Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ19

Gm379, Predicted gene 379, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm379J3QQ19 Mir410-201ENSMUST00000083563 81 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
Gm379J3QQ19 Fam46d-201ENSMUST00000101292 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.34□□□□□ -2.36
Gm379J3QQ19 Gm24241-201ENSMUST00000157787 145 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
Gm379J3QQ19 Mir3079-201ENSMUST00000175428 90 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
Gm379J3QQ19 Gm37128-201ENSMUST00000192599 232 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
Gm379J3QQ19 Gm25820-201ENSMUST00000198589 127 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
Gm379J3QQ19 Gm45704-201ENSMUST00000212582 403 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
Gm379J3QQ19 CT009713.9-201ENSMUST00000223604 389 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
Gm379J3QQ19 Gm11856-201ENSMUST00000118712 276 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
Gm379J3QQ19 Gm24630-201ENSMUST00000122768 106 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
Gm379J3QQ19 Gm15632-201ENSMUST00000135936 246 ntTSL 1 (best) BASIC0.32□□□□□ -2.36
Gm379J3QQ19 Gm27926-201ENSMUST00000157180 66 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
Gm379J3QQ19 Gm24962-201ENSMUST00000157917 109 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
Gm379J3QQ19 Gm22888-201ENSMUST00000158640 77 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
Gm379J3QQ19 Gm25976-201ENSMUST00000158695 130 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
Gm379J3QQ19 Gm25486-201ENSMUST00000158726 63 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
Gm379J3QQ19 Gm25643-201ENSMUST00000158874 103 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
Gm379J3QQ19 Mir468-201ENSMUST00000197332 78 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
Gm379J3QQ19 Gm23515-201ENSMUST00000082829 107 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
Gm379J3QQ19 Gm14884-201ENSMUST00000120456 196 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
Gm379J3QQ19 Gm23169-201ENSMUST00000157157 112 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
Gm379J3QQ19 4930579O11Rik-202ENSMUST00000168243 672 ntTSL 3 BASIC0.31□□□□□ -2.36
Gm379J3QQ19 Mir6346-201ENSMUST00000183982 81 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
Gm379J3QQ19 Gm5001-201ENSMUST00000204361 331 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
Gm379J3QQ19 1700024I08Rik-202ENSMUST00000222074 407 ntTSL 5 BASIC0.31□□□□□ -2.36
Gm379J3QQ19 Gm22809-201ENSMUST00000082743 156 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
Gm379J3QQ19 Gm25697-201ENSMUST00000082902 98 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
Gm379J3QQ19 Gm23377-201ENSMUST00000082943 126 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
Gm379J3QQ19 AC160115.1-201ENSMUST00000224678 1574 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
Gm379J3QQ19 Zfp654-201ENSMUST00000052588 4741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.3□□□□□ -2.36
Gm379J3QQ19 Gm22003-201ENSMUST00000101885 107 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
Gm379J3QQ19 Gm12584-201ENSMUST00000117109 1105 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
Gm379J3QQ19 Gm25783-201ENSMUST00000122525 190 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
Gm379J3QQ19 Gm10721-201ENSMUST00000143083 669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.3□□□□□ -2.36
Gm379J3QQ19 Gm23605-201ENSMUST00000157255 127 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
Gm379J3QQ19 Gm26152-201ENSMUST00000157427 101 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
Gm379J3QQ19 Gm26116-201ENSMUST00000175600 77 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
Gm379J3QQ19 Gm23410-201ENSMUST00000179967 107 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
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Gm379J3QQ19 Gm26326-201ENSMUST00000083070 129 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
Gm379J3QQ19 Gm22363-201ENSMUST00000083100 108 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
Gm379J3QQ19 Gm23814-201ENSMUST00000083230 102 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
Gm379J3QQ19 Gm23095-201ENSMUST00000083446 107 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
Gm379J3QQ19 Mir448-201ENSMUST00000083516 112 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
Gm379J3QQ19 Gm25627-201ENSMUST00000084003 153 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
Gm379J3QQ19 Gm10718-201ENSMUST00000099046 681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.3□□□□□ -2.36
