Protein–RNA interactions for Protein: P0C1T1

Hoxb2, Homeobox protein Hox-B2, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb2P0C1T1 AC122828.3-201ENSMUST00000223019 3915 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Hoxb2P0C1T1 B020011L13Rik-201ENSMUST00000188801 2879 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Hoxb2P0C1T1 Olfr679-204ENSMUST00000215704 5018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Hoxb2P0C1T1 Olfr810-203ENSMUST00000214878 4709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Hoxb2P0C1T1 Olfr794-202ENSMUST00000204820 3044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Hoxb2P0C1T1 Gm42585-201ENSMUST00000198731 4020 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Hoxb2P0C1T1 Olfr592-203ENSMUST00000218618 5978 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Hoxb2P0C1T1 Gm12858-201ENSMUST00000121913 208 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Hoxb2P0C1T1 Gm11192-201ENSMUST00000127017 151 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
Hoxb2P0C1T1 Gm24559-201ENSMUST00000157519 121 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Hoxb2P0C1T1 Snord11-201ENSMUST00000158468 84 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Hoxb2P0C1T1 Gm22510-201ENSMUST00000179304 79 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Hoxb2P0C1T1 Gm26336-201ENSMUST00000179449 79 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Hoxb2P0C1T1 Gm26390-201ENSMUST00000179628 79 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Hoxb2P0C1T1 Sult1c2-ps2-201ENSMUST00000196414 276 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Hoxb2P0C1T1 Mir9-2-201ENSMUST00000083490 72 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Hoxb2P0C1T1 Gm18337-201ENSMUST00000219023 5762 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Hoxb2P0C1T1 Ifi214-203ENSMUST00000139092 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
Hoxb2P0C1T1 Gm16355-201ENSMUST00000128606 231 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Hoxb2P0C1T1 Gm25364-201ENSMUST00000158851 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Hoxb2P0C1T1 AC173115.1-201ENSMUST00000220835 211 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Hoxb2P0C1T1 Olfr109-203ENSMUST00000214938 5550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Hoxb2P0C1T1 Tlr3-205ENSMUST00000209772 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Hoxb2P0C1T1 Olfr862-202ENSMUST00000079660 2604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Hoxb2P0C1T1 Vmn2r81-201ENSMUST00000020547 3276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Hoxb2P0C1T1 Olfr789-201ENSMUST00000213236 4235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Hoxb2P0C1T1 Olfr1211-203ENSMUST00000213412 4173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Hoxb2P0C1T1 Gm23175-201ENSMUST00000104371 132 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Hoxb2P0C1T1 Gm14709-201ENSMUST00000121225 304 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Hoxb2P0C1T1 n-R5s189-201ENSMUST00000122675 114 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Hoxb2P0C1T1 Gm27783-201ENSMUST00000183534 105 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Hoxb2P0C1T1 AC129085.1-201ENSMUST00000225263 165 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Hoxb2P0C1T1 Wnk3-201ENSMUST00000096285 8551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Hoxb2P0C1T1 Ms4a14-201ENSMUST00000187467 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Hoxb2P0C1T1 Gm3055-202ENSMUST00000218939 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
Hoxb2P0C1T1 Zfp781-202ENSMUST00000219144 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
Hoxb2P0C1T1 Olfr1447-203ENSMUST00000216989 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Hoxb2P0C1T1 Wnk3-205ENSMUST00000184392 5394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
Hoxb2P0C1T1 AC153966.1-201ENSMUST00000220106 3764 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Hoxb2P0C1T1 Gm25091-201ENSMUST00000103997 71 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Hoxb2P0C1T1 Gm26423-201ENSMUST00000104277 128 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Hoxb2P0C1T1 Gm22023-201ENSMUST00000104354 130 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Hoxb2P0C1T1 Gm18433-202ENSMUST00000195682 196 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Hoxb2P0C1T1 Gm22683-201ENSMUST00000082854 137 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Hoxb2P0C1T1 Cdh4-202ENSMUST00000098996 69 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Hoxb2P0C1T1 Gm10730-201ENSMUST00000194097 2723 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Hoxb2P0C1T1 Olfr776-202ENSMUST00000213512 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Hoxb2P0C1T1 Olfr1245-202ENSMUST00000217402 2610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Hoxb2P0C1T1 Mir547-201ENSMUST00000102051 78 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Hoxb2P0C1T1 Gm24171-201ENSMUST00000104126 