Protein–RNA interactions for Protein: E9Q414

Apob, Apolipoprotein B-100, mousemouse

Predictions only

Length 4,505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobE9Q414 AC167019.1-201ENSMUST00000227913 106 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
ApobE9Q414 Mir1a-1-201ENSMUST00000093635 77 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
ApobE9Q414 AC102369.2-201ENSMUST00000219725 1679 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
ApobE9Q414 Gm22100-201ENSMUST00000157926 63 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
ApobE9Q414 Igkv13-82-201ENSMUST00000200308 346 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
ApobE9Q414 AC122225.1-201ENSMUST00000215641 369 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
ApobE9Q414 Gm22105-201ENSMUST00000116734 116 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
ApobE9Q414 Gm23317-201ENSMUST00000157999 129 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
ApobE9Q414 Gm23024-201ENSMUST00000158770 292 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
ApobE9Q414 Gm25627-201ENSMUST00000084003 153 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
ApobE9Q414 Mir7j-201ENSMUST00000184427 122 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
ApobE9Q414 Gm23316-201ENSMUST00000157997 114 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
ApobE9Q414 Gm16307-201ENSMUST00000161269 210 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
ApobE9Q414 Gm23002-201ENSMUST00000179221 107 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
ApobE9Q414 Gm44468-201ENSMUST00000199516 105 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
ApobE9Q414 Gm45689-201ENSMUST00000210522 133 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
ApobE9Q414 AC168056.1-201ENSMUST00000225270 180 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
ApobE9Q414 AC135292.1-201ENSMUST00000227665 204 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
ApobE9Q414 Cmc4-202ENSMUST00000120286 516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC-0.89□□□□□ -2.55
ApobE9Q414 Gm25637-201ENSMUST00000157529 107 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
ApobE9Q414 Gm22385-201ENSMUST00000158189 101 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
ApobE9Q414 Gm22118-201ENSMUST00000175593 171 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
ApobE9Q414 Gm26071-201ENSMUST00000083261 107 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
ApobE9Q414 Gm24430-201ENSMUST00000104077 104 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
ApobE9Q414 Olfr991-ps1-201ENSMUST00000215967 908 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
ApobE9Q414 Gm25357-201ENSMUST00000082745 72 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
ApobE9Q414 Gm22509-201ENSMUST00000082775 107 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
ApobE9Q414 Gm22169-201ENSMUST00000083229 107 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
ApobE9Q414 Gm10324-201ENSMUST00000092528 1815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.89□□□□□ -2.55
ApobE9Q414 AC158981.3-202ENSMUST00000228906 523 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
ApobE9Q414 Gm24582-201ENSMUST00000103967 103 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
ApobE9Q414 Gm24390-201ENSMUST00000179578 62 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
ApobE9Q414 Gm23056-201ENSMUST00000082803 111 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
ApobE9Q414 Gm11219-201ENSMUST00000118565 358 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
ApobE9Q414 Gm22452-201ENSMUST00000122804 104 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
ApobE9Q414 Gm24500-201ENSMUST00000158447 124 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
ApobE9Q414 Gm25894-201ENSMUST00000083458 75 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
ApobE9Q414 Gm24164-201ENSMUST00000093663 104 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
ApobE9Q414 Gm22805-201ENSMUST00000082739 107 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
ApobE9Q414 Vmn1r86-201ENSMUST00000094828 951 ntAPPRIS P2 BASIC-0.9□□□□□ -2.55
ApobE9Q414 Gm22221-201ENSMUST00000157362 103 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.55
ApobE9Q414 Gm22145-201ENSMUST00000157396 148 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.55
ApobE9Q414 Gm18417-201ENSMUST00000176564 648 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.55
ApobE9Q414 Gm23463-201ENSMUST00000122468 99 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
ApobE9Q414 Gm25559-201ENSMUST00000157182 74 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
ApobE9Q414 Gm22553-201ENSMUST00000157797 295 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
ApobE9Q414 Gm28191-201ENSMUST00000189112 211 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
ApobE9Q414 4930459L07Rik-201ENSMUST00000199751 420 ntTSL 1 (best) BASIC-0.91□□□□□ -2.56
ApobE9Q414 AC125190.3-201ENSMUST00000223224 121 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