Gm379J3QQ19 Gm25805-201ENSMUST00000122788 108 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
Gm379J3QQ19 Gm24476-201ENSMUST00000157437 131 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
Gm379J3QQ19 Gm29640-201ENSMUST00000187972 278 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
Gm379J3QQ19 Gm20257-202ENSMUST00000188643 130 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
Gm379J3QQ19 Gm33654-201ENSMUST00000221704 215 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
Gm379J3QQ19 AC129208.2-201ENSMUST00000228506 320 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
Gm379J3QQ19 Gm24258-201ENSMUST00000083739 133 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
Gm379J3QQ19 Gm26135-201ENSMUST00000101993 72 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
Gm379J3QQ19 Gm22673-201ENSMUST00000104415 131 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
Gm379J3QQ19 Gm10972-201ENSMUST00000107276 81 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.28□□□□□ -2.36
Gm379J3QQ19 Gm15719-201ENSMUST00000120619 635 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
Gm379J3QQ19 Gm22818-201ENSMUST00000157446 104 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
Gm379J3QQ19 Gm22113-201ENSMUST00000158343 104 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
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Gm379J3QQ19 Snord50b-201ENSMUST00000178497 72 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
Gm379J3QQ19 Il6st-202ENSMUST00000183513 201 ntTSL 5 BASIC0.28□□□□□ -2.36
Gm379J3QQ19 Gm27226-201ENSMUST00000184676 511 ntTSL 2 BASIC0.28□□□□□ -2.36
Gm379J3QQ19 Gm44488-201ENSMUST00000199467 119 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
Gm379J3QQ19 AC122905.2-201ENSMUST00000220325 269 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
Gm379J3QQ19 AC165092.3-201ENSMUST00000223602 282 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
Gm379J3QQ19 Gm23622-201ENSMUST00000082460 107 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
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Gm379J3QQ19 Mir1931-201ENSMUST00000158589 119 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
Gm379J3QQ19 Gm22200-201ENSMUST00000158614 67 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
Gm379J3QQ19 2210407C18Rik-201ENSMUST00000048801 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.27□□□□□ -2.37
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Gm379J3QQ19 Gm14761-201ENSMUST00000121363 262 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
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Gm379J3QQ19 n-R5s207-201ENSMUST00000122497 118 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
Gm379J3QQ19 Gm15327-202ENSMUST00000153958 467 ntTSL 1 (best) BASIC0.26□□□□□ -2.37
Gm379J3QQ19 Gm23672-201ENSMUST00000157471 107 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
Gm379J3QQ19 Gm20391-201ENSMUST00000174722 106 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
Gm379J3QQ19 Gm27957-201ENSMUST00000184054 127 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
Gm379J3QQ19 AC124542.1-201ENSMUST00000205588 908 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
Gm379J3QQ19 AC153930.1-201ENSMUST00000220016 358 ntTSL 3 BASIC0.26□□□□□ -2.37
Gm379J3QQ19 AC159625.1-201ENSMUST00000220994 2625 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
Gm379J3QQ19 Gm8251-201ENSMUST00000168641 5985 ntAPPRIS P1 BASIC0.26□□□□□ -2.37
Gm379J3QQ19 Gm23991-201ENSMUST00000117033 93 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
Gm379J3QQ19 Gm13059-201ENSMUST00000119881 398 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
Gm379J3QQ19 Gm25825-201ENSMUST00000157091 124 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
Gm379J3QQ19 Gm25393-201ENSMUST00000157336 285 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
Gm379J3QQ19 Gm22447-201ENSMUST00000158155 92 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
Gm379J3QQ19 Gm17148-201ENSMUST00000164702 249 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
Gm379J3QQ19 BC050972-201ENSMUST00000168475 526 ntTSL 3 BASIC0.25□□□□□ -2.37
Gm379J3QQ19 Gm22914-201ENSMUST00000175195 77 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
Gm379J3QQ19 Gm26335-201ENSMUST00000178449 107 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
Gm379J3QQ19 Gm26379-202ENSMUST00000200225 132 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
Gm379J3QQ19 AC147101.1-201ENSMUST00000217964 312 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
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