Protein–RNA interactions for Protein: Q9D139

Lce1e, Late cornified envelope 1E, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lce1eQ9D139 Gm16523-202ENSMUST00000203640 4750 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Lce1eQ9D139 Olfr933-202ENSMUST00000216238 4475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.87□□□□□ -2.11
Lce1eQ9D139 Rbbp6-203ENSMUST00000098062 6345 ntTSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
Lce1eQ9D139 Olfr1354-202ENSMUST00000204587 3781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.87□□□□□ -2.11
Lce1eQ9D139 Kmt2d-201ENSMUST00000023741 19823 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
Lce1eQ9D139 Olfr849-202ENSMUST00000217273 6140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
Lce1eQ9D139 Acvr1c-202ENSMUST00000100085 4289 ntTSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
Lce1eQ9D139 Gm38259-201ENSMUST00000194602 3534 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Lce1eQ9D139 Olfr344-202ENSMUST00000215879 7675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
Lce1eQ9D139 Gm38211-201ENSMUST00000192814 7217 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Lce1eQ9D139 Olfr1260-202ENSMUST00000111512 4226 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.86□□□□□ -2.11
Lce1eQ9D139 Mmp16-201ENSMUST00000029881 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
Lce1eQ9D139 Olfr1442-202ENSMUST00000207341 3126 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
Lce1eQ9D139 Ros1-202ENSMUST00000218452 6960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
Lce1eQ9D139 Stx17-202ENSMUST00000107720 5770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
Lce1eQ9D139 Olfr1184-202ENSMUST00000216675 3164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
Lce1eQ9D139 Cntn6-202ENSMUST00000161070 3515 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
Lce1eQ9D139 Alkbh8-204ENSMUST00000211933 7674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
Lce1eQ9D139 Vmn1r220-203ENSMUST00000227679 7868 ntAPPRIS P1 BASIC1.86□□□□□ -2.11
Lce1eQ9D139 Vmn1r220-206ENSMUST00000228854 7854 ntAPPRIS P1 BASIC1.86□□□□□ -2.11
Lce1eQ9D139 Zfp654-201ENSMUST00000052588 4741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
Lce1eQ9D139 Tmc1-201ENSMUST00000039500 4073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
Lce1eQ9D139 Mbnl1-207ENSMUST00000192607 4552 ntTSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
Lce1eQ9D139 Fam126b-207ENSMUST00000161600 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
Lce1eQ9D139 Igkv6-17-201ENSMUST00000103391 377 ntAPPRIS P1 BASIC1.86□□□□□ -2.11
Lce1eQ9D139 Gm11356-201ENSMUST00000118974 192 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Lce1eQ9D139 Gm25846-201ENSMUST00000158013 135 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Lce1eQ9D139 Gm26036-201ENSMUST00000158149 144 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Lce1eQ9D139 Scarna13-201ENSMUST00000158164 275 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Lce1eQ9D139 Gm25522-201ENSMUST00000158394 105 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Lce1eQ9D139 Gm25044-201ENSMUST00000158603 104 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Lce1eQ9D139 Gm22664-201ENSMUST00000158719 105 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Lce1eQ9D139 Mir6369-201ENSMUST00000183772 106 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Lce1eQ9D139 Gm27805-201ENSMUST00000184513 79 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Lce1eQ9D139 Gm27492-201ENSMUST00000185194 187 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Lce1eQ9D139 Gm37998-201ENSMUST00000195699 166 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
Lce1eQ9D139 Gm43001-202ENSMUST00000199076 192 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
Lce1eQ9D139 CT030170.1-201ENSMUST00000222183 148 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Lce1eQ9D139 AC133517.1-202ENSMUST00000224409 233 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Lce1eQ9D139 AC166095.1-203ENSMUST00000224591 233 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Lce1eQ9D139 Gm22753-201ENSMUST00000083657 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Lce1eQ9D139 Gm24259-201ENSMUST00000083740 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Lce1eQ9D139 Vmn1r80-206ENSMUST00000228028 6918 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Lce1eQ9D139 AC132384.12-201ENSMUST00000219608 4227 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
Lce1eQ9D139 Gm44842-201ENSMUST00000209173 3372 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Lce1eQ9D139 Olfr362-202ENSMUST00000213817 4059 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
Lce1eQ9D139 4930444F02Rik-201ENSMUST00000215429 6871 ntTSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
