Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGQ1

Vipas39, Spermatogenesis-defective protein 39 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vipas39Q8BGQ1 AC145736.2-201ENSMUST00000216305 365 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
Vipas39Q8BGQ1 Olfr1108-ps1-201ENSMUST00000216930 121 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
Vipas39Q8BGQ1 Gm3333-201ENSMUST00000221637 452 ntTSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
Vipas39Q8BGQ1 Gm22294-201ENSMUST00000083308 104 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
Vipas39Q8BGQ1 Gm24163-201ENSMUST00000093660 132 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
Vipas39Q8BGQ1 Gm24116-201ENSMUST00000103975 107 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Vipas39Q8BGQ1 Arhgap5-201ENSMUST00000110725 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.36□□□□□ -2.19
Vipas39Q8BGQ1 Gm15002-201ENSMUST00000118406 452 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Vipas39Q8BGQ1 Gm16225-201ENSMUST00000146152 276 ntTSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
Vipas39Q8BGQ1 Gm22215-201ENSMUST00000157558 96 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Vipas39Q8BGQ1 Gm24501-201ENSMUST00000158452 62 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Vipas39Q8BGQ1 Gm26363-201ENSMUST00000158866 83 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Vipas39Q8BGQ1 Gm22510-201ENSMUST00000179304 79 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Vipas39Q8BGQ1 Gm26336-201ENSMUST00000179449 79 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Vipas39Q8BGQ1 Gm26390-201ENSMUST00000179628 79 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Vipas39Q8BGQ1 Gm27540-201ENSMUST00000184950 187 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Vipas39Q8BGQ1 Gm19777-201ENSMUST00000191940 358 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Vipas39Q8BGQ1 Gm42834-201ENSMUST00000196845 256 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Vipas39Q8BGQ1 Gm45456-201ENSMUST00000210841 243 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Vipas39Q8BGQ1 Olfr820-202ENSMUST00000214917 4701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
Vipas39Q8BGQ1 AC116460.1-201ENSMUST00000219040 313 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Vipas39Q8BGQ1 Gm23406-201ENSMUST00000082537 122 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Vipas39Q8BGQ1 Gm23845-201ENSMUST00000083834 152 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Vipas39Q8BGQ1 AC154515.1-201ENSMUST00000226085 2841 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Vipas39Q8BGQ1 Gm43706-201ENSMUST00000198767 2652 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Vipas39Q8BGQ1 Gm12512-201ENSMUST00000119620 217 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Vipas39Q8BGQ1 Gm12143-201ENSMUST00000119666 332 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Vipas39Q8BGQ1 n-R5s15-201ENSMUST00000122635 111 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Vipas39Q8BGQ1 Nell1os-202ENSMUST00000136672 491 ntTSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
Vipas39Q8BGQ1 Gm22537-201ENSMUST00000158172 199 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Vipas39Q8BGQ1 Gm26405-201ENSMUST00000158495 100 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Vipas39Q8BGQ1 Gm27997-201ENSMUST00000184942 69 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Vipas39Q8BGQ1 Mir376a-201ENSMUST00000197584 68 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Vipas39Q8BGQ1 Gm43220-201ENSMUST00000199299 282 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Vipas39Q8BGQ1 Mir7227-201ENSMUST00000200408 59 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Vipas39Q8BGQ1 Vmn1r-ps16-201ENSMUST00000204747 105 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Vipas39Q8BGQ1 AC164086.1-201ENSMUST00000221038 289 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Vipas39Q8BGQ1 AC173482.4-201ENSMUST00000225096 348 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Vipas39Q8BGQ1 Gm24316-201ENSMUST00000083041 107 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Vipas39Q8BGQ1 Mir181a-2-201ENSMUST00000083489 76 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Vipas39Q8BGQ1 Mirlet7c-1-201ENSMUST00000083623 94 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Vipas39Q8BGQ1 Olfr1222-203ENSMUST00000215816 3796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
Vipas39Q8BGQ1 Olfr183-201ENSMUST00000073320 2040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.35□□□□□ -2.19
Vipas39Q8BGQ1 Olfr805-203ENSMUST00000216794 3199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
Vipas39Q8BGQ1 Gm26150-201ENSMUST00000157426 151 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Vipas39Q8BGQ1 Gm24262-201ENSMUST00000157431 144 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Vipas39Q8BGQ1 Gm22216-201ENSMUST00000157557 114 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Vipas39Q8BGQ1 Gm25371-201ENSMUST00000158162 101 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Vipas39Q8BGQ1 Rnu7-201ENSMUST00000158458 62 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Vipas39Q8BGQ1 Olfr1366-201ENSMUST00000168629 1054 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.34□□□□□ -2.19
