Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Gm13725-201ENSMUST00000122139 207 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Ccl20O89093 Gm22479-201ENSMUST00000122566 81 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Ccl20O89093 Gm23170-201ENSMUST00000157158 106 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Ccl20O89093 Gm22491-201ENSMUST00000157190 102 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Ccl20O89093 Gm22279-201ENSMUST00000157200 93 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Ccl20O89093 Gm25884-201ENSMUST00000157782 62 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Ccl20O89093 Gm23182-201ENSMUST00000158688 135 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Ccl20O89093 Gm21060-201ENSMUST00000179346 168 ntAPPRIS P1 BASIC1.03□□□□□ -2.24
Ccl20O89093 Mir6951-201ENSMUST00000183910 75 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Ccl20O89093 Ranbp2-ps7-201ENSMUST00000183924 384 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Ccl20O89093 Gm28661-201ENSMUST00000188231 681 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Ccl20O89093 AC147560.1-201ENSMUST00000197528 107 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Ccl20O89093 Gm31447-201ENSMUST00000222345 384 ntTSL 3 BASIC1.03□□□□□ -2.24
Ccl20O89093 AC154552.1-201ENSMUST00000222969 202 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Ccl20O89093 AC158981.3-202ENSMUST00000228906 523 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Ccl20O89093 Gm23055-201ENSMUST00000082805 94 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Ccl20O89093 Olfr1098-202ENSMUST00000111574 2885 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.02□□□□□ -2.25
Ccl20O89093 Gm23941-201ENSMUST00000101953 107 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Ccl20O89093 Mir767-201ENSMUST00000103256 107 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Ccl20O89093 Gm15391-201ENSMUST00000147509 257 ntTSL 3 BASIC1.02□□□□□ -2.25
Ccl20O89093 Gm45886-201ENSMUST00000148141 342 ntTSL 5 BASIC1.02□□□□□ -2.25
Ccl20O89093 Gm13976-201ENSMUST00000154367 479 ntTSL 3 BASIC1.02□□□□□ -2.25
Ccl20O89093 Gm24902-201ENSMUST00000158126 123 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Ccl20O89093 Gm26022-201ENSMUST00000158663 108 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Ccl20O89093 Gm26363-201ENSMUST00000158866 83 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Ccl20O89093 Skint5-202ENSMUST00000169631 4497 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC1.02□□□□□ -2.25
Ccl20O89093 Rpl23a-ps7-201ENSMUST00000185437 460 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Ccl20O89093 Gm29308-201ENSMUST00000188863 315 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Ccl20O89093 Gm28537-201ENSMUST00000189026 315 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Ccl20O89093 Gm29631-201ENSMUST00000191065 315 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Ccl20O89093 Gm19777-201ENSMUST00000191940 358 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Ccl20O89093 Mir7227-201ENSMUST00000200408 59 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Ccl20O89093 Gm45005-201ENSMUST00000206640 157 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Ccl20O89093 Olfr515-ps1-201ENSMUST00000208389 189 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Ccl20O89093 Gm45673-201ENSMUST00000210293 358 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Ccl20O89093 Gm23406-201ENSMUST00000082537 122 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Ccl20O89093 Gm44240-201ENSMUST00000204015 2654 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Ccl20O89093 Gm42718-201ENSMUST00000197319 2681 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Ccl20O89093 Igkv13-84-201ENSMUST00000103339 347 ntAPPRIS P1 BASIC1.01□□□□□ -2.25
Ccl20O89093 Gm23492-201ENSMUST00000116837 115 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Ccl20O89093 Gm23987-201ENSMUST00000117039 129 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Ccl20O89093 Rpl30-ps5-201ENSMUST00000117104 361 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Ccl20O89093 Gm27723-201ENSMUST00000157398 63 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Ccl20O89093 Gm25423-201ENSMUST00000157609 107 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Ccl20O89093 Gm23640-201ENSMUST00000157860 104 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Ccl20O89093 Gm22434-201ENSMUST00000158549 122 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Ccl20O89093 Gm28330-201ENSMUST00000190353 171 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Ccl20O89093 Gm37089-201ENSMUST00000195616 129 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Ccl20O89093 Mir465d-201ENSMUST00000196314 58 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Ccl20O89093 Gm44352-201ENSMUST00000196358 110 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Ccl20O89093 Gm42594-201ENSMUST00000199511 246 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Ccl20O89093 AC164612.2-202ENSMUST00000216314 253 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Ccl20O89093 Gm38407-201ENSMUST00000218017 474 ntTSL 2 BASIC1.01□□□□□ -2.25