ApobE9Q414 Gm12106-201ENSMUST00000116006 1200 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
ApobE9Q414 Gm13967-201ENSMUST00000120404 380 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
ApobE9Q414 Gm24853-201ENSMUST00000158026 121 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
ApobE9Q414 Gm23763-201ENSMUST00000158345 60 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
ApobE9Q414 Gm23118-201ENSMUST00000122657 187 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
ApobE9Q414 Gm23169-201ENSMUST00000157157 112 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
ApobE9Q414 Gm23858-201ENSMUST00000158384 106 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
ApobE9Q414 Gm25693-201ENSMUST00000175443 85 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
ApobE9Q414 Olfr795-ps1-201ENSMUST00000205245 763 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
ApobE9Q414 Gm23202-201ENSMUST00000104376 129 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
ApobE9Q414 Gm11794-201ENSMUST00000119446 237 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
ApobE9Q414 Rnu7-201ENSMUST00000158458 62 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
ApobE9Q414 Mir1936-201ENSMUST00000158699 93 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
ApobE9Q414 Gm26713-201ENSMUST00000181827 627 ntTSL 1 (best) BASIC-0.92□□□□□ -2.56
ApobE9Q414 Gm38295-201ENSMUST00000191951 151 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
ApobE9Q414 AC192334.2-201ENSMUST00000223087 1091 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
ApobE9Q414 Gm26143-201ENSMUST00000104480 108 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
ApobE9Q414 Gm24508-201ENSMUST00000180104 107 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
ApobE9Q414 Gm27236-201ENSMUST00000184147 442 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
ApobE9Q414 Gm29229-201ENSMUST00000188874 323 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
ApobE9Q414 Gm9772-201ENSMUST00000075018 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.92□□□□□ -2.56
ApobE9Q414 Gm25792-201ENSMUST00000083289 100 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
ApobE9Q414 Obox4-ps2-201ENSMUST00000185088 442 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
ApobE9Q414 Gm28595-201ENSMUST00000186223 437 ntTSL 5 BASIC-0.92□□□□□ -2.56
ApobE9Q414 Gm28930-201ENSMUST00000189525 437 ntTSL 5 BASIC-0.92□□□□□ -2.56
ApobE9Q414 Gm44391-201ENSMUST00000198490 93 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
ApobE9Q414 Gm12730-201ENSMUST00000125277 291 ntTSL 5 BASIC-0.93□□□□□ -2.56
ApobE9Q414 Gm4076-201ENSMUST00000179230 965 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
ApobE9Q414 Gm42516-201ENSMUST00000198691 767 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
ApobE9Q414 Gm24524-201ENSMUST00000082925 170 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
ApobE9Q414 Gm22576-201ENSMUST00000083733 104 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
ApobE9Q414 Gm25102-201ENSMUST00000122479 112 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
ApobE9Q414 Gm37624-201ENSMUST00000193751 219 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
ApobE9Q414 Vmn1r-ps6-201ENSMUST00000201079 934 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
ApobE9Q414 Gm25081-201ENSMUST00000082534 108 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
ApobE9Q414 Gm29352-201ENSMUST00000188054 544 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
ApobE9Q414 Igkv13-62-1-201ENSMUST00000198690 317 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
ApobE9Q414 Olfr783-ps1-201ENSMUST00000205105 441 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
ApobE9Q414 Gm14903-201ENSMUST00000122435 537 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
ApobE9Q414 Mirlet7a-2-201ENSMUST00000175029 96 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
ApobE9Q414 Gm37923-201ENSMUST00000191624 161 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
ApobE9Q414 Gm42924-201ENSMUST00000197261 185 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
ApobE9Q414 AC132104.1-201ENSMUST00000213615 260 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
ApobE9Q414 AC117656.1-201ENSMUST00000225826 339 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
ApobE9Q414 Mir350-201ENSMUST00000083639 99 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
ApobE9Q414 Nkain2-202ENSMUST00000092603 273 ntTSL 5 BASIC-0.94□□□□□ -2.56
ApobE9Q414 Gm14551-201ENSMUST00000120802 256 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
ApobE9Q414 Gm24005-201ENSMUST00000158459 296 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
ApobE9Q414 2310075C17Rik-201ENSMUST00000161216 326 ntTSL 1 (best) BASIC-0.94□□□□□ -2.56
ApobE9Q414 Gm37934-201ENSMUST00000192902 402 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
ApobE9Q414 Gm14671-201ENSMUST00000121790 262 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
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