Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Gm24892-201ENSMUST00000122747 104 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
Ccdc18Q640L5 Gm23586-201ENSMUST00000157657 123 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
Ccdc18Q640L5 Gm23589-201ENSMUST00000157660 105 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
Ccdc18Q640L5 Gm44375-201ENSMUST00000196657 150 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
Ccdc18Q640L5 AC156795.1-201ENSMUST00000214655 414 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
Ccdc18Q640L5 Gm22974-201ENSMUST00000083301 103 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
Ccdc18Q640L5 Gm14368-201ENSMUST00000145305 415 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
Ccdc18Q640L5 Mir1933-201ENSMUST00000158930 88 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
Ccdc18Q640L5 Vmn2r-ps18-201ENSMUST00000177972 380 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
Ccdc18Q640L5 Vmn2r-ps17-201ENSMUST00000178733 375 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
Ccdc18Q640L5 Gm14358-201ENSMUST00000118458 403 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
Ccdc18Q640L5 4930528H21Rik-201ENSMUST00000204264 495 ntTSL 1 (best) BASIC-1.26□□□□□ -2.61
Ccdc18Q640L5 Mir18-201ENSMUST00000083469 96 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
Ccdc18Q640L5 Ighv1-47-201ENSMUST00000103518 294 ntAPPRIS P1 BASIC-1.27□□□□□ -2.61
Ccdc18Q640L5 Gm13782-201ENSMUST00000149515 352 ntTSL 3 BASIC-1.27□□□□□ -2.61
Ccdc18Q640L5 Gm25839-201ENSMUST00000158921 103 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
Ccdc18Q640L5 Gm21726-201ENSMUST00000179654 392 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
Ccdc18Q640L5 Gm37313-201ENSMUST00000191673 290 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
Ccdc18Q640L5 Gm34073-201ENSMUST00000195736 212 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
Ccdc18Q640L5 Gm19032-201ENSMUST00000208584 592 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
Ccdc18Q640L5 Zfp934-201ENSMUST00000082203 993 ntTSL 5 BASIC-1.27□□□□□ -2.61
Ccdc18Q640L5 Gm25791-201ENSMUST00000083292 137 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
Ccdc18Q640L5 AC154506.4-201ENSMUST00000224898 3416 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
Ccdc18Q640L5 Gm14922-201ENSMUST00000121131 163 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
Ccdc18Q640L5 Gm22446-201ENSMUST00000180108 104 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
Ccdc18Q640L5 Mir6355-201ENSMUST00000183687 106 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
Ccdc18Q640L5 Gm26497-201ENSMUST00000083146 107 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
Ccdc18Q640L5 Gm22738-201ENSMUST00000083440 147 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
Ccdc18Q640L5 Gm45557-201ENSMUST00000210004 1651 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
Ccdc18Q640L5 Ranbp2-ps5-201ENSMUST00000185141 379 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
Ccdc18Q640L5 AC114916.1-201ENSMUST00000228465 494 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
Ccdc18Q640L5 Gm9772-201ENSMUST00000075018 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-1.29□□□□□ -2.62
Ccdc18Q640L5 Gm25006-201ENSMUST00000083813 107 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
Ccdc18Q640L5 Gm11794-201ENSMUST00000119446 237 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
Ccdc18Q640L5 Gm12779-201ENSMUST00000121496 143 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
Ccdc18Q640L5 Gm34408-201ENSMUST00000222104 655 ntTSL 5 BASIC-1.3□□□□□ -2.62
Ccdc18Q640L5 Gm24163-201ENSMUST00000093660 132 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
Ccdc18Q640L5 Gm11219-201ENSMUST00000118565 358 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
Ccdc18Q640L5 Gm24593-201ENSMUST00000122507 106 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
Ccdc18Q640L5 Snord8-201ENSMUST00000175303 110 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
Ccdc18Q640L5 Mir378c-201ENSMUST00000184478 99 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
Ccdc18Q640L5 Gm29229-201ENSMUST00000188874 323 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
Ccdc18Q640L5 Gm45489-201ENSMUST00000211753 443 ntTSL 3 BASIC-1.31□□□□□ -2.62
Ccdc18Q640L5 Stfa2-201ENSMUST00000023619 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-1.31□□□□□ -2.62
Ccdc18Q640L5 Gm4758-201ENSMUST00000114851 291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-1.31□□□□□ -2.62
Ccdc18Q640L5 Gm22193-201ENSMUST00000116868 76 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
Ccdc18Q640L5 n-R5s39-201ENSMUST00000122613 108 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
Ccdc18Q640L5 Gm14773-201ENSMUST00000125932 451 ntTSL 2 BASIC-1.31□□□□□ -2.62
Ccdc18Q640L5 Gm15243-201ENSMUST00000151101 382 ntTSL 2 BASIC-1.31□□□□□ -2.62
Ccdc18Q640L5 Gm24510-201ENSMUST00000174965 94 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
