Protein–RNA interactions for Protein: Q148B6

Spatc1, Speriolin, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spatc1Q148B6 Gm25836-201ENSMUST00000158918 123 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Spatc1Q148B6 Snord50b-201ENSMUST00000178497 72 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Spatc1Q148B6 Gm27540-201ENSMUST00000184950 187 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Spatc1Q148B6 Gm28912-201ENSMUST00000189001 234 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Spatc1Q148B6 Gm28537-201ENSMUST00000189026 315 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Spatc1Q148B6 Gm29631-201ENSMUST00000191065 315 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Spatc1Q148B6 Mir7021-201ENSMUST00000197026 63 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Spatc1Q148B6 Gm45654-201ENSMUST00000210980 123 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Spatc1Q148B6 Olfr1070-ps1-201ENSMUST00000215939 388 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Spatc1Q148B6 AC170600.1-201ENSMUST00000228763 277 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Spatc1Q148B6 Gm24316-201ENSMUST00000083041 107 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Spatc1Q148B6 Gm24163-201ENSMUST00000093660 132 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Spatc1Q148B6 Gm42664-201ENSMUST00000199417 3239 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Spatc1Q148B6 Olfr1218-204ENSMUST00000215054 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
Spatc1Q148B6 AC154515.1-201ENSMUST00000226085 2841 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Spatc1Q148B6 Trgj3-201ENSMUST00000103562 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.66□□□□□ -2.14
Spatc1Q148B6 Gm13714-201ENSMUST00000117313 221 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Spatc1Q148B6 Gm11794-201ENSMUST00000119446 237 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Spatc1Q148B6 Gm25914-201ENSMUST00000157618 153 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Spatc1Q148B6 Gm24222-201ENSMUST00000158834 93 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Spatc1Q148B6 Gm25397-201ENSMUST00000176951 92 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Spatc1Q148B6 Ranbp2-ps7-201ENSMUST00000183924 384 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Spatc1Q148B6 Mir6419-201ENSMUST00000184784 113 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Spatc1Q148B6 Gm20923-201ENSMUST00000190009 319 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Spatc1Q148B6 Gm21088-201ENSMUST00000190875 316 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Spatc1Q148B6 Gm37579-201ENSMUST00000194291 142 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Spatc1Q148B6 AC098718.2-201ENSMUST00000226822 285 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Spatc1Q148B6 AC163295.1-201ENSMUST00000227840 314 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Spatc1Q148B6 Gm25930-201ENSMUST00000082785 107 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Spatc1Q148B6 Gm29106-201ENSMUST00000186264 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
Spatc1Q148B6 Zfp600-201ENSMUST00000092750 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.14
Spatc1Q148B6 Traj26-201ENSMUST00000103715 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.65□□□□□ -2.15
Spatc1Q148B6 Gm15213-201ENSMUST00000122098 216 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Spatc1Q148B6 Gm27723-201ENSMUST00000157398 63 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Spatc1Q148B6 Gm17161-201ENSMUST00000169187 524 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Spatc1Q148B6 Mir3057-201ENSMUST00000175040 91 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Spatc1Q148B6 Gm21905-201ENSMUST00000177616 87 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
Spatc1Q148B6 Mir6379-201ENSMUST00000183392 115 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Spatc1Q148B6 Mir7241-201ENSMUST00000184532 64 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Spatc1Q148B6 Gm28849-201ENSMUST00000188127 174 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Spatc1Q148B6 Gm28330-201ENSMUST00000190353 171 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Spatc1Q148B6 Gm38407-201ENSMUST00000218017 474 ntTSL 2 BASIC1.65□□□□□ -2.15
Spatc1Q148B6 Gm29818-201ENSMUST00000218070 165 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Spatc1Q148B6 Gm25636-201ENSMUST00000082666 133 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Spatc1Q148B6 Gm24165-201ENSMUST00000082718 128 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Spatc1Q148B6 Olfr1225-203ENSMUST00000217054 5517 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
Spatc1Q148B6 Olfr67-201ENSMUST00000183254 3851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
