Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ04

Gm21887, Predicted gene, 21887, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21887J3QQ04 Mir7-1-201ENSMUST00000083500 108 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Gm21887J3QQ04 Vmn1r75-205ENSMUST00000228268 4376 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
Gm21887J3QQ04 Vmn1r74-202ENSMUST00000228471 6608 ntAPPRIS P1 BASIC1.97□□□□□ -2.09
Gm21887J3QQ04 Zfp534-201ENSMUST00000117638 2885 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.09
Gm21887J3QQ04 Gpr174-201ENSMUST00000101294 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
Gm21887J3QQ04 Vmn1r75-207ENSMUST00000228646 4466 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
Gm21887J3QQ04 Traj16-201ENSMUST00000103725 61 ntAPPRIS P1 BASIC1.96□□□□□ -2.1
Gm21887J3QQ04 Gm12858-201ENSMUST00000121913 208 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Gm21887J3QQ04 Gm24774-201ENSMUST00000157384 134 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Gm21887J3QQ04 Gm25011-201ENSMUST00000158398 126 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Gm21887J3QQ04 Gm24880-201ENSMUST00000158776 85 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Gm21887J3QQ04 Gm23375-201ENSMUST00000175407 83 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Gm21887J3QQ04 Mir6938-201ENSMUST00000184173 63 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Gm21887J3QQ04 Mir6400-201ENSMUST00000184870 92 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Gm21887J3QQ04 Gm28467-201ENSMUST00000190981 318 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Gm21887J3QQ04 Mir331-201ENSMUST00000083673 96 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Gm21887J3QQ04 Mir7-2-201ENSMUST00000083675 97 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Gm21887J3QQ04 Gm25682-201ENSMUST00000083942 164 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Gm21887J3QQ04 Gm11808-201ENSMUST00000089430 504 ntAPPRIS P1 BASIC1.96□□□□□ -2.1
Gm21887J3QQ04 Zfp990-202ENSMUST00000105742 2996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
Gm21887J3QQ04 Gm32014-201ENSMUST00000214779 5145 ntTSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
Gm21887J3QQ04 Gm13219-201ENSMUST00000144870 3019 ntTSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
Gm21887J3QQ04 AI504432-201ENSMUST00000070085 5569 ntTSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
Gm21887J3QQ04 Zfp600-201ENSMUST00000092750 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
Gm21887J3QQ04 F8-201ENSMUST00000033539 9784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
Gm21887J3QQ04 Vmn1r29-202ENSMUST00000226971 4714 ntAPPRIS P1 BASIC1.95□□□□□ -2.1
Gm21887J3QQ04 Gm44150-201ENSMUST00000203317 2619 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Gm21887J3QQ04 Olfr1225-203ENSMUST00000217054 5517 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
Gm21887J3QQ04 Fam19a1-202ENSMUST00000122120 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
Gm21887J3QQ04 Gm24468-201ENSMUST00000104489 104 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Gm21887J3QQ04 Gm23910-201ENSMUST00000104597 132 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Gm21887J3QQ04 Mir466j-201ENSMUST00000116876 122 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Gm21887J3QQ04 Gm16328-201ENSMUST00000126985 196 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Gm21887J3QQ04 Gm15733-201ENSMUST00000132957 242 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Gm21887J3QQ04 Mir6379-201ENSMUST00000183392 115 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Gm21887J3QQ04 Gm44456-201ENSMUST00000196554 89 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Gm21887J3QQ04 Gm44807-201ENSMUST00000206115 154 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Gm21887J3QQ04 Hspe1-ps2-201ENSMUST00000051437 312 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Gm21887J3QQ04 Snora41-201ENSMUST00000082668 132 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Gm21887J3QQ04 Gm23507-201ENSMUST00000083078 107 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Gm21887J3QQ04 Pik3c2a-201ENSMUST00000170430 8044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
Gm21887J3QQ04 Gm37176-201ENSMUST00000193300 4051 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Gm21887J3QQ04 Gm26273-201ENSMUST00000104180 131 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Gm21887J3QQ04 Gm10059-201ENSMUST00000131139 171 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Gm21887J3QQ04 Gm23534-201ENSMUST00000157539 97 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Gm21887J3QQ04 Gm25658-201ENSMUST00000158472 128 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Gm21887J3QQ04 Gm16557-201ENSMUST00000159182 191 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Gm21887J3QQ04 Gm27517-201ENSMUST00000184347 236 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Gm21887J3QQ04 Gm29638-201ENSMUST00000186106 371 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
