENSMUST00000120635 663 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
Cpne9Q1RLL3 Gm25781-201ENSMUST00000122527 84 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
Cpne9Q1RLL3 Gm22477-201ENSMUST00000122569 316 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
Cpne9Q1RLL3 Gm11240-201ENSMUST00000142047 751 ntTSL 1 (best) BASIC0.73□□□□□ -2.29
Cpne9Q1RLL3 Gm27974-201ENSMUST00000183415 105 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
Cpne9Q1RLL3 Gm27656-201ENSMUST00000185055 80 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
Cpne9Q1RLL3 Gm28408-201ENSMUST00000191557 463 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
Cpne9Q1RLL3 Gm37399-201ENSMUST00000195224 416 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
Cpne9Q1RLL3 Gm36953-201ENSMUST00000195295 268 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
Cpne9Q1RLL3 AC122905.2-201ENSMUST00000220325 269 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
Cpne9Q1RLL3 AC154636.2-201ENSMUST00000222538 161 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
Cpne9Q1RLL3 AC173482.5-201ENSMUST00000224181 327 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
Cpne9Q1RLL3 Gm24038-201ENSMUST00000082872 159 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
Cpne9Q1RLL3 Rny3-201ENSMUST00000083011 102 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
Cpne9Q1RLL3 Gm10542-201ENSMUST00000097586 273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.73□□□□□ -2.29
Cpne9Q1RLL3 Gm12080-201ENSMUST00000119821 1883 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
Cpne9Q1RLL3 Arhgap5-204ENSMUST00000219443 9323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.72□□□□□ -2.29
Cpne9Q1RLL3 Traj45-201ENSMUST00000103697 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.72□□□□□ -2.29
Cpne9Q1RLL3 Gm22544-201ENSMUST00000104349 127 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
Cpne9Q1RLL3 Snord71-201ENSMUST00000104361 85 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
Cpne9Q1RLL3 Gm22215-201ENSMUST00000157558 96 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
Cpne9Q1RLL3 Gm22403-201ENSMUST00000174919 84 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
Cpne9Q1RLL3 Gm28927-201ENSMUST00000191528 272 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
Cpne9Q1RLL3 Mir376a-201ENSMUST00000197584 68 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
Cpne9Q1RLL3 Gm44465-201ENSMUST00000199536 114 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
Cpne9Q1RLL3 AC164161.1-201ENSMUST00000214076 639 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
Cpne9Q1RLL3 AC098718.1-201ENSMUST00000226166 175 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
Cpne9Q1RLL3 Gm24261-201ENSMUST00000083744 104 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
Cpne9Q1RLL3 Gm22003-201ENSMUST00000101885 107 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
Cpne9Q1RLL3 Mir465b-1-201ENSMUST00000103940 79 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
Cpne9Q1RLL3 Mir465b-2-201ENSMUST00000104662 79 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
Cpne9Q1RLL3 Sval2-202ENSMUST00000119995 463 ntTSL 3 BASIC0.71□□□□□ -2.3
Cpne9Q1RLL3 Gm14574-201ENSMUST00000120644 279 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
Cpne9Q1RLL3 Rhox11-ps3-201ENSMUST00000121166 233 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
Cpne9Q1RLL3 Gm16358-201ENSMUST00000146046 210 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
Cpne9Q1RLL3 Gm23759-201ENSMUST00000158351 268 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
Cpne9Q1RLL3 Obox4-ps37-201ENSMUST00000177223 276 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
Cpne9Q1RLL3 Gm23410-201ENSMUST00000179967 107 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
Cpne9Q1RLL3 Gm22756-201ENSMUST00000180118 107 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
Cpne9Q1RLL3 Gm27317-201ENSMUST00000183533 95 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
Cpne9Q1RLL3 Gm27420-201ENSMUST00000183823 79 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
Cpne9Q1RLL3 Gm43250-201ENSMUST00000196536 273 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
Cpne9Q1RLL3 AC157476.1-201ENSMUST00000215555 169 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
Cpne9Q1RLL3 AC102369.1-201ENSMUST00000218415 373 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
Cpne9Q1RLL3 Gm24966-201ENSMUST00000082443 79 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
Cpne9Q1RLL3 Gm22505-201ENSMUST00000082956 108 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
Cpne9Q1RLL3 Gm22363-201ENSMUST00000083100 108 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
Cpne9Q1RLL3 Gm23814-201ENSMUST00000083230 102 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
Cpne9Q1RLL3 Gm23095-201ENSMUST00000083446 107 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
Cpne9Q1RLL3 Olfr921-202ENSMUST00000213958 4012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.71□□□□□ -2.3
Cpne9Q1RLL3 Gm24283-201ENSMUST00000104233 107 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
Cpne9Q1RLL3 Gm22673-201ENSMUST00000104415 131 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
Cpne9Q1RLL3 Gm22149-201ENSMUST00000104442 136 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
Cpne9Q1RLL3 Mup-ps22-201ENSMUST00000121611 243 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
Cpne9Q1RLL3 Trav5d-3-201ENSMUST00000170041 270 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
Cpne9Q1RLL3 Gm22802-201ENSMUST00000175621 89 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
Cpne9Q1RLL3 Gm21954-201ENSMUST00000179544 51 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.7□□□□□ -2.3
Cpne9Q1RLL3 Gm19777-201ENSMUST00000191940 358 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
Cpne9Q1RLL3 Gm42533-201ENSMUST00000196247 157 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
Cpne9Q1RLL3 Gm44358-201ENSMUST00000196301 98 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
Cpne9Q1RLL3 AC125311.1-201ENSMUST00000226950 220 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
Cpne9Q1RLL3 Gm23625-201ENSMUST00000082457 100 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
Cpne9Q1RLL3 Gm24042-201ENSMUST00000083114 103 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
Cpne9Q1RLL3 Gm6377-201ENSMUST00000060013 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.7□□□□□ -2.3
Cpne9Q1RLL3 Gm24379-201ENSMUST00000122695 86 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
Cpne9Q1RLL3 Gm13565-201ENSMUST00000133596 700 ntTSL 1 (best) BASIC0.69□□□□□ -2.3
Cpne9Q1RLL3 Vmn2r-ps65-201ENSMUST00000173309 220 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
Cpne9Q1RLL3 Mir344d-3-201ENSMUST00000175458 80 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
Cpne9Q1RLL3 Gm25750-201ENSMUST00000175483 112 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
Cpne9Q1RLL3 Il6st-202ENSMUST00000183513 201 ntTSL 5 BASIC0.69□□□□□ -2.3
Cpne9Q1RLL3 Gm28921-201ENSMUST00000190219 378 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
Cpne9Q1RLL3 Gm29022-201ENSMUST00000190702 225 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
Cpne9Q1RLL3 Gm44396-201ENSMUST00000199843 114 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
Cpne9Q1RLL3 Gm25929-201ENSMUST00000082784 107 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
Cpne9Q1RLL3 Gm26329-201ENSMUST00000093723 110 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
Cpne9Q1RLL3 Gm21897-201ENSMUST00000178312 1500 ntAPPRIS P1 BASIC0.69□□□□□ -2.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.7 ms