Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 AC122465.2-201ENSMUST00000221774 354 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Chmp3Q9CQ10 4930469B13Rik-202ENSMUST00000224808 348 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Chmp3Q9CQ10 Gm25124-201ENSMUST00000083345 164 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Chmp3Q9CQ10 Gm25409-201ENSMUST00000083764 131 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Chmp3Q9CQ10 Gm24030-201ENSMUST00000083931 164 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Chmp3Q9CQ10 Gm43706-201ENSMUST00000198767 2652 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Chmp3Q9CQ10 Traj44-201ENSMUST00000103698 61 ntAPPRIS P1 BASIC3.62□□□□□ -1.83
Chmp3Q9CQ10 Gm24598-201ENSMUST00000122510 74 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Chmp3Q9CQ10 Gm25323-201ENSMUST00000122555 103 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Chmp3Q9CQ10 Gm25828-201ENSMUST00000157087 95 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Chmp3Q9CQ10 Gm26215-201ENSMUST00000158584 139 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Chmp3Q9CQ10 Gm24510-201ENSMUST00000174965 94 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Chmp3Q9CQ10 Mir7039-201ENSMUST00000183852 85 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Chmp3Q9CQ10 Gm42719-201ENSMUST00000197393 355 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Chmp3Q9CQ10 Gm44976-201ENSMUST00000205543 261 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Chmp3Q9CQ10 Gm45456-201ENSMUST00000210841 243 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Chmp3Q9CQ10 Mir201-201ENSMUST00000083470 66 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Chmp3Q9CQ10 Gm45518-201ENSMUST00000210776 2583 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
Chmp3Q9CQ10 Zfp990-202ENSMUST00000105742 2996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
Chmp3Q9CQ10 Vmn1r185-206ENSMUST00000227479 6525 ntAPPRIS P1 BASIC3.61□□□□□ -1.83
Chmp3Q9CQ10 Mir374b-201ENSMUST00000102314 95 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Chmp3Q9CQ10 Gm11192-201ENSMUST00000127017 151 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
Chmp3Q9CQ10 Mir6350-201ENSMUST00000183639 105 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Chmp3Q9CQ10 Gm44399-201ENSMUST00000205043 226 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Chmp3Q9CQ10 AC158631.1-201ENSMUST00000219202 138 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Chmp3Q9CQ10 Gm24474-201ENSMUST00000220504 469 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
Chmp3Q9CQ10 Cdk13-205ENSMUST00000222800 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
Chmp3Q9CQ10 Olfr896-ps1-203ENSMUST00000216276 2921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
Chmp3Q9CQ10 Vmn1r211-202ENSMUST00000228645 5447 ntAPPRIS P1 BASIC3.61□□□□□ -1.83
Chmp3Q9CQ10 Gm38083-201ENSMUST00000194758 3498 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Chmp3Q9CQ10 Olfr1186-202ENSMUST00000215912 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Chmp3Q9CQ10 Olfr862-202ENSMUST00000079660 2604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Chmp3Q9CQ10 Gm24911-201ENSMUST00000157292 136 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Chmp3Q9CQ10 Gm36551-201ENSMUST00000196787 300 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Chmp3Q9CQ10 Mir155-201ENSMUST00000083463 65 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Chmp3Q9CQ10 Gm22576-201ENSMUST00000083733 104 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Chmp3Q9CQ10 Gm21876-201ENSMUST00000096511 282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Chmp3Q9CQ10 Zbtb37-203ENSMUST00000162226 18814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
Chmp3Q9CQ10 Olfr810-203ENSMUST00000214878 4709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Chmp3Q9CQ10 Vmn1r185-202ENSMUST00000226694 5656 ntAPPRIS P1 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Chmp3Q9CQ10 Scgb1b23-ps-201ENSMUST00000116009 252 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Chmp3Q9CQ10 Gm13200-201ENSMUST00000138802 258 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Chmp3Q9CQ10 Gm25825-201ENSMUST00000157091 124 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Chmp3Q9CQ10 Gm23043-201ENSMUST00000157890 109 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Chmp3Q9CQ10 Gm17117-201ENSMUST00000163665 299 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Chmp3Q9CQ10 Gm24813-201ENSMUST00000175310 84 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Chmp3Q9CQ10 Gm6060-201ENSMUST00000188671 251 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Chmp3Q9CQ10 Gm44921-201ENSMUST00000205290 301 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Chmp3Q9CQ10 Gm44715-201ENSMUST00000209049 3839 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Chmp3Q9CQ10 Gm26573-201ENSMUST00000181199 3020 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Chmp3Q9CQ10 