Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Gm23350-201ENSMUST00000158429 103 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
VdrP48281 Gm26403-201ENSMUST00000158500 105 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
VdrP48281 Gm26297-201ENSMUST00000179464 132 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
VdrP48281 Cr2-206ENSMUST00000193801 206 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
VdrP48281 Gm37116-201ENSMUST00000195161 147 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
VdrP48281 Gm44808-201ENSMUST00000208887 264 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
VdrP48281 AC144783.2-201ENSMUST00000219089 195 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
VdrP48281 AC158982.2-201ENSMUST00000226283 184 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
VdrP48281 Mir93-201ENSMUST00000083593 88 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
VdrP48281 Gm24261-201ENSMUST00000083744 104 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
VdrP48281 n-R5s183-201ENSMUST00000083939 115 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
VdrP48281 Skint5-203ENSMUST00000170105 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
VdrP48281 Nlrp9c-202ENSMUST00000085944 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
VdrP48281 Gm23653-201ENSMUST00000116751 97 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
VdrP48281 Gm25373-201ENSMUST00000158156 115 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
VdrP48281 Gm24668-201ENSMUST00000158935 104 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
VdrP48281 Gm28409-201ENSMUST00000187064 103 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
VdrP48281 Pak3-203ENSMUST00000112864 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
VdrP48281 Olfr659-202ENSMUST00000214986 4842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
VdrP48281 Cd209e-201ENSMUST00000033888 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
VdrP48281 Olfr1454-202ENSMUST00000213806 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
VdrP48281 Mir1298-201ENSMUST00000116681 98 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
VdrP48281 Snord100-201ENSMUST00000116836 74 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
VdrP48281 Gm23325-201ENSMUST00000157422 129 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
VdrP48281 Gm23668-201ENSMUST00000157465 111 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
VdrP48281 Gm26215-201ENSMUST00000158584 139 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
VdrP48281 Gm24736-201ENSMUST00000158862 130 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
VdrP48281 Gm22699-201ENSMUST00000175376 105 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
VdrP48281 Gm42719-201ENSMUST00000197393 355 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
VdrP48281 Gm44393-201ENSMUST00000197418 138 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
VdrP48281 1700014F14Rik-201ENSMUST00000199566 197 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
VdrP48281 Ptp4a1-206ENSMUST00000202889 135 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
VdrP48281 AC160863.1-201ENSMUST00000218412 317 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
VdrP48281 CT030645.1-201ENSMUST00000224020 231 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
VdrP48281 Mir151-201ENSMUST00000083678 68 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
VdrP48281 Gm14327-201ENSMUST00000099001 192 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
VdrP48281 Zfp280c-202ENSMUST00000076635 4355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
VdrP48281 Olfr777-202ENSMUST00000204573 5407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
VdrP48281 Gm15069-201ENSMUST00000117792 192 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
VdrP48281 Gm14937-201ENSMUST00000119709 208 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
VdrP48281 Gm15068-201ENSMUST00000119796 192 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
VdrP48281 Gm22187-201ENSMUST00000157819 129 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
VdrP48281 Gm26360-201ENSMUST00000158872 103 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
VdrP48281 Mir3470b-201ENSMUST00000175563 126 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
VdrP48281 Mir21b-201ENSMUST00000184317 108 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
VdrP48281 Gm44028-201ENSMUST00000205205 355 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
VdrP48281 Gm9967-203ENSMUST00000206903 408 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
VdrP48281 AC150901.1-201ENSMUST00000208407 145 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
VdrP48281 Gm25357-201ENSMUST00000082745 72 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
VdrP48281 Gm25627-201ENSMUST00000084003 153 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
VdrP48281 Gm42770-201ENSMUST00000199657 4155 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
VdrP48281 AC158598.2-201ENSMUST00000213397 3832 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
VdrP48281 Tlr8-202ENSMUST00000112170 3431 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
VdrP48281 Gm22939-201ENSMUST00000103958 131 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
VdrP48281 Gm23656-201ENSMUST00000122626 112 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
VdrP48281 Gm23409-201ENSMUST00000158516 237 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
VdrP48281 Gm27330-201ENSMUST00000184689 132 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
VdrP48281 Gm22154-201ENSMUST00000083844 131 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
VdrP48281 Mir488-201ENSMUST00000093595 109 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
VdrP48281 Ccdc18-201ENSMUST00000047677 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
VdrP48281 Gm22486-201ENSMUST00000116815 137 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
VdrP48281 Gm22416-201ENSMUST00000158590 88 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
VdrP48281 Gm22139-201ENSMUST00000158747 105 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
VdrP48281 Gm25119-201ENSMUST00000158815 88 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
VdrP48281 Gm23548-201ENSMUST00000158963 106 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
VdrP48281 Trav7-6-202ENSMUST00000184687 275 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
VdrP48281 Gm27979-201ENSMUST00000185126 56 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
VdrP48281 Gm31025-201ENSMUST00000222553 482 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
VdrP48281 AC165415.1-201ENSMUST00000228924 273 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
VdrP48281 Gm25081-201ENSMUST00000082534 108 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
VdrP48281 Uty-201ENSMUST00000069309 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
VdrP48281 Gm14917-201ENSMUST00000118872 2105 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
VdrP48281 Vmn1r29-205ENSMUST00000228909 4658 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
VdrP48281 Olfr1442-202ENSMUST00000207341 3126 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
VdrP48281 n-R5s200-201ENSMUST00000104194 113 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
VdrP48281 Gm14389-201ENSMUST00000140453 241 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
VdrP48281 Gm25994-201ENSMUST00000175392 101 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
VdrP48281 Gm27672-201ENSMUST00000183751 204 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
VdrP48281 Gm9251-201ENSMUST00000197202 628 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
VdrP48281 Gm44921-201ENSMUST00000205290 301 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
VdrP48281 AC129085.1-201ENSMUST00000225263 165 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
VdrP48281 Gm22249-201ENSMUST00000082485 136 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
VdrP48281 Mir1949-201ENSMUST00000157434 141 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
VdrP48281 Mir6350-201ENSMUST00000183639 105 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
VdrP48281 Mir6917-201ENSMUST00000184111 61 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
VdrP48281 Gm28282-201ENSMUST00000186072 186 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
VdrP48281 Gm28537-201ENSMUST00000189026 315 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
VdrP48281 Gm29631-201ENSMUST00000191065 315 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
VdrP48281 Gm43587-201ENSMUST00000199590 204 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
VdrP48281 Hmgb1l-201ENSMUST00000082150 571 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
VdrP48281 n-R5s197-201ENSMUST00000083302 119 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
VdrP48281 Ppp4r3c-ps-201ENSMUST00000151416 2445 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
VdrP48281 Gm43753-201ENSMUST00000196539 3309 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
VdrP48281 Gm8935-201ENSMUST00000066794 2798 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
VdrP48281 Vmn1r185-211ENSMUST00000228467 6915 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
VdrP48281 Ifi203-209ENSMUST00000156895 3605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
VdrP48281 Gm13756-201ENSMUST00000117618 222 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
VdrP48281 2210418O10Rik-202ENSMUST00000135430 195 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
VdrP48281 Gm24787-201ENSMUST00000157380 123 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
VdrP48281 Gm22330-201ENSMUST00000158068 115 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.9 ms