Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1U1

Ccdc171, Coiled-coil domain-containing protein 171, mousemouse

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Length 1,324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc171E9Q1U1 Gm24355-201ENSMUST00000082858 122 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Ccdc171E9Q1U1 Gm24356-201ENSMUST00000082859 106 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Ccdc171E9Q1U1 Gm10972-201ENSMUST00000107276 81 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.47□□□□□ -2.33
Ccdc171E9Q1U1 Gm10721-201ENSMUST00000143083 669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.47□□□□□ -2.33
Ccdc171E9Q1U1 Gm16358-201ENSMUST00000146046 210 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Ccdc171E9Q1U1 Gm26484-201ENSMUST00000158018 106 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Ccdc171E9Q1U1 Gm26285-201ENSMUST00000177923 107 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Ccdc171E9Q1U1 Gm28506-201ENSMUST00000189937 150 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Ccdc171E9Q1U1 Gm44010-201ENSMUST00000204432 331 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Ccdc171E9Q1U1 AC144733.1-201ENSMUST00000222893 1289 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Ccdc171E9Q1U1 AC124196.2-201ENSMUST00000224835 145 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Ccdc171E9Q1U1 Gm23622-201ENSMUST00000082460 107 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Ccdc171E9Q1U1 Gm10718-201ENSMUST00000099046 681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.47□□□□□ -2.33
Ccdc171E9Q1U1 Snord98-201ENSMUST00000116819 65 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
Ccdc171E9Q1U1 Gm14287-201ENSMUST00000121060 117 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
Ccdc171E9Q1U1 Rhox11-ps3-201ENSMUST00000121166 233 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
Ccdc171E9Q1U1 Gm13596-201ENSMUST00000153354 292 ntTSL 5 BASIC0.46□□□□□ -2.34
Ccdc171E9Q1U1 Gm44828-201ENSMUST00000203745 106 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
Ccdc171E9Q1U1 AC192333.2-201ENSMUST00000224771 196 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
Ccdc171E9Q1U1 Gm25697-201ENSMUST00000082902 98 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
Ccdc171E9Q1U1 Mir324-201ENSMUST00000083600 89 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
Ccdc171E9Q1U1 Gm26500-201ENSMUST00000101867 106 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
Ccdc171E9Q1U1 Gm22759-201ENSMUST00000102276 96 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
Ccdc171E9Q1U1 Gm14884-201ENSMUST00000120456 196 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
Ccdc171E9Q1U1 Mir7039-201ENSMUST00000183852 85 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
Ccdc171E9Q1U1 Gm5001-201ENSMUST00000204361 331 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
Ccdc171E9Q1U1 AC124182.1-201ENSMUST00000227091 321 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
Ccdc171E9Q1U1 Gm23515-201ENSMUST00000082829 107 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
Ccdc171E9Q1U1 Rny1-201ENSMUST00000083767 112 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
Ccdc171E9Q1U1 Gm21750-201ENSMUST00000098874 1497 ntAPPRIS P1 BASIC0.45□□□□□ -2.34
Ccdc171E9Q1U1 Mir3079-201ENSMUST00000175428 90 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
Ccdc171E9Q1U1 Gm10715-202ENSMUST00000177969 681 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC0.44□□□□□ -2.34
Ccdc171E9Q1U1 Gm34302-201ENSMUST00000192926 243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.44□□□□□ -2.34
Ccdc171E9Q1U1 Vmn1r-ps16-201ENSMUST00000204747 105 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
Ccdc171E9Q1U1 Gm45556-201ENSMUST00000210689 345 ntTSL 5 BASIC0.44□□□□□ -2.34
Ccdc171E9Q1U1 Mir133a-1-201ENSMUST00000083465 68 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
Ccdc171E9Q1U1 Mir101a-201ENSMUST00000083517 83 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
Ccdc171E9Q1U1 Mir490-201ENSMUST00000093567 84 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
Ccdc171E9Q1U1 Gm34783-201ENSMUST00000209159 303 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
Ccdc171E9Q1U1 AC155712.1-201ENSMUST00000219704 160 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
Ccdc171E9Q1U1 CT033781.2-201ENSMUST00000221113 153 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
Ccdc171E9Q1U1 Gm25416-201ENSMUST00000104221 107 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
Ccdc171E9Q1U1 Gm25783-201ENSMUST00000122525 190 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
Ccdc171E9Q1U1 Gm25805-201ENSMUST00000122788 108 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
Ccdc171E9Q1U1 AI847159-201ENSMUST00000137728 305 ntTSL 2 BASIC0.42□□□□□ -2.34
Ccdc171E9Q1U1 Gm23169-201ENSMUST00000157157 112 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
Ccdc171E9Q1U1 Gm27365-201ENSMUST00000184041 177 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
Ccdc171E9Q1U1 Gm23448-201ENSMUST00000083151 104 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