Gm21887J3QQ04 Gm44462-201ENSMUST00000199696 129 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Gm21887J3QQ04 Gm44515-201ENSMUST00000209045 379 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
Gm21887J3QQ04 Gm35041-201ENSMUST00000219581 602 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
Gm21887J3QQ04 AC129219.3-201ENSMUST00000223790 196 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Gm21887J3QQ04 AL645546.1-201ENSMUST00000225001 189 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Gm21887J3QQ04 Defb38-201ENSMUST00000066416 286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
Gm21887J3QQ04 Gm24044-201ENSMUST00000083107 156 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Gm21887J3QQ04 Olfr896-ps1-202ENSMUST00000215219 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
Gm21887J3QQ04 Trdn-201ENSMUST00000095762 4514 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
Gm21887J3QQ04 Gm26154-201ENSMUST00000102339 96 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Gm21887J3QQ04 Gm26421-201ENSMUST00000104279 132 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Gm21887J3QQ04 Gm24067-201ENSMUST00000104514 85 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Gm21887J3QQ04 Mir654-201ENSMUST00000104787 84 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Gm21887J3QQ04 Gm23172-201ENSMUST00000157160 124 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Gm21887J3QQ04 Gm22425-201ENSMUST00000158532 138 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Gm21887J3QQ04 Gm16539-201ENSMUST00000160086 327 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Gm21887J3QQ04 Traj61-201ENSMUST00000165025 72 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Gm21887J3QQ04 Mir5104-201ENSMUST00000175319 94 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Gm21887J3QQ04 Gm8069-201ENSMUST00000197887 154 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Gm21887J3QQ04 Snord104-201ENSMUST00000083192 70 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Gm21887J3QQ04 Zmym2-201ENSMUST00000022511 6974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
Gm21887J3QQ04 Kctd12b-202ENSMUST00000112572 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
Gm21887J3QQ04 Zfp160-201ENSMUST00000088811 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
Gm21887J3QQ04 Olfr677-202ENSMUST00000213204 3227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
Gm21887J3QQ04 Ptgs2-201ENSMUST00000035065 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
Gm21887J3QQ04 Gm22370-201ENSMUST00000102422 83 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Gm21887J3QQ04 Gm24230-201ENSMUST00000104313 129 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Gm21887J3QQ04 Gm23709-201ENSMUST00000104364 130 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Gm21887J3QQ04 Gm14588-201ENSMUST00000119895 172 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Gm21887J3QQ04 Gm26169-201ENSMUST00000158420 135 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Gm21887J3QQ04 Gm25044-201ENSMUST00000158603 104 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Gm21887J3QQ04 Gm25838-201ENSMUST00000158920 120 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Gm21887J3QQ04 Olfr1421-ps1-201ENSMUST00000208900 208 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Gm21887J3QQ04 AC160962.3-201ENSMUST00000225914 112 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Gm21887J3QQ04 Gm25187-201ENSMUST00000083906 133 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Gm21887J3QQ04 Atp11c-205ENSMUST00000154051 6039 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
Gm21887J3QQ04 Tug1-201ENSMUST00000132077 6719 ntTSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
Gm21887J3QQ04 Tug1-202ENSMUST00000144852 4720 ntTSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
Gm21887J3QQ04 Mir450b-201ENSMUST00000102095 82 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Gm21887J3QQ04 Igkv3-7-201ENSMUST00000103399 299 ntAPPRIS P1 BASIC1.91□□□□□ -2.1
Gm21887J3QQ04 Gm25919-201ENSMUST00000104271 132 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Gm21887J3QQ04 Gm25272-201ENSMUST00000104293 128 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Gm21887J3QQ04 Gm22772-201ENSMUST00000104451 121 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Gm21887J3QQ04 Gm26477-201ENSMUST00000122617 323 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Gm21887J3QQ04 Gm15767-202ENSMUST00000153786 544 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
Gm21887J3QQ04 Gm16550-201ENSMUST00000162550 126 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Gm21887J3QQ04 AC166574.7-201ENSMUST00000228502 704 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Gm21887J3QQ04 Gm23100-201ENSMUST00000083455 141 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Gm21887J3QQ04 Gm23796-201ENSMUST00000084011 160 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Gm21887J3QQ04 C230088H06Rik-202ENSMUST00000181752 3010 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
Gm21887J3QQ04 Naaladl2-202ENSMUST00000203414 9330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
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