Protein–RNA interactions for Protein: P23813

Hoxd11, Homeobox protein Hox-D11, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd11P23813 Gm37672-201ENSMUST00000192682 4014 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Hoxd11P23813 Ptprd-204ENSMUST00000102834 8084 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Hoxd11P23813 Zfp981-203ENSMUST00000179175 2953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Hoxd11P23813 Rnf24-201ENSMUST00000059372 5978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Hoxd11P23813 Gm2381-201ENSMUST00000174558 4073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Hoxd11P23813 Hfm1-202ENSMUST00000117588 4870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Hoxd11P23813 Gm13479-201ENSMUST00000130773 4722 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Hoxd11P23813 Gm12571-201ENSMUST00000118132 243 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Hoxd11P23813 Gm10444-201ENSMUST00000126708 148 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Hoxd11P23813 Mir1945-201ENSMUST00000157919 78 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Hoxd11P23813 Gm38162-201ENSMUST00000195562 4597 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Hoxd11P23813 Olfr1029-202ENSMUST00000217244 3743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Hoxd11P23813 Gpr22-201ENSMUST00000057783 4587 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Hoxd11P23813 Fat4-201ENSMUST00000061260 16109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Hoxd11P23813 Vmn2r30-202ENSMUST00000174368 3688 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Hoxd11P23813 Gm21269-201ENSMUST00000206521 12456 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Hoxd11P23813 Gnal-202ENSMUST00000076605 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Hoxd11P23813 Gm4759-201ENSMUST00000183414 6622 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Hoxd11P23813 Traj20-201ENSMUST00000103721 58 ntAPPRIS P1 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Hoxd11P23813 Gm23084-201ENSMUST00000157850 114 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Hoxd11P23813 Gm25044-201ENSMUST00000158603 104 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Hoxd11P23813 Larp4-201ENSMUST00000057632 6527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Hoxd11P23813 Rlf-203ENSMUST00000168615 6585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Hoxd11P23813 Ccar1-201ENSMUST00000020268 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Hoxd11P23813 Vmn1r71-201ENSMUST00000079113 4996 ntAPPRIS P2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Hoxd11P23813 AY512915-203ENSMUST00000159937 3650 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Hoxd11P23813 Gpr174-202ENSMUST00000117310 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Hoxd11P23813 Vwa5a-201ENSMUST00000001544 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Hoxd11P23813 Ighv3-5-201ENSMUST00000103479 299 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Hoxd11P23813 Gm4788-203ENSMUST00000111989 3187 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Hoxd11P23813 Mup-ps5-201ENSMUST00000118667 99 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Hoxd11P23813 Olfr1238-203ENSMUST00000217237 5761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Hoxd11P23813 Tbl1xr1-201ENSMUST00000063988 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Hoxd11P23813 Dazl-201ENSMUST00000010736 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Hoxd11P23813 Epha3-201ENSMUST00000064405 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Hoxd11P23813 Fat1-205ENSMUST00000191428 14814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Hoxd11P23813 Mir1195-201ENSMUST00000116818 98 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Hoxd11P23813 Gm23638-201ENSMUST00000175073 126 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Hoxd11P23813 Gm23158-201ENSMUST00000175076 126 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Hoxd11P23813 Gm22907-201ENSMUST00000175198 126 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Hoxd11P23813 Gm22625-201ENSMUST00000175382 126 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Hoxd11P23813 Gm22875-201ENSMUST00000175449 126 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Hoxd11P23813 Gm27857-201ENSMUST00000176930 126 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Hoxd11P23813 Gm26268-201ENSMUST00000177685 126 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Hoxd11P23813 Gm23681-201ENSMUST00000178821 126 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Hoxd11P23813 Gm29344-201ENSMUST00000068143 210 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Hoxd11P23813 Rpl26-201ENSMUST00000073471 526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Hoxd11P23813 Gm22753-201ENSMUST00000083657 107 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Hoxd11P23813 Cngb3-201ENSMUST00000102999 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
