Protein–RNA interactions for Protein: O19441

H2-Q1, Histocompatibility 2, Q region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q1O19441 Mir293-201ENSMUST00000104841 80 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
H2-Q1O19441 Gm23109-201ENSMUST00000116867 126 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
H2-Q1O19441 Gm15162-201ENSMUST00000119325 283 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
H2-Q1O19441 Gm24076-201ENSMUST00000158179 94 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
H2-Q1O19441 Gm25051-201ENSMUST00000158602 249 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
H2-Q1O19441 Gm16306-201ENSMUST00000160568 176 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
H2-Q1O19441 Mup-ps11-201ENSMUST00000178040 545 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
H2-Q1O19441 Mup-ps3-201ENSMUST00000178315 545 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
H2-Q1O19441 Mir3087-201ENSMUST00000199405 56 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
H2-Q1O19441 Gm44977-201ENSMUST00000205283 420 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
H2-Q1O19441 Gm45092-201ENSMUST00000205944 545 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
H2-Q1O19441 Gm45907-201ENSMUST00000213023 193 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
H2-Q1O19441 Vmn2r-ps102-203ENSMUST00000222739 604 ntTSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
H2-Q1O19441 AC149294.9-201ENSMUST00000227256 164 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
H2-Q1O19441 Olfr1044-202ENSMUST00000215171 3266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
H2-Q1O19441 Gm23172-201ENSMUST00000157160 124 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
H2-Q1O19441 Gm24478-201ENSMUST00000157439 158 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
H2-Q1O19441 Gm25914-201ENSMUST00000157618 153 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
H2-Q1O19441 Gm25653-201ENSMUST00000158473 138 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
H2-Q1O19441 Gm26287-201ENSMUST00000158887 81 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
H2-Q1O19441 Gm27544-201ENSMUST00000185069 155 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
H2-Q1O19441 Gm28921-201ENSMUST00000190219 378 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
H2-Q1O19441 Gm37089-201ENSMUST00000195616 129 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
H2-Q1O19441 AC098718.2-201ENSMUST00000226822 285 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
H2-Q1O19441 Gm25141-201ENSMUST00000083177 107 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
H2-Q1O19441 Gm36669-201ENSMUST00000201757 3650 ntTSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
H2-Q1O19441 Mir301b-201ENSMUST00000102333 97 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
H2-Q1O19441 Gm15861-201ENSMUST00000120979 339 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
H2-Q1O19441 Vmn2r-ps116-201ENSMUST00000175997 126 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
H2-Q1O19441 Mir6379-201ENSMUST00000183392 115 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
H2-Q1O19441 Mir6540-201ENSMUST00000184886 108 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
H2-Q1O19441 Mir6901-201ENSMUST00000185062 62 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
H2-Q1O19441 Gm37693-201ENSMUST00000194562 234 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
H2-Q1O19441 Mir7021-201ENSMUST00000197026 63 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
H2-Q1O19441 Gm23370-201ENSMUST00000199545 130 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
H2-Q1O19441 Gm5010-201ENSMUST00000213131 260 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
H2-Q1O19441 AC159896.1-201ENSMUST00000215264 215 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
H2-Q1O19441 AC129202.1-201ENSMUST00000224895 526 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
H2-Q1O19441 Gm22248-201ENSMUST00000082482 150 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
H2-Q1O19441 Gm24165-201ENSMUST00000082718 128 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
H2-Q1O19441 Olfr805-204ENSMUST00000217219 3314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
H2-Q1O19441 AC161250.2-201ENSMUST00000215114 3107 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
H2-Q1O19441 Agmo-201ENSMUST00000049874 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
H2-Q1O19441 Vmn1r29-202ENSMUST00000226971 4714 ntAPPRIS P1 BASIC1.77□□□□□ -2.13
H2-Q1O19441 Gm24423-201ENSMUST00000101982 106 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
H2-Q1O19441 Traj52-201ENSMUST00000103691 66 ntAPPRIS P1 BASIC1.77□□□□□ -2.13
H2-Q1O19441 Traj37-201ENSMUST00000103705 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.77□□□□□ -2.13
H2-Q1O19441 Gm22784-201ENSMUST00000104088 132 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
H2-Q1O19441 Gm13569-201ENSMUST00000137221 574 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
H2-Q1O19441 Gm22097-201ENSMUST00000157929 278 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