131 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Hoxb2P0C1T1 Gm22196-201ENSMUST00000116865 109 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Hoxb2P0C1T1 Gm14946-201ENSMUST00000119859 296 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Hoxb2P0C1T1 Gm15281-201ENSMUST00000125181 351 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Hoxb2P0C1T1 Gm24730-201ENSMUST00000158228 117 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Hoxb2P0C1T1 Gm23817-201ENSMUST00000158449 104 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Hoxb2P0C1T1 Gm22532-201ENSMUST00000158822 140 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Hoxb2P0C1T1 Gm20672-201ENSMUST00000176605 261 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Hoxb2P0C1T1 Gm27893-201ENSMUST00000184408 194 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Hoxb2P0C1T1 Gm8739-201ENSMUST00000185962 181 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Hoxb2P0C1T1 Gm44464-201ENSMUST00000198010 138 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Hoxb2P0C1T1 Gm35736-201ENSMUST00000203681 313 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Hoxb2P0C1T1 Gm22979-201ENSMUST00000082609 159 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Hoxb2P0C1T1 Mir128-1-201ENSMUST00000083586 70 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Hoxb2P0C1T1 Gm14400-201ENSMUST00000117234 2135 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Hoxb2P0C1T1 Gm22031-201ENSMUST00000116945 126 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Hoxb2P0C1T1 Gm23716-201ENSMUST00000157348 144 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Hoxb2P0C1T1 Gm22079-201ENSMUST00000157592 106 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Hoxb2P0C1T1 Gm25371-201ENSMUST00000158162 101 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Hoxb2P0C1T1 Rnu7-201ENSMUST00000158458 62 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Hoxb2P0C1T1 Gm8034-201ENSMUST00000178853 132 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Hoxb2P0C1T1 Gm23860-201ENSMUST00000179446 132 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Hoxb2P0C1T1 Trav7d-3-201ENSMUST00000179789 402 ntAPPRIS P1 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Hoxb2P0C1T1 Gm18486-201ENSMUST00000184040 298 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Hoxb2P0C1T1 AC127371.3-201ENSMUST00000228129 415 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Hoxb2P0C1T1 Olfr790-203ENSMUST00000215067 2659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Hoxb2P0C1T1 Acer3-202ENSMUST00000120520 3964 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
Hoxb2P0C1T1 Olfr25-203ENSMUST00000214155 6479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Hoxb2P0C1T1 Vmn2r65-201ENSMUST00000044583 2538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Hoxb2P0C1T1 Olfr1229-203ENSMUST00000214593 3404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Hoxb2P0C1T1 4930527E20Rik-201ENSMUST00000135700 351 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
Hoxb2P0C1T1 Gm17117-201ENSMUST00000163665 299 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Hoxb2P0C1T1 Mir6914-201ENSMUST00000184999 69 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Hoxb2P0C1T1 AC133083.2-201ENSMUST00000222826 272 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Hoxb2P0C1T1 CT025579.1-201ENSMUST00000223779 366 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Hoxb2P0C1T1 mt-Tv-201ENSMUST00000082389 69 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Hoxb2P0C1T1 Gm23244-201ENSMUST00000083375 92 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Hoxb2P0C1T1 Olfr389-203ENSMUST00000215418 3417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Hoxb2P0C1T1 Olfr1258-201ENSMUST00000102609 7007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Hoxb2P0C1T1 Gm43268-201ENSMUST00000201536 4055 ntBASIC2.78□□□□□ -1.97
Hoxb2P0C1T1 Olfr1370-203ENSMUST00000215357 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Hoxb2P0C1T1 Olfr143-202ENSMUST00000213129 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Hoxb2P0C1T1 Mir293-201ENSMUST00000104841 80 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Hoxb2P0C1T1 Gm12412-201ENSMUST00000121867 328 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Hoxb2P0C1T1 Gm15733-201ENSMUST00000132957 242 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Hoxb2P0C1T1 Gm14389-201ENSMUST00000140453 241 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Hoxb2P0C1T1 Gm25558-201ENSMUST00000158083 106 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Hoxb2P0C1T1 Gm25771-201ENSMUST00000158565 144 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Hoxb2P0C1T1 Gm25678-201ENSMUST00000174984 73 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Hoxb2P0C1T1 Gm28669-201ENSMUST00000188400 100 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Hoxb2P0C1T1 Ighv1-1-201ENSMUST00000194912 291 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.5 ms