Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Gm43046-201ENSMUST00000198771 2451 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Sh3bp1P55194 Gm22097-201ENSMUST00000157929 278 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Sh3bp1P55194 Gm23892-201ENSMUST00000158105 130 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Sh3bp1P55194 Gm24006-201ENSMUST00000158462 132 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Sh3bp1P55194 Gm38064-201ENSMUST00000194032 444 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
Sh3bp1P55194 Hmgb1l-201ENSMUST00000082150 571 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Sh3bp1P55194 Gm24042-201ENSMUST00000083114 103 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Sh3bp1P55194 Gm24098-201ENSMUST00000102075 109 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Sh3bp1P55194 Gm25381-201ENSMUST00000102078 109 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Sh3bp1P55194 n-R5s158-201ENSMUST00000104095 118 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Sh3bp1P55194 Gm23015-201ENSMUST00000104145 128 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Sh3bp1P55194 Gm24415-201ENSMUST00000180218 107 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Sh3bp1P55194 Gm33051-201ENSMUST00000192940 274 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
Sh3bp1P55194 Gm44384-201ENSMUST00000200208 114 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Sh3bp1P55194 Gm44533-201ENSMUST00000207782 268 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Sh3bp1P55194 AC132615.1-201ENSMUST00000213873 255 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Sh3bp1P55194 Olfr1029-202ENSMUST00000217244 3743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
Sh3bp1P55194 Mir541-201ENSMUST00000102097 90 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Sh3bp1P55194 n-R5s200-201ENSMUST00000104194 113 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Sh3bp1P55194 Gm25565-201ENSMUST00000104605 105 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Sh3bp1P55194 Gm12512-201ENSMUST00000119620 217 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Sh3bp1P55194 Gm24598-201ENSMUST00000122510 74 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Sh3bp1P55194 n-R5s87-201ENSMUST00000122752 116 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Sh3bp1P55194 Gm22145-201ENSMUST00000157396 148 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Sh3bp1P55194 Gm25720-201ENSMUST00000157503 105 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Sh3bp1P55194 Gm17161-201ENSMUST00000169187 524 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Sh3bp1P55194 Gm21060-201ENSMUST00000179346 168 ntAPPRIS P1 BASIC2.19□□□□□ -2.06
Sh3bp1P55194 Gm24390-201ENSMUST00000179578 62 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Sh3bp1P55194 Gm37715-201ENSMUST00000193206 235 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Sh3bp1P55194 Gm18617-201ENSMUST00000222311 259 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Sh3bp1P55194 Gm24165-201ENSMUST00000082718 128 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Sh3bp1P55194 Gm24615-201ENSMUST00000083268 113 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Sh3bp1P55194 Gm23100-201ENSMUST00000083455 141 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Sh3bp1P55194 Olfr1218-204ENSMUST00000215054 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
Sh3bp1P55194 Defb43-201ENSMUST00000100491 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
Sh3bp1P55194 Gm26135-201ENSMUST00000101993 72 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Sh3bp1P55194 Gm24440-201ENSMUST00000157236 63 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Sh3bp1P55194 Gm22221-201ENSMUST00000157362 103 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Sh3bp1P55194 Gm24783-201ENSMUST00000157639 100 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Sh3bp1P55194 Gm24512-201ENSMUST00000174963 65 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Sh3bp1P55194 Snord50b-201ENSMUST00000178497 72 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Sh3bp1P55194 Vmn2r-ps17-201ENSMUST00000178733 375 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Sh3bp1P55194 Mir7683-201ENSMUST00000183842 61 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Sh3bp1P55194 Gm28434-201ENSMUST00000187738 500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
Sh3bp1P55194 Gm44352-201ENSMUST00000196358 110 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Sh3bp1P55194 Gm43563-201ENSMUST00000196761 198 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Sh3bp1P55194 Gm25316-201ENSMUST00000116826 118 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Sh3bp1P55194 Gm23901-201ENSMUST00000157570 107 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Sh3bp1P55194 Gm20438-201ENSMUST00000174441 329 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Sh3bp1P55194 Gm21738-201ENSMUST00000177817 681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
