Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Gm25801-201ENSMUST00000082638 106 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
Ggta1P23336 Mir344-201ENSMUST00000083634 95 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
Ggta1P23336 Gm23041-201ENSMUST00000083868 106 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
Ggta1P23336 Gm26108-201ENSMUST00000083973 191 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
Ggta1P23336 Gm14846-201ENSMUST00000121868 216 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
Ggta1P23336 Gm23008-201ENSMUST00000158946 80 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
Ggta1P23336 4930579O11Rik-202ENSMUST00000168243 672 ntTSL 3 BASIC0.49□□□□□ -2.33
Ggta1P23336 Gm26430-201ENSMUST00000178054 107 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
Ggta1P23336 Gm27957-201ENSMUST00000184054 127 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
Ggta1P23336 Mir8116-201ENSMUST00000184134 97 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
Ggta1P23336 Smr2-203ENSMUST00000196477 676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.49□□□□□ -2.33
Ggta1P23336 Smr2-204ENSMUST00000199635 680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.49□□□□□ -2.33
Ggta1P23336 Vmn1r-ps16-201ENSMUST00000204747 105 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
Ggta1P23336 Gm22771-201ENSMUST00000104449 91 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Ggta1P23336 Rhox11-ps3-201ENSMUST00000121166 233 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Ggta1P23336 Gm24385-201ENSMUST00000122694 350 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Ggta1P23336 Gm25805-201ENSMUST00000122788 108 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Ggta1P23336 Gm22113-201ENSMUST00000158343 104 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Ggta1P23336 Olfr1478-ps1-201ENSMUST00000208393 391 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Ggta1P23336 AC167192.2-201ENSMUST00000224794 198 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Ggta1P23336 AC117202.2-201ENSMUST00000226491 1101 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Ggta1P23336 Gm23013-201ENSMUST00000104146 106 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Ggta1P23336 Gm14568-201ENSMUST00000119321 294 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Ggta1P23336 n-R5s70-201ENSMUST00000122650 116 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Ggta1P23336 Gm24678-201ENSMUST00000158756 104 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Ggta1P23336 Mir6346-201ENSMUST00000183982 81 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Ggta1P23336 Gm28435-201ENSMUST00000185496 108 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Ggta1P23336 Gm28921-201ENSMUST00000190219 378 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Ggta1P23336 Gm44976-201ENSMUST00000205543 261 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Ggta1P23336 Olfr865-ps1-201ENSMUST00000212071 85 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Ggta1P23336 AC153541.1-201ENSMUST00000213786 294 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Ggta1P23336 AC192616.1-201ENSMUST00000221922 132 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Ggta1P23336 mt-Tm-201ENSMUST00000082395 69 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Ggta1P23336 Gm25697-201ENSMUST00000082902 98 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Ggta1P23336 Mir490-201ENSMUST00000093567 84 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Ggta1P23336 Gm22796-201ENSMUST00000157234 106 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
Ggta1P23336 Gm23605-201ENSMUST00000157255 127 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
Ggta1P23336 Gm18185-201ENSMUST00000186725 667 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
Ggta1P23336 Sprr2c-ps-201ENSMUST00000195581 301 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
Ggta1P23336 Gm18113-201ENSMUST00000220630 303 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
Ggta1P23336 CT033781.2-201ENSMUST00000221113 153 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
Ggta1P23336 Gm22302-201ENSMUST00000082657 106 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
Ggta1P23336 Gm24258-201ENSMUST00000083739 133 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
Ggta1P23336 Gm25378-201ENSMUST00000104333 129 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
Ggta1P23336 Gm13577-201ENSMUST00000121365 205 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
Ggta1P23336 Gm22522-201ENSMUST00000158271 151 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