Ccdc171E9Q1U1 Mir200b-201ENSMUST00000083615 70 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
Ccdc171E9Q1U1 Gm17148-201ENSMUST00000164702 249 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
Ccdc171E9Q1U1 BC050972-201ENSMUST00000168475 526 ntTSL 3 BASIC0.41□□□□□ -2.34
Ccdc171E9Q1U1 Gm37128-201ENSMUST00000192599 232 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
Ccdc171E9Q1U1 AC110380.1-201ENSMUST00000226987 389 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
Ccdc171E9Q1U1 Gm25507-201ENSMUST00000116981 144 ntBASIC0.4□□□□□ -2.34
Ccdc171E9Q1U1 Rpl23a-ps9-201ENSMUST00000188369 463 ntBASIC0.4□□□□□ -2.34
Ccdc171E9Q1U1 Rpl23a-ps11-201ENSMUST00000191583 463 ntBASIC0.4□□□□□ -2.34
Ccdc171E9Q1U1 Mir468-201ENSMUST00000197332 78 ntBASIC0.4□□□□□ -2.34
Ccdc171E9Q1U1 Gm23969-201ENSMUST00000083324 74 ntBASIC0.4□□□□□ -2.34
Ccdc171E9Q1U1 Gm23041-201ENSMUST00000083868 106 ntBASIC0.4□□□□□ -2.34
Ccdc171E9Q1U1 Gm23321-201ENSMUST00000104465 126 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
Ccdc171E9Q1U1 Gm11856-201ENSMUST00000118712 276 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
Ccdc171E9Q1U1 Gm6272-201ENSMUST00000121256 171 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
Ccdc171E9Q1U1 Gm23996-201ENSMUST00000158062 131 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
Ccdc171E9Q1U1 Gm22113-201ENSMUST00000158343 104 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
Ccdc171E9Q1U1 Mir1961-201ENSMUST00000158643 112 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
Ccdc171E9Q1U1 Gm25643-201ENSMUST00000158874 103 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
Ccdc171E9Q1U1 Gm16546-201ENSMUST00000159442 355 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
Ccdc171E9Q1U1 Gm26430-201ENSMUST00000178054 107 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
Ccdc171E9Q1U1 Gm27289-201ENSMUST00000183341 82 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
Ccdc171E9Q1U1 Gm25801-201ENSMUST00000082638 106 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
Ccdc171E9Q1U1 Gm24163-201ENSMUST00000093660 132 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
Ccdc171E9Q1U1 Gm23013-201ENSMUST00000104146 106 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
Ccdc171E9Q1U1 Gm14766-201ENSMUST00000121689 367 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
Ccdc171E9Q1U1 n-R5s207-201ENSMUST00000122497 118 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
Ccdc171E9Q1U1 Gm26152-201ENSMUST00000157427 101 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
Ccdc171E9Q1U1 Gm22945-201ENSMUST00000158557 157 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
Ccdc171E9Q1U1 Mir6346-201ENSMUST00000183982 81 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
Ccdc171E9Q1U1 Gm20923-201ENSMUST00000190009 319 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
Ccdc171E9Q1U1 Gm29276-201ENSMUST00000190453 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.38□□□□□ -2.35
Ccdc171E9Q1U1 Gm21088-201ENSMUST00000190875 316 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
Ccdc171E9Q1U1 Gm45027-201ENSMUST00000207081 78 ntTSL 3 BASIC0.38□□□□□ -2.35
Ccdc171E9Q1U1 AC113441.1-201ENSMUST00000223464 134 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
Ccdc171E9Q1U1 Gm22743-201ENSMUST00000083445 133 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
Ccdc171E9Q1U1 Gm8251-201ENSMUST00000168641 5985 ntAPPRIS P1 BASIC0.38□□□□□ -2.35
Ccdc171E9Q1U1 Gm23212-201ENSMUST00000122718 60 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
Ccdc171E9Q1U1 Gm20391-201ENSMUST00000174722 106 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
Ccdc171E9Q1U1 Gm26335-201ENSMUST00000178449 107 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
Ccdc171E9Q1U1 Gm37997-201ENSMUST00000193515 267 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
Ccdc171E9Q1U1 Gm44462-201ENSMUST00000199696 129 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
Ccdc171E9Q1U1 Gm45704-201ENSMUST00000212582 403 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
Ccdc171E9Q1U1 AC122298.1-201ENSMUST00000222574 165 ntTSL 5 BASIC0.38□□□□□ -2.35
Ccdc171E9Q1U1 AC117202.2-201ENSMUST00000226491 1101 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
Ccdc171E9Q1U1 Gm25627-201ENSMUST00000084003 153 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
Ccdc171E9Q1U1 Gm23898-201ENSMUST00000158111 103 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
Ccdc171E9Q1U1 Gm22914-201ENSMUST00000175195 77 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
Ccdc171E9Q1U1 Trgj4-201ENSMUST00000184430 61 ntAPPRIS P1 BASIC0.37□□□□□ -2.35
Ccdc171E9Q1U1 Gm28288-201ENSMUST00000191019 214 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
Ccdc171E9Q1U1 Gm19777-201ENSMUST00000191940 358 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
Ccdc171E9Q1U1 Gm26108-201ENSMUST00000083973 191 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
Ccdc171E9Q1U1 Gm10033-201ENSMUST00000072427 1813 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 182.4 ms