Lce1eQ9D139 AC164629.4-201ENSMUST00000218505 3247 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Lce1eQ9D139 Kcnma1-208ENSMUST00000177634 4605 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
Lce1eQ9D139 Slc24a2-203ENSMUST00000107157 10531 ntTSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
Lce1eQ9D139 Igsf10-203ENSMUST00000194546 8393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
Lce1eQ9D139 Dnah2-201ENSMUST00000035539 13569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
Lce1eQ9D139 Zfp638-212ENSMUST00000203891 3968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
Lce1eQ9D139 Arhgef6-201ENSMUST00000033468 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
Lce1eQ9D139 Klhl28-203ENSMUST00000222508 6459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
Lce1eQ9D139 Tbl1xr1-201ENSMUST00000063988 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
Lce1eQ9D139 Olfr868-201ENSMUST00000212767 4196 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
Lce1eQ9D139 Foxr2-201ENSMUST00000096265 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
Lce1eQ9D139 Gm45804-201ENSMUST00000212137 3435 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Lce1eQ9D139 Traj20-201ENSMUST00000103721 58 ntAPPRIS P1 BASIC1.85□□□□□ -2.11
Lce1eQ9D139 Gm23482-201ENSMUST00000104172 122 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Lce1eQ9D139 Gm25564-201ENSMUST00000104604 132 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Lce1eQ9D139 Gm22338-201ENSMUST00000157715 129 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Lce1eQ9D139 Gm25865-201ENSMUST00000158247 104 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Lce1eQ9D139 Gm15796-201ENSMUST00000162135 204 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Lce1eQ9D139 Mir5134-201ENSMUST00000175529 78 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Lce1eQ9D139 Gm26712-201ENSMUST00000180813 217 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Lce1eQ9D139 Gm4707-202ENSMUST00000183937 276 ntAPPRIS P1 BASIC1.85□□□□□ -2.11
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Lce1eQ9D139 n-R5s62-201ENSMUST00000082780 96 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Lce1eQ9D139 Gm23511-201ENSMUST00000083084 164 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Lce1eQ9D139 Olfr591-202ENSMUST00000216581 4802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
Lce1eQ9D139 Gm5141-202ENSMUST00000201047 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
Lce1eQ9D139 Olfr1325-203ENSMUST00000216108 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
Lce1eQ9D139 Scn1a-203ENSMUST00000112366 8386 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
Lce1eQ9D139 Lcorl-204ENSMUST00000087164 4979 ntTSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
Lce1eQ9D139 Vmn1r89-203ENSMUST00000227176 4189 ntAPPRIS P2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
Lce1eQ9D139 Olfr417-203ENSMUST00000220394 6080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
Lce1eQ9D139 Olfr1477-202ENSMUST00000217001 4000 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
Lce1eQ9D139 Olfr810-203ENSMUST00000214878 4709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
Lce1eQ9D139 Mdn1-211ENSMUST00000178134 17959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
Lce1eQ9D139 Ankrd28-204ENSMUST00000227089 3522 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Lce1eQ9D139 Olfr1404-202ENSMUST00000216556 3305 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
Lce1eQ9D139 Gm20826-202ENSMUST00000185348 4605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
Lce1eQ9D139 Fat4-201ENSMUST00000061260 16109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
Lce1eQ9D139 Gm29674-202ENSMUST00000219664 4083 ntTSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
Lce1eQ9D139 Gm13961-201ENSMUST00000119282 4772 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Lce1eQ9D139 Fbxl17-204ENSMUST00000112840 3667 ntTSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
Lce1eQ9D139 Olfr586-203ENSMUST00000213281 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
Lce1eQ9D139 Olfr679-204ENSMUST00000215704 5018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
Lce1eQ9D139 Stxbp4-207ENSMUST00000143203 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
Lce1eQ9D139 AC121870.1-201ENSMUST00000216279 4879 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Lce1eQ9D139 Lrrc9-206ENSMUST00000162159 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
Lce1eQ9D139 Gm12039-201ENSMUST00000118219 180 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Lce1eQ9D139 Gm22514-201ENSMUST00000122547 308 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Lce1eQ9D139 Gm22551-201ENSMUST00000157795 103 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Lce1eQ9D139 Gm22965-201ENSMUST00000157958 101 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 285 ms