Ccl20O89093 AC125020.2-201ENSMUST00000218894 348 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Ccl20O89093 Gm25079-201ENSMUST00000082529 203 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Ccl20O89093 Mir92-2-201ENSMUST00000083679 91 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Ccl20O89093 Rps24-ps2-201ENSMUST00000091375 395 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Ccl20O89093 Vmn1r75-207ENSMUST00000228646 4466 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.01□□□□□ -2.25
Ccl20O89093 Gm26135-201ENSMUST00000101993 72 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Ccl20O89093 Gm14922-201ENSMUST00000121131 163 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Ccl20O89093 Gm26089-201ENSMUST00000157898 107 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Ccl20O89093 Snord50b-201ENSMUST00000178497 72 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Ccl20O89093 Gm37763-201ENSMUST00000193445 120 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Ccl20O89093 Gm37801-201ENSMUST00000194754 274 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Ccl20O89093 Gm42855-201ENSMUST00000197388 253 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Ccl20O89093 Gm43427-201ENSMUST00000198188 331 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Ccl20O89093 Vmn1r-ps13-201ENSMUST00000204697 134 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Ccl20O89093 Olfr1064-ps1-201ENSMUST00000213670 600 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Ccl20O89093 AC098718.1-201ENSMUST00000226166 175 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Ccl20O89093 Gm25204-201ENSMUST00000082843 106 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Ccl20O89093 Gm24038-201ENSMUST00000082872 159 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Ccl20O89093 Gm26495-201ENSMUST00000083152 137 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Ccl20O89093 Gm25793-201ENSMUST00000083287 107 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Ccl20O89093 Gm23345-201ENSMUST00000083817 150 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Ccl20O89093 AC153964.2-201ENSMUST00000217704 2474 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Ccl20O89093 Gm29515-201ENSMUST00000188273 2077 ntTSL 1 (best) BASIC1□□□□□ -2.25
Ccl20O89093 Zfp960-201ENSMUST00000127027 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.99□□□□□ -2.25
Ccl20O89093 Gm44177-201ENSMUST00000204338 2667 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Ccl20O89093 Gm23836-201ENSMUST00000104434 129 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Ccl20O89093 Gm13588-201ENSMUST00000120026 135 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Ccl20O89093 Gm11792-201ENSMUST00000120640 168 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Ccl20O89093 n-R5s188-201ENSMUST00000122646 105 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Ccl20O89093 Gm23536-201ENSMUST00000157541 134 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Ccl20O89093 Mir1951-201ENSMUST00000157981 89 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Ccl20O89093 Gm22448-201ENSMUST00000179254 107 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Ccl20O89093 Mir7063-201ENSMUST00000184158 91 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Ccl20O89093 Mir7675-201ENSMUST00000184262 58 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Ccl20O89093 Gm28016-201ENSMUST00000184594 196 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Ccl20O89093 Gm28409-201ENSMUST00000187064 103 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Ccl20O89093 Gm29140-201ENSMUST00000190187 476 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Ccl20O89093 Gm38064-201ENSMUST00000194032 444 ntTSL 3 BASIC0.99□□□□□ -2.25
Ccl20O89093 Mir301b-201ENSMUST00000102333 97 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Ccl20O89093 Mir544-201ENSMUST00000103813 78 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Ccl20O89093 Gm25485-201ENSMUST00000104120 132 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Ccl20O89093 Gm15213-201ENSMUST00000122098 216 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Ccl20O89093 Mir1904-201ENSMUST00000122702 80 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Ccl20O89093 Gm24847-201ENSMUST00000158032 108 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Ccl20O89093 Olfr1366-201ENSMUST00000168629 1054 ntAPPRIS ALT2 BASIC0.98□□□□□ -2.25
Ccl20O89093 Gm25069-201ENSMUST00000175238 86 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Ccl20O89093 Tmem167-ps2-201ENSMUST00000190251 214 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
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