Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

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Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 CT010505.1-201ENSMUST00000227026 396 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
Col5a3Q9JLI2 Gm26056-201ENSMUST00000083043 104 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
Col5a3Q9JLI2 8030445P17Rik-201ENSMUST00000192614 2741 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
Col5a3Q9JLI2 Cylc1-201ENSMUST00000101282 1923 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.75□□□□□ -2.29
Col5a3Q9JLI2 Gm22193-201ENSMUST00000116868 76 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
Col5a3Q9JLI2 Rhox11-ps2-201ENSMUST00000117962 451 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
Col5a3Q9JLI2 Gm25423-201ENSMUST00000157609 107 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
Col5a3Q9JLI2 Mir1967-201ENSMUST00000157789 82 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
Col5a3Q9JLI2 Gm25333-201ENSMUST00000158035 246 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
Col5a3Q9JLI2 Gm20462-201ENSMUST00000172623 408 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r-ps23-201ENSMUST00000175708 295 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
Col5a3Q9JLI2 Gm21094-201ENSMUST00000177842 498 ntTSL 5 BASIC0.75□□□□□ -2.29
Col5a3Q9JLI2 Gm20837-201ENSMUST00000178446 498 ntTSL 5 BASIC0.75□□□□□ -2.29
Col5a3Q9JLI2 Gm21739-201ENSMUST00000178639 498 ntTSL 5 BASIC0.75□□□□□ -2.29
Col5a3Q9JLI2 Gm28891-201ENSMUST00000178751 498 ntTSL 5 BASIC0.75□□□□□ -2.29
Col5a3Q9JLI2 Gm28490-201ENSMUST00000179076 498 ntTSL 5 BASIC0.75□□□□□ -2.29
Col5a3Q9JLI2 Gm21861-201ENSMUST00000179480 498 ntTSL 5 BASIC0.75□□□□□ -2.29
Col5a3Q9JLI2 Gm24390-201ENSMUST00000179578 62 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
Col5a3Q9JLI2 Gm21256-201ENSMUST00000179672 498 ntTSL 5 BASIC0.75□□□□□ -2.29
Col5a3Q9JLI2 Gm20838-201ENSMUST00000179884 498 ntTSL 5 BASIC0.75□□□□□ -2.29
Col5a3Q9JLI2 Gm21679-201ENSMUST00000180373 498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.75□□□□□ -2.29
Col5a3Q9JLI2 Gm28930-201ENSMUST00000189525 437 ntTSL 5 BASIC0.75□□□□□ -2.29
Col5a3Q9JLI2 Gm28961-201ENSMUST00000190573 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.75□□□□□ -2.29
Col5a3Q9JLI2 Gm36953-201ENSMUST00000195295 268 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
Col5a3Q9JLI2 Mir3961-201ENSMUST00000198795 59 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
Col5a3Q9JLI2 Gm43472-201ENSMUST00000200175 154 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
Col5a3Q9JLI2 Gm44128-201ENSMUST00000204909 219 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
Col5a3Q9JLI2 Gm44654-201ENSMUST00000208052 329 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
Col5a3Q9JLI2 CT485612.2-201ENSMUST00000223014 151 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
Col5a3Q9JLI2 Gm5899-201ENSMUST00000071770 270 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
Col5a3Q9JLI2 Snora34-201ENSMUST00000083402 138 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
Col5a3Q9JLI2 Gm42755-201ENSMUST00000198533 1493 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
Col5a3Q9JLI2 Gm11859-201ENSMUST00000118099 455 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
Col5a3Q9JLI2 Gm11254-201ENSMUST00000122368 653 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
Col5a3Q9JLI2 Gm24810-201ENSMUST00000175317 70 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
Col5a3Q9JLI2 9230113P08Rik-202ENSMUST00000176153 414 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC0.74□□□□□ -2.29
Col5a3Q9JLI2 Gm19901-201ENSMUST00000192191 495 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
Col5a3Q9JLI2 AC160863.1-201ENSMUST00000218412 317 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
Col5a3Q9JLI2 AC100209.2-201ENSMUST00000224461 451 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
Col5a3Q9JLI2 Mir224-201ENSMUST00000083608 82 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r86-201ENSMUST00000094828 951 ntAPPRIS P2 BASIC0.74□□□□□ -2.29
Col5a3Q9JLI2 Traj35-201ENSMUST00000103706 65 ntAPPRIS P1 BASIC0.73□□□□□ -2.29
Col5a3Q9JLI2 A130030D18Rik-201ENSMUST00000128608 654 ntTSL 1 (best) BASIC0.73□□□□□ -2.29
Col5a3Q9JLI2 4930511O05Rik-201ENSMUST00000155912 391 ntTSL 1 (best) BASIC0.73□□□□□ -2.29
Col5a3Q9JLI2 Gm23854-201ENSMUST00000158378 108 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
Col5a3Q9JLI2 Cfap61-214ENSMUST00000167179 183 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
Col5a3Q9JLI2 Gm20613-201ENSMUST00000175828 345 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
Col5a3Q9JLI2 Gm24487-201ENSMUST00000178017 63 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
Col5a3Q9JLI2 Gm20874-201ENSMUST00000178356 663 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