Spatc1Q148B6 Gm25090-201ENSMUST00000104000 132 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Spatc1Q148B6 Gm23836-201ENSMUST00000104434 129 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Spatc1Q148B6 Gm16328-201ENSMUST00000126985 196 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Spatc1Q148B6 Gm24262-201ENSMUST00000157431 144 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Spatc1Q148B6 Gm22315-201ENSMUST00000158010 143 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Spatc1Q148B6 Gm23208-201ENSMUST00000158666 127 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Spatc1Q148B6 Gm16405-201ENSMUST00000169247 468 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
Spatc1Q148B6 Gm7958-201ENSMUST00000178255 468 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Spatc1Q148B6 Gm7950-201ENSMUST00000179633 468 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Spatc1Q148B6 Gm29490-201ENSMUST00000190923 342 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Spatc1Q148B6 4930598N05Rik-207ENSMUST00000208997 83 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
Spatc1Q148B6 Gm45543-201ENSMUST00000209327 88 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Spatc1Q148B6 Gm31447-201ENSMUST00000222345 384 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
Spatc1Q148B6 Olfr1448-203ENSMUST00000213713 4336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
Spatc1Q148B6 Gm37602-201ENSMUST00000195187 3310 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Spatc1Q148B6 Pcdh11x-208ENSMUST00000193899 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
Spatc1Q148B6 Gm25423-201ENSMUST00000157609 107 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Spatc1Q148B6 Gm23289-201ENSMUST00000175615 108 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Spatc1Q148B6 Gm21060-201ENSMUST00000179346 168 ntAPPRIS P1 BASIC1.63□□□□□ -2.15
Spatc1Q148B6 Gm27443-201ENSMUST00000184660 98 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Spatc1Q148B6 Gm27544-201ENSMUST00000185069 155 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Spatc1Q148B6 Gm28881-201ENSMUST00000187710 470 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
Spatc1Q148B6 Mir465d-201ENSMUST00000196314 58 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Spatc1Q148B6 Gm19855-201ENSMUST00000210145 249 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Spatc1Q148B6 Gm45313-201ENSMUST00000210584 178 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Spatc1Q148B6 AC126691.1-201ENSMUST00000226534 202 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Spatc1Q148B6 Gm26922-201ENSMUST00000082687 72 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Spatc1Q148B6 Gm23378-201ENSMUST00000082942 107 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Spatc1Q148B6 Olfr1002-202ENSMUST00000215548 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
Spatc1Q148B6 Mir767-201ENSMUST00000103256 107 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Spatc1Q148B6 Mir758-201ENSMUST00000103260 81 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Spatc1Q148B6 Gm14491-201ENSMUST00000121919 199 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Spatc1Q148B6 Mir669n-201ENSMUST00000158636 54 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Spatc1Q148B6 Mir7225-201ENSMUST00000184178 54 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Spatc1Q148B6 Olfr1153-202ENSMUST00000217436 2144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
Spatc1Q148B6 Snord14a-201ENSMUST00000082807 87 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Spatc1Q148B6 Mir92-2-201ENSMUST00000083679 91 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Spatc1Q148B6 Olfr730-202ENSMUST00000205837 4903 ntAPPRIS ALT1 BASIC1.61□□□□□ -2.15
Spatc1Q148B6 Gm25938-201ENSMUST00000104139 166 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Spatc1Q148B6 Gm23109-201ENSMUST00000116867 126 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Spatc1Q148B6 Gm25541-201ENSMUST00000116888 126 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Spatc1Q148B6 Gm14919-201ENSMUST00000120839 390 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Spatc1Q148B6 Gm15327-202ENSMUST00000153958 467 ntTSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
Spatc1Q148B6 Gm23170-201ENSMUST00000157158 106 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Spatc1Q148B6 Gm27521-201ENSMUST00000184022 64 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Spatc1Q148B6 Mir6901-201ENSMUST00000185062 62 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Spatc1Q148B6 Gm28453-203ENSMUST00000187041 189 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Spatc1Q148B6 1700010N08Rik-201ENSMUST00000187456 189 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Spatc1Q148B6 AC098718.1-201ENSMUST00000226166 175 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Spatc1Q148B6 AC115735.2-201ENSMUST00000227135 351 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Spatc1Q148B6 Defb50-201ENSMUST00000078879 373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
Spatc1Q148B6 Gm23679-201ENSMUST00000083161 119 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Spatc1Q148B6 Mirlet7c-1-201ENSMUST00000083623 94 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 193 ms