Olfr389-201ENSMUST00000122224 3057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Chmp3Q9CQ10 Gm23644-201ENSMUST00000157856 77 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Chmp3Q9CQ10 Gm26084-201ENSMUST00000157903 104 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Chmp3Q9CQ10 Gm23504-201ENSMUST00000158988 95 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Chmp3Q9CQ10 Gm44358-201ENSMUST00000196301 98 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Chmp3Q9CQ10 Gm44028-201ENSMUST00000205205 355 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Chmp3Q9CQ10 AC168266.1-201ENSMUST00000216024 226 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Chmp3Q9CQ10 Gm23264-201ENSMUST00000083372 107 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Chmp3Q9CQ10 Zfp991-201ENSMUST00000084149 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
Chmp3Q9CQ10 Acsm3-201ENSMUST00000063770 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
Chmp3Q9CQ10 Olfr1161-202ENSMUST00000214438 3675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Chmp3Q9CQ10 n-R5s191-201ENSMUST00000122724 116 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Chmp3Q9CQ10 Olfr389-202ENSMUST00000124927 2781 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Chmp3Q9CQ10 Gm15733-201ENSMUST00000132957 242 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Chmp3Q9CQ10 Gm25488-201ENSMUST00000158728 118 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Chmp3Q9CQ10 Gm25491-201ENSMUST00000158733 308 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Chmp3Q9CQ10 Mir5123-201ENSMUST00000177794 83 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Chmp3Q9CQ10 Gm27698-201ENSMUST00000184060 249 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Chmp3Q9CQ10 Gm42844-201ENSMUST00000200355 112 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Chmp3Q9CQ10 Tlr7-201ENSMUST00000060719 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
Chmp3Q9CQ10 Mroh9-201ENSMUST00000096608 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
Chmp3Q9CQ10 Olfr896-ps1-202ENSMUST00000215219 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Chmp3Q9CQ10 Gm23911-201ENSMUST00000104596 134 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Chmp3Q9CQ10 Gm16355-201ENSMUST00000128606 231 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Chmp3Q9CQ10 Gm45886-201ENSMUST00000148141 342 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Chmp3Q9CQ10 Gm24958-201ENSMUST00000158009 97 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Chmp3Q9CQ10 Mir3965-201ENSMUST00000175570 69 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Chmp3Q9CQ10 Gm42716-203ENSMUST00000197140 259 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Chmp3Q9CQ10 Gm38211-201ENSMUST00000192814 7217 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Chmp3Q9CQ10 Pak3-203ENSMUST00000112864 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
Chmp3Q9CQ10 Gm14567-201ENSMUST00000117155 174 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Chmp3Q9CQ10 n-R5s189-201ENSMUST00000122675 114 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Chmp3Q9CQ10 Gm23325-201ENSMUST00000157422 129 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Chmp3Q9CQ10 Gm22509-201ENSMUST00000082775 107 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Chmp3Q9CQ10 Olfr776-202ENSMUST00000213512 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Chmp3Q9CQ10 Olfr1477-202ENSMUST00000217001 4000 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Chmp3Q9CQ10 Gm15697-201ENSMUST00000121946 2902 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Chmp3Q9CQ10 Gm25466-201ENSMUST00000103995 132 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Chmp3Q9CQ10 Rps15a-ps6-201ENSMUST00000117476 393 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Chmp3Q9CQ10 Gm26091-201ENSMUST00000122704 82 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Chmp3Q9CQ10 Gm22141-201ENSMUST00000157403 277 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Chmp3Q9CQ10 Gm22961-201ENSMUST00000157964 106 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Chmp3Q9CQ10 Gm24837-201ENSMUST00000158683 81 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Chmp3Q9CQ10 Gm27672-201ENSMUST00000183751 204 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Chmp3Q9CQ10 Snhg14-203ENSMUST00000185815 670 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
Chmp3Q9CQ10 Gm35736-201ENSMUST00000203681 313 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Chmp3Q9CQ10 Gm44057-201ENSMUST00000204547 96 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Chmp3Q9CQ10 Olfr1448-204ENSMUST00000216888 4064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
Chmp3Q9CQ10 Olfr1046-202ENSMUST00000213987 2770 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
Chmp3Q9CQ10 Olfr1229-203ENSMUST00000214593 3404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.8 ms