Hoxd11P23813 Skint5-203ENSMUST00000170105 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
Hoxd11P23813 Creb5-203ENSMUST00000203528 7917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxd11P23813 Rps6ka3-204ENSMUST00000112493 3671 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxd11P23813 Prrc2c-201ENSMUST00000028016 8815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxd11P23813 Olfr968-202ENSMUST00000216458 4630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxd11P23813 Gm25539-201ENSMUST00000116886 122 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxd11P23813 Gm13076-201ENSMUST00000118041 204 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxd11P23813 Gm12039-201ENSMUST00000118219 180 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxd11P23813 Gm14303-201ENSMUST00000121320 171 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxd11P23813 Gm27297-201ENSMUST00000183395 105 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxd11P23813 B230207O21Rik-201ENSMUST00000198634 321 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxd11P23813 AC132465.3-201ENSMUST00000219326 195 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxd11P23813 Olfr194-203ENSMUST00000216519 3705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxd11P23813 Dnhd1-203ENSMUST00000145988 14536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxd11P23813 Stxbp5-201ENSMUST00000038213 8825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxd11P23813 Tlr13-201ENSMUST00000040065 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Hoxd11P23813 Cdh12-203ENSMUST00000227496 6004 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Hoxd11P23813 Olfr1328-202ENSMUST00000215312 5038 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Hoxd11P23813 Olfr417-203ENSMUST00000220394 6080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Hoxd11P23813 n-R5s189-201ENSMUST00000122675 114 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Hoxd11P23813 Mir5127-201ENSMUST00000175295 71 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Hoxd11P23813 Gm27554-201ENSMUST00000185074 98 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Hoxd11P23813 Gm28591-201ENSMUST00000185259 183 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Hoxd11P23813 Gm37239-201ENSMUST00000193510 141 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Hoxd11P23813 Mir3961-201ENSMUST00000198795 59 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Hoxd11P23813 Gm45288-201ENSMUST00000210236 151 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Hoxd11P23813 CT030170.1-201ENSMUST00000222183 148 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Hoxd11P23813 Rfx3-202ENSMUST00000165566 9146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Hoxd11P23813 Herc1-201ENSMUST00000042824 15153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Hoxd11P23813 Olfr1295-203ENSMUST00000217772 5539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Hoxd11P23813 Mme-205ENSMUST00000194134 8039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxd11P23813 Spag17-204ENSMUST00000164539 7862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxd11P23813 Ankar-203ENSMUST00000212573 3952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxd11P23813 Gm24996-201ENSMUST00000158390 99 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxd11P23813 Gm43927-201ENSMUST00000204599 117 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxd11P23813 Snora70-201ENSMUST00000083047 137 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxd11P23813 Olfr1369-ps1-202ENSMUST00000213326 3707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxd11P23813 AC158115.2-201ENSMUST00000221804 5563 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxd11P23813 A930017M01Rik-205ENSMUST00000227721 4167 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxd11P23813 Rgs1-208ENSMUST00000189061 3841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxd11P23813 AC156569.1-201ENSMUST00000222020 3841 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxd11P23813 Olfr689-202ENSMUST00000215413 5819 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxd11P23813 Olfr1477-202ENSMUST00000217001 4000 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxd11P23813 Phex-201ENSMUST00000079945 6265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxd11P23813 Nlrp4a-201ENSMUST00000068767 4259 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxd11P23813 Gm4070-202ENSMUST00000176467 9007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxd11P23813 Gvin1-202ENSMUST00000183409 9005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxd11P23813 Dpp10-201ENSMUST00000112603 4477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxd11P23813 Cfh-203ENSMUST00000111977 4100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxd11P23813 Gm24154-201ENSMUST00000175261 130 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxd11P23813 Mir6419-201ENSMUST00000184784 113 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.8 ms