Vipas39Q8BGQ1 Gm22862-201ENSMUST00000178593 121 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Vipas39Q8BGQ1 Mir7683-201ENSMUST00000183842 61 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Vipas39Q8BGQ1 Gm27493-201ENSMUST00000184128 78 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Vipas39Q8BGQ1 Gm28992-201ENSMUST00000190534 139 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Vipas39Q8BGQ1 AC147560.1-201ENSMUST00000197528 107 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Vipas39Q8BGQ1 Mir3535-201ENSMUST00000197651 147 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Vipas39Q8BGQ1 Gm35736-201ENSMUST00000203681 313 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Vipas39Q8BGQ1 Olfr1421-ps1-201ENSMUST00000208900 208 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Vipas39Q8BGQ1 Olfr1366-204ENSMUST00000218154 1054 ntAPPRIS P2 BASIC1.34□□□□□ -2.19
Vipas39Q8BGQ1 Gm11351-202ENSMUST00000225724 478 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Vipas39Q8BGQ1 Gm26493-201ENSMUST00000083155 136 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Vipas39Q8BGQ1 Ppp4r3c-ps-201ENSMUST00000151416 2445 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Vipas39Q8BGQ1 Gm23941-201ENSMUST00000101953 107 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Vipas39Q8BGQ1 Gm6025-201ENSMUST00000121517 201 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Vipas39Q8BGQ1 Gm13725-201ENSMUST00000122139 207 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Vipas39Q8BGQ1 Gm24632-201ENSMUST00000122770 323 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Vipas39Q8BGQ1 Gm45886-201ENSMUST00000148141 342 ntTSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
Vipas39Q8BGQ1 Gm8121-201ENSMUST00000153583 499 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Vipas39Q8BGQ1 Gm22559-201ENSMUST00000157329 134 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Vipas39Q8BGQ1 Gm22082-201ENSMUST00000157587 161 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Vipas39Q8BGQ1 Gm25491-201ENSMUST00000158733 308 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Vipas39Q8BGQ1 Obox4-ps37-201ENSMUST00000177223 276 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Vipas39Q8BGQ1 Gm22448-201ENSMUST00000179254 107 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Vipas39Q8BGQ1 4930598A11Rik-201ENSMUST00000180742 628 ntTSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
Vipas39Q8BGQ1 Mir6388-201ENSMUST00000184417 75 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Vipas39Q8BGQ1 Gm9156-201ENSMUST00000189660 463 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Vipas39Q8BGQ1 Gm37763-201ENSMUST00000193445 120 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Vipas39Q8BGQ1 Gm37801-201ENSMUST00000194754 274 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Vipas39Q8BGQ1 Gm43035-201ENSMUST00000197626 517 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Vipas39Q8BGQ1 1700016B01Rik-201ENSMUST00000197688 270 ntTSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
Vipas39Q8BGQ1 Gm43406-201ENSMUST00000200356 334 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Vipas39Q8BGQ1 Gm45005-201ENSMUST00000206640 157 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Vipas39Q8BGQ1 Gm45543-201ENSMUST00000209327 88 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Vipas39Q8BGQ1 AC163033.1-201ENSMUST00000218608 157 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Vipas39Q8BGQ1 Gm23055-201ENSMUST00000082805 94 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Vipas39Q8BGQ1 Snord118-201ENSMUST00000082965 135 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Vipas39Q8BGQ1 Gm23100-201ENSMUST00000083455 141 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Vipas39Q8BGQ1 Olfr1002-202ENSMUST00000215548 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
Vipas39Q8BGQ1 Olfr141-201ENSMUST00000216117 2935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
Vipas39Q8BGQ1 Gm15861-201ENSMUST00000120979 339 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Vipas39Q8BGQ1 Gm23214-201ENSMUST00000122716 157 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Vipas39Q8BGQ1 Gm22485-201ENSMUST00000157990 109 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Vipas39Q8BGQ1 Gm23854-201ENSMUST00000158378 108 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Vipas39Q8BGQ1 Gm22075-201ENSMUST00000158599 192 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Vipas39Q8BGQ1 Gm16405-201ENSMUST00000169247 468 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
Vipas39Q8BGQ1 Mir3057-201ENSMUST00000175040 91 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Vipas39Q8BGQ1 Gm25035-201ENSMUST00000175414 77 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Vipas39Q8BGQ1 Gm7958-201ENSMUST00000178255 468 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Vipas39Q8BGQ1 Gm7950-201ENSMUST00000179633 468 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Vipas39Q8BGQ1 Gm37027-201ENSMUST00000194642 256 ntTSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.2 ms