H2-Q1O19441 Gm26022-201ENSMUST00000158663 108 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
H2-Q1O19441 Gm25643-201ENSMUST00000158874 103 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
H2-Q1O19441 Gm25615-201ENSMUST00000177836 94 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
H2-Q1O19441 Gm25024-201ENSMUST00000179667 104 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
H2-Q1O19441 Gm5900-201ENSMUST00000179862 375 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
H2-Q1O19441 Gm28724-201ENSMUST00000186149 625 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
H2-Q1O19441 Gm24805-201ENSMUST00000082931 104 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
H2-Q1O19441 Snora3-201ENSMUST00000083082 132 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
H2-Q1O19441 Gm25513-201ENSMUST00000083861 162 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
H2-Q1O19441 Vmn1r75-205ENSMUST00000228268 4376 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.77□□□□□ -2.13
H2-Q1O19441 Ppp4r3c-ps-201ENSMUST00000151416 2445 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
H2-Q1O19441 Gm14709-201ENSMUST00000121225 304 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
H2-Q1O19441 Gm24394-201ENSMUST00000158141 123 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
H2-Q1O19441 Gm25362-201ENSMUST00000158854 105 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
H2-Q1O19441 Gm24656-201ENSMUST00000177548 132 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
H2-Q1O19441 Gm26864-201ENSMUST00000181346 156 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
H2-Q1O19441 Mir6419-201ENSMUST00000184784 113 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
H2-Q1O19441 5430435K18Rik-201ENSMUST00000202597 661 ntTSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
H2-Q1O19441 CT010454.1-201ENSMUST00000225975 265 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
H2-Q1O19441 Gm25357-201ENSMUST00000082745 72 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
H2-Q1O19441 Vmn2r69-201ENSMUST00000171213 2553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
H2-Q1O19441 Slco6c1-201ENSMUST00000027569 2747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
H2-Q1O19441 AC153964.2-201ENSMUST00000217704 2474 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
H2-Q1O19441 Gm12797-201ENSMUST00000118645 273 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
H2-Q1O19441 Gm14937-201ENSMUST00000119709 208 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
H2-Q1O19441 Gm23656-201ENSMUST00000122626 112 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
H2-Q1O19441 Gm15611-201ENSMUST00000146928 406 ntTSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
H2-Q1O19441 Mir1951-201ENSMUST00000157981 89 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
H2-Q1O19441 Gm23182-201ENSMUST00000158688 135 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
H2-Q1O19441 Gm24638-201ENSMUST00000179807 132 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
H2-Q1O19441 Mir6336-201ENSMUST00000183581 130 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
H2-Q1O19441 Gm27421-201ENSMUST00000184729 167 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
H2-Q1O19441 Gm27545-201ENSMUST00000184755 202 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
H2-Q1O19441 Gm40331-201ENSMUST00000198430 217 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
H2-Q1O19441 AC132615.1-201ENSMUST00000213873 255 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
H2-Q1O19441 AC154636.2-201ENSMUST00000222538 161 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
H2-Q1O19441 Gm22358-201ENSMUST00000082877 122 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
H2-Q1O19441 Mir155-201ENSMUST00000083463 65 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
H2-Q1O19441 Gm25188-201ENSMUST00000083913 122 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
H2-Q1O19441 Gm6020-201ENSMUST00000092094 66 ntAPPRIS P1 BASIC1.75□□□□□ -2.13
H2-Q1O19441 Gm10360-201ENSMUST00000097219 272 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
H2-Q1O19441 Gm24590-201ENSMUST00000116699 119 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
H2-Q1O19441 Gm14674-201ENSMUST00000117816 342 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
H2-Q1O19441 Gm14491-201ENSMUST00000121919 199 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
H2-Q1O19441 Gm24668-201ENSMUST00000158935 104 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
H2-Q1O19441 Gm25235-201ENSMUST00000179933 107 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
H2-Q1O19441 Mir7678-201ENSMUST00000185076 71 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
H2-Q1O19441 Gm19123-201ENSMUST00000190716 651 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
H2-Q1O19441 Gm9251-201ENSMUST00000197202 628 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
H2-Q1O19441 Igkv13-76-201ENSMUST00000197621 347 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 160.1 ms