Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Mir6405-201ENSMUST00000184584 124 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ptchd1Q14B62 Gm27700-201ENSMUST00000185003 81 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ptchd1Q14B62 Gm38364-201ENSMUST00000191814 179 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ptchd1Q14B62 Gm42716-203ENSMUST00000197140 259 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
ptchd1Q14B62 Gm43264-201ENSMUST00000202284 325 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ptchd1Q14B62 Gm9967-203ENSMUST00000206903 408 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
ptchd1Q14B62 AC122465.2-201ENSMUST00000221774 354 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ptchd1Q14B62 Gm22681-201ENSMUST00000083853 106 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ptchd1Q14B62 Olfr1107-202ENSMUST00000214049 4388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
ptchd1Q14B62 Ctdspl2-202ENSMUST00000110572 4160 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
ptchd1Q14B62 AC125374.3-201ENSMUST00000214983 2810 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ptchd1Q14B62 Olfr389-201ENSMUST00000122224 3057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
ptchd1Q14B62 Olfr748-202ENSMUST00000213101 3632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
ptchd1Q14B62 Mir499-201ENSMUST00000102357 79 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ptchd1Q14B62 Gm24232-201ENSMUST00000104314 132 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ptchd1Q14B62 Gm22105-201ENSMUST00000116734 116 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ptchd1Q14B62 Gm9009-201ENSMUST00000117321 326 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ptchd1Q14B62 n-R5s191-201ENSMUST00000122724 116 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ptchd1Q14B62 Gm24717-201ENSMUST00000157522 124 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ptchd1Q14B62 Gm24813-201ENSMUST00000175310 84 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ptchd1Q14B62 Gm29613-201ENSMUST00000185846 313 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ptchd1Q14B62 Gm29544-201ENSMUST00000188860 313 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ptchd1Q14B62 Gm28808-201ENSMUST00000190978 313 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ptchd1Q14B62 Gm37796-201ENSMUST00000195327 134 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ptchd1Q14B62 CT025689.3-201ENSMUST00000223817 301 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ptchd1Q14B62 AC115735.1-201ENSMUST00000226633 350 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ptchd1Q14B62 AC149294.9-201ENSMUST00000227256 164 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ptchd1Q14B62 Gm23738-201ENSMUST00000082828 171 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ptchd1Q14B62 Gm25513-201ENSMUST00000083861 162 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ptchd1Q14B62 Gm21876-201ENSMUST00000096511 282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
ptchd1Q14B62 Vmn1r75-206ENSMUST00000228463 6508 ntAPPRIS P2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
ptchd1Q14B62 Slain1os-201ENSMUST00000160117 3101 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
ptchd1Q14B62 Olfr58-202ENSMUST00000215112 2454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
ptchd1Q14B62 Gm25938-201ENSMUST00000104139 166 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ptchd1Q14B62 Mir878-201ENSMUST00000104680 78 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ptchd1Q14B62 Gm14626-201ENSMUST00000117619 216 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ptchd1Q14B62 n-R5s189-201ENSMUST00000122675 114 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ptchd1Q14B62 Gm25130-201ENSMUST00000082650 156 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ptchd1Q14B62 Gm24461-201ENSMUST00000082735 103 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ptchd1Q14B62 Gm26456-201ENSMUST00000082831 111 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ptchd1Q14B62 Gm14327-201ENSMUST00000099001 192 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
ptchd1Q14B62 Gm15302-201ENSMUST00000117779 2630 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ptchd1Q14B62 Olfr201-202ENSMUST00000216834 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
ptchd1Q14B62 Gm43032-201ENSMUST00000197967 3123 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ptchd1Q14B62 Olfr1186-202ENSMUST00000215912 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
ptchd1Q14B62 Olfr1240-202ENSMUST00000216123 4603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
ptchd1Q14B62 Rps15a-ps6-201ENSMUST00000117476 393 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ptchd1Q14B62 Gm16355-201ENSMUST00000128606 231 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ptchd1Q14B62 Gm25491-201ENSMUST00000158733 308 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ptchd1Q14B62 Trav7-6-202ENSMUST00000184687 275 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