Ggta1P23336 Gm22163-201ENSMUST00000158408 135 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
Ggta1P23336 Gm11392-201ENSMUST00000181419 710 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
Ggta1P23336 AC124182.1-201ENSMUST00000227091 321 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
Ggta1P23336 Rny1-201ENSMUST00000083767 112 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
Ggta1P23336 Zfp654-201ENSMUST00000052588 4741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.45□□□□□ -2.34
Ggta1P23336 Gm5581-201ENSMUST00000072940 2550 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
Ggta1P23336 Gm24342-201ENSMUST00000103907 104 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
Ggta1P23336 Gm11407-201ENSMUST00000120362 1058 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
Ggta1P23336 Gm23169-201ENSMUST00000157157 112 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
Ggta1P23336 Gm23996-201ENSMUST00000158062 131 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
Ggta1P23336 Mir324-201ENSMUST00000083600 89 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
Ggta1P23336 Gm24163-201ENSMUST00000093660 132 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
Ggta1P23336 Gm10033-201ENSMUST00000072427 1813 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
Ggta1P23336 Gm22447-201ENSMUST00000158155 92 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
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Ggta1P23336 Gm22841-201ENSMUST00000158443 62 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
Ggta1P23336 BC050972-201ENSMUST00000168475 526 ntTSL 3 BASIC0.43□□□□□ -2.34
Ggta1P23336 Gm26285-201ENSMUST00000177923 107 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
Ggta1P23336 Gm27365-201ENSMUST00000184041 177 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
Ggta1P23336 Gm28217-201ENSMUST00000188613 648 ntTSL 5 BASIC0.43□□□□□ -2.34
Ggta1P23336 Gm37468-201ENSMUST00000194767 854 ntTSL 1 (best) BASIC0.43□□□□□ -2.34
Ggta1P23336 Gm45027-201ENSMUST00000207081 78 ntTSL 3 BASIC0.43□□□□□ -2.34
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Ggta1P23336 Gm27919-201ENSMUST00000185163 107 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
Ggta1P23336 Gm34783-201ENSMUST00000209159 303 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
Ggta1P23336 AC122905.2-201ENSMUST00000220325 269 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
Ggta1P23336 Gm11856-201ENSMUST00000118712 276 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
Ggta1P23336 n-R5s207-201ENSMUST00000122497 118 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
Ggta1P23336 Gm25783-201ENSMUST00000122525 190 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
Ggta1P23336 Mir3079-201ENSMUST00000175428 90 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
Ggta1P23336 Gm19777-201ENSMUST00000191940 358 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
Ggta1P23336 AC124542.1-201ENSMUST00000205588 908 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
Ggta1P23336 Gm45556-201ENSMUST00000210689 345 ntTSL 5 BASIC0.41□□□□□ -2.34
Ggta1P23336 Mir101a-201ENSMUST00000083517 83 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
Ggta1P23336 Trbv17-201ENSMUST00000103275 374 ntAPPRIS P1 BASIC0.4□□□□□ -2.35
Ggta1P23336 Gm23321-201ENSMUST00000104465 126 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
Ggta1P23336 Gm24438-201ENSMUST00000157893 115 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
Ggta1P23336 Gm23898-201ENSMUST00000158111 103 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
Ggta1P23336 Gm20462-201ENSMUST00000172623 408 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
Ggta1P23336 Gm20923-201ENSMUST00000190009 319 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
Ggta1P23336 Gm21088-201ENSMUST00000190875 316 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
Ggta1P23336 Gm28288-201ENSMUST00000191019 214 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
Ggta1P23336 Gm34302-201ENSMUST00000192926 243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.4□□□□□ -2.35
Ggta1P23336 Gm22685-201ENSMUST00000082848 106 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
Ggta1P23336 Gm25627-201ENSMUST00000084003 153 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
Ggta1P23336 Gm25434-201ENSMUST00000158278 167 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
Ggta1P23336 Gm22435-201ENSMUST00000158552 128 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
Ggta1P23336 Mir1961-201ENSMUST00000158643 112 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
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