Col5a3Q9JLI2 Gm22510-201ENSMUST00000179304 79 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
Col5a3Q9JLI2 Gm26336-201ENSMUST00000179449 79 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
Col5a3Q9JLI2 Gm26390-201ENSMUST00000179628 79 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
Col5a3Q9JLI2 Gm26200-201ENSMUST00000180273 79 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
Col5a3Q9JLI2 Gm28434-201ENSMUST00000187738 500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.73□□□□□ -2.29
Col5a3Q9JLI2 Gm44301-201ENSMUST00000200362 143 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
Col5a3Q9JLI2 Igkv13-55-1-201ENSMUST00000200400 308 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
Col5a3Q9JLI2 Gm34783-201ENSMUST00000209159 303 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
Col5a3Q9JLI2 Gm33654-201ENSMUST00000221704 215 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
Col5a3Q9JLI2 AC104832.1-201ENSMUST00000222938 550 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
Col5a3Q9JLI2 Gm26150-201ENSMUST00000157426 151 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
Col5a3Q9JLI2 Gm24005-201ENSMUST00000158459 296 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
Col5a3Q9JLI2 Gm24618-201ENSMUST00000177718 94 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
Col5a3Q9JLI2 Gm23953-201ENSMUST00000178214 94 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
Col5a3Q9JLI2 Gm26332-201ENSMUST00000179813 94 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
Col5a3Q9JLI2 Gm26180-201ENSMUST00000179942 107 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
Col5a3Q9JLI2 Gm22863-201ENSMUST00000180265 94 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
Col5a3Q9JLI2 Ranbp2-ps10-201ENSMUST00000185097 385 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
Col5a3Q9JLI2 Gm28257-201ENSMUST00000185244 463 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
Col5a3Q9JLI2 Gm18357-201ENSMUST00000188184 580 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
Col5a3Q9JLI2 Gm18291-201ENSMUST00000190791 301 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
Col5a3Q9JLI2 Gm28288-201ENSMUST00000191019 214 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
Col5a3Q9JLI2 Scgb2b2-202ENSMUST00000205821 357 ntTSL 5 BASIC0.72□□□□□ -2.29
Col5a3Q9JLI2 Gm7495-201ENSMUST00000215099 426 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
Col5a3Q9JLI2 Olfr942-ps1-201ENSMUST00000215640 662 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
Col5a3Q9JLI2 Gm3333-201ENSMUST00000221637 452 ntTSL 5 BASIC0.72□□□□□ -2.29
Col5a3Q9JLI2 Mir465b-1-201ENSMUST00000103940 79 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
Col5a3Q9JLI2 Mir465b-2-201ENSMUST00000104662 79 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
Col5a3Q9JLI2 Gm12434-201ENSMUST00000141580 653 ntTSL 1 (best) BASIC0.72□□□□□ -2.29
Col5a3Q9JLI2 Gm25054-201ENSMUST00000157370 97 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
Col5a3Q9JLI2 Gm22675-201ENSMUST00000158430 104 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
Col5a3Q9JLI2 Gm22075-201ENSMUST00000158599 192 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
Col5a3Q9JLI2 Gm26194-201ENSMUST00000175036 71 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
Col5a3Q9JLI2 Gm23090-201ENSMUST00000177331 78 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
Col5a3Q9JLI2 Gm22263-201ENSMUST00000180060 104 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
Col5a3Q9JLI2 Gm28398-201ENSMUST00000186587 166 ntTSL 5 BASIC0.72□□□□□ -2.29
Col5a3Q9JLI2 Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 184 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
Col5a3Q9JLI2 Gm29653-201ENSMUST00000187192 166 ntTSL 5 BASIC0.72□□□□□ -2.29
Col5a3Q9JLI2 Gm28810-201ENSMUST00000188173 166 ntTSL 5 BASIC0.72□□□□□ -2.29
Col5a3Q9JLI2 Gm28575-201ENSMUST00000188234 166 ntTSL 5 BASIC0.72□□□□□ -2.29
Col5a3Q9JLI2 Gm28132-201ENSMUST00000189901 166 ntTSL 5 BASIC0.72□□□□□ -2.29
Col5a3Q9JLI2 Gm29580-201ENSMUST00000189921 166 ntTSL 5 BASIC0.72□□□□□ -2.29
Col5a3Q9JLI2 Gm28858-201ENSMUST00000190517 166 ntTSL 5 BASIC0.72□□□□□ -2.29
Col5a3Q9JLI2 Gm28210-201ENSMUST00000190631 166 ntTSL 5 BASIC0.72□□□□□ -2.29
Col5a3Q9JLI2 Gm28336-201ENSMUST00000190743 166 ntTSL 5 BASIC0.72□□□□□ -2.29
Col5a3Q9JLI2 Gm29042-201ENSMUST00000191564 166 ntTSL 5 BASIC0.72□□□□□ -2.29
Col5a3Q9JLI2 Gm37998-201ENSMUST00000195699 166 ntTSL 5 BASIC0.72□□□□□ -2.29
Col5a3Q9JLI2 Gm26265-202ENSMUST00000196326 133 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
Col5a3Q9JLI2 Gm43993-201ENSMUST00000203972 247 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
Col5a3Q9JLI2 Gm25589-201ENSMUST00000082502 166 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
Col5a3Q9JLI2 Gm22685-201ENSMUST00000082848 106 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
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