ptchd1Q14B62 Gm46233-201ENSMUST00000217831 449 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ptchd1Q14B62 n-R5s40-201ENSMUST00000082475 124 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ptchd1Q14B62 Gm25500-201ENSMUST00000104426 123 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ptchd1Q14B62 Tnfaip8-206ENSMUST00000145726 632 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
ptchd1Q14B62 Gm26099-201ENSMUST00000157248 109 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ptchd1Q14B62 Gm25280-201ENSMUST00000157269 101 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ptchd1Q14B62 Gm24879-201ENSMUST00000158386 143 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ptchd1Q14B62 Rpl31-ps15-201ENSMUST00000181857 375 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ptchd1Q14B62 Gm27527-201ENSMUST00000183903 99 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ptchd1Q14B62 Gm27505-201ENSMUST00000185071 110 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ptchd1Q14B62 Gm43521-201ENSMUST00000197838 255 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ptchd1Q14B62 Gm43107-201ENSMUST00000198729 255 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ptchd1Q14B62 Ptp4a1-206ENSMUST00000202889 135 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
ptchd1Q14B62 Gm44223-201ENSMUST00000204854 114 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ptchd1Q14B62 Gm45652-201ENSMUST00000210926 3831 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ptchd1Q14B62 Gpr174-201ENSMUST00000101294 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
ptchd1Q14B62 Olfr1046-202ENSMUST00000213987 2770 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
ptchd1Q14B62 Gm38162-201ENSMUST00000195562 4597 ntBASIC2.71□□□□□ -1.97
ptchd1Q14B62 Gm42801-201ENSMUST00000202562 2865 ntBASIC2.71□□□□□ -1.97
ptchd1Q14B62 Olfr652-204ENSMUST00000219111 5329 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
ptchd1Q14B62 Gm37566-201ENSMUST00000192363 4355 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ptchd1Q14B62 Gm25825-201ENSMUST00000157091 124 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ptchd1Q14B62 Gm24010-201ENSMUST00000157731 282 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ptchd1Q14B62 Gm23043-201ENSMUST00000157890 109 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ptchd1Q14B62 Mir6916-201ENSMUST00000184514 63 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ptchd1Q14B62 Gm36669-201ENSMUST00000201757 3650 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
ptchd1Q14B62 Ccdc18-201ENSMUST00000047677 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
ptchd1Q14B62 Vmn1r82-203ENSMUST00000227672 3651 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
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ptchd1Q14B62 Gm24634-201ENSMUST00000158672 107 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ptchd1Q14B62 Mir7081-201ENSMUST00000184490 75 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ptchd1Q14B62 Gm42855-201ENSMUST00000197388 253 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ptchd1Q14B62 Gm34314-201ENSMUST00000203622 367 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ptchd1Q14B62 Mir155-201ENSMUST00000083463 65 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ptchd1Q14B62 Olfr1208-202ENSMUST00000214121 2823 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
ptchd1Q14B62 Olfr1229-203ENSMUST00000214593 3404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
ptchd1Q14B62 Olfr1370-204ENSMUST00000215806 4322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
ptchd1Q14B62 AC154386.1-201ENSMUST00000222753 2871 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ptchd1Q14B62 Olfr1369-ps1-205ENSMUST00000215941 3597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
ptchd1Q14B62 Gm45844-205ENSMUST00000210333 3861 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
ptchd1Q14B62 Gm25323-201ENSMUST00000122555 103 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ptchd1Q14B62 Gm24691-201ENSMUST00000157762 140 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ptchd1Q14B62 Gm27934-201ENSMUST00000158795 63 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ptchd1Q14B62 Gm22858-201ENSMUST00000174972 76 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ptchd1Q14B62 Snord93-201ENSMUST00000175580 71 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ptchd1Q14B62 Snord61-201ENSMUST00000083176 71 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ptchd1Q14B62 Gm45558-201ENSMUST00000209384 1895 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ptchd1Q14B62 Olfr1161-202ENSMUST00000214438 3675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
ptchd1Q14B62 Olfr801-203ENSMUST00000213294 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
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