Ccdc18Q640L5 Mir1264-201ENSMUST00000175381 86 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
Ccdc18Q640L5 Gm35212-201ENSMUST00000196672 606 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
Ccdc18Q640L5 AC116465.1-201ENSMUST00000220324 235 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
Ccdc18Q640L5 Mir30c-2-201ENSMUST00000083633 84 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
Ccdc18Q640L5 Snord89-201ENSMUST00000104516 110 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
Ccdc18Q640L5 Gm20939-201ENSMUST00000108007 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-1.32□□□□□ -2.62
Ccdc18Q640L5 Obox4-ps34-201ENSMUST00000175879 520 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
Ccdc18Q640L5 Gm45471-201ENSMUST00000211270 281 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
Ccdc18Q640L5 Gm23454-201ENSMUST00000083332 133 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
Ccdc18Q640L5 Snord69-201ENSMUST00000104024 80 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
Ccdc18Q640L5 Gm14887-201ENSMUST00000119522 663 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
Ccdc18Q640L5 Gm15529-201ENSMUST00000121833 994 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
Ccdc18Q640L5 Gm23788-201ENSMUST00000122535 106 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
Ccdc18Q640L5 Mir1899-201ENSMUST00000122798 96 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
Ccdc18Q640L5 Gm18417-201ENSMUST00000176564 648 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
Ccdc18Q640L5 Gm22813-202ENSMUST00000200346 124 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
Ccdc18Q640L5 Gm44961-201ENSMUST00000207450 196 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
Ccdc18Q640L5 Gm45247-201ENSMUST00000210757 309 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
Ccdc18Q640L5 Gm30484-201ENSMUST00000200327 449 ntTSL 5 BASIC-1.34□□□□□ -2.62
Ccdc18Q640L5 Gm12045-201ENSMUST00000122122 573 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
Ccdc18Q640L5 Gm24500-201ENSMUST00000158447 124 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
Ccdc18Q640L5 Gm24634-201ENSMUST00000158672 107 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
Ccdc18Q640L5 Gm29640-201ENSMUST00000187972 278 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
Ccdc18Q640L5 Gm19790-201ENSMUST00000214414 251 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
Ccdc18Q640L5 AC101677.1-201ENSMUST00000218590 158 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
Ccdc18Q640L5 CT033781.2-201ENSMUST00000221113 153 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
Ccdc18Q640L5 Gm24629-201ENSMUST00000122762 89 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
Ccdc18Q640L5 Gm23196-201ENSMUST00000158806 107 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
Ccdc18Q640L5 AC116460.1-201ENSMUST00000219040 313 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
Ccdc18Q640L5 AC140477.1-201ENSMUST00000222354 246 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
Ccdc18Q640L5 Gm25799-201ENSMUST00000082643 107 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
Ccdc18Q640L5 Gm24430-201ENSMUST00000104077 104 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
Ccdc18Q640L5 Gm23065-201ENSMUST00000158236 130 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
Ccdc18Q640L5 Gm5269-201ENSMUST00000183590 138 ntAPPRIS P1 BASIC-1.37□□□□□ -2.63
Ccdc18Q640L5 Gm44419-201ENSMUST00000203338 229 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
Ccdc18Q640L5 AC163033.1-201ENSMUST00000218608 157 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
Ccdc18Q640L5 Gm25518-201ENSMUST00000083864 107 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
Ccdc18Q640L5 Zfp972-203ENSMUST00000108986 192 ntTSL 5 BASIC-1.37□□□□□ -2.63
Ccdc18Q640L5 Mir5124b-201ENSMUST00000184251 85 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
Ccdc18Q640L5 Trdv3-201ENSMUST00000198551 309 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
Ccdc18Q640L5 Gm44665-201ENSMUST00000205381 251 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
Ccdc18Q640L5 Gm10297-201ENSMUST00000207136 651 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
Ccdc18Q640L5 Gm25647-201ENSMUST00000101832 78 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
Ccdc18Q640L5 Gm25823-201ENSMUST00000101995 78 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
Ccdc18Q640L5 Gm24199-201ENSMUST00000157808 136 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
Ccdc18Q640L5 Gm24220-201ENSMUST00000177753 79 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
Ccdc18Q640L5 Gm25988-201ENSMUST00000177759 79 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
Ccdc18Q640L5 Gm23471-201ENSMUST00000177886 79 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
Ccdc18Q640L5 Gm26488-201ENSMUST00000178225 79 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
Ccdc18Q640L5 Gm23449-201ENSMUST00000179208 79 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
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