Sh3bp1P55194 Gm25730-201ENSMUST00000178753 165 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Sh3bp1P55194 AC164086.1-201ENSMUST00000221038 289 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Sh3bp1P55194 Gm24121-201ENSMUST00000102029 106 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Sh3bp1P55194 Gm13588-201ENSMUST00000120026 135 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Sh3bp1P55194 Gm28020-201ENSMUST00000157739 67 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Sh3bp1P55194 Gm17113-201ENSMUST00000170118 171 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Sh3bp1P55194 Gm26435-201ENSMUST00000179026 107 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Sh3bp1P55194 AC173482.5-201ENSMUST00000224181 327 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Sh3bp1P55194 Gm25482-201ENSMUST00000083225 107 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Sh3bp1P55194 Vmn1r29-202ENSMUST00000226971 4714 ntAPPRIS P1 BASIC2.16□□□□□ -2.06
Sh3bp1P55194 Mir374b-201ENSMUST00000102314 95 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Sh3bp1P55194 Gm24640-201ENSMUST00000116949 126 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Sh3bp1P55194 Gm22626-201ENSMUST00000116990 126 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Sh3bp1P55194 n-R5s15-201ENSMUST00000122635 111 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Sh3bp1P55194 Gm10722-201ENSMUST00000151376 651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
Sh3bp1P55194 Gm22082-201ENSMUST00000157587 161 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Sh3bp1P55194 Gm22338-201ENSMUST00000157715 129 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Sh3bp1P55194 Gm22803-201ENSMUST00000158049 283 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Sh3bp1P55194 Snord87-201ENSMUST00000175437 87 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Sh3bp1P55194 Gm24761-201ENSMUST00000179589 127 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Sh3bp1P55194 Gm24488-201ENSMUST00000179934 127 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Sh3bp1P55194 Gm25701-201ENSMUST00000179988 127 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Sh3bp1P55194 Gm26431-201ENSMUST00000180199 127 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Sh3bp1P55194 Mir6406-201ENSMUST00000183592 120 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Sh3bp1P55194 Gm27421-201ENSMUST00000184729 167 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Sh3bp1P55194 Gm27544-201ENSMUST00000185069 155 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Sh3bp1P55194 Gm37146-201ENSMUST00000192572 463 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
Sh3bp1P55194 Gm18546-201ENSMUST00000197245 676 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Sh3bp1P55194 Gm44563-201ENSMUST00000207958 178 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Sh3bp1P55194 AC157476.1-201ENSMUST00000215555 169 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Sh3bp1P55194 1700019M22Rik-201ENSMUST00000073560 354 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Sh3bp1P55194 Olfr1253-204ENSMUST00000215988 6332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
Sh3bp1P55194 Gm43706-201ENSMUST00000198767 2652 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Sh3bp1P55194 Gm23951-201ENSMUST00000104029 132 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Sh3bp1P55194 Trav20-201ENSMUST00000142754 347 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Sh3bp1P55194 Gm23466-201ENSMUST00000157133 106 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Sh3bp1P55194 Gm23983-201ENSMUST00000157142 114 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Sh3bp1P55194 Gm22731-201ENSMUST00000158086 94 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Sh3bp1P55194 Mir7016-201ENSMUST00000184308 72 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Sh3bp1P55194 Mir6950-201ENSMUST00000184438 73 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Sh3bp1P55194 Mir7241-201ENSMUST00000184532 64 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Sh3bp1P55194 AC183096.2-201ENSMUST00000228733 457 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Sh3bp1P55194 Olfr1151-202ENSMUST00000217376 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
Sh3bp1P55194 Gm26345-201ENSMUST00000157534 120 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Sh3bp1P55194 Gm22727-201ENSMUST00000158090 116 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Sh3bp1P55194 Gm26405-201ENSMUST00000158495 100 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Sh3bp1P55194 Gm23182-201ENSMUST00000158688 135 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Sh3bp1P55194 Gm23342-201ENSMUST00000158958 115 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Sh3bp1P55194 Gm27443-201ENSMUST00000184660 98 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Sh3bp1P55194 Gm45150-201ENSMUST00000206051 467 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84 ms