Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Gm24966-201ENSMUST00000082443 79 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Sh3bp1P55194 Gm24204-201ENSMUST00000082950 107 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Sh3bp1P55194 Olfr576-201ENSMUST00000098213 3132 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
Sh3bp1P55194 Vmn1r178-202ENSMUST00000226450 2880 ntAPPRIS P1 BASIC2.28□□□□□ -2.04
Sh3bp1P55194 Gm45518-201ENSMUST00000210776 2583 ntTSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
Sh3bp1P55194 Olfr1044-202ENSMUST00000215171 3266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
Sh3bp1P55194 Mir223-201ENSMUST00000102112 110 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Sh3bp1P55194 Gm23705-201ENSMUST00000104370 130 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Sh3bp1P55194 Gm12941-201ENSMUST00000117934 220 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Sh3bp1P55194 Gm22159-201ENSMUST00000158412 130 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Sh3bp1P55194 Gm22093-201ENSMUST00000158980 111 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Sh3bp1P55194 Gm28992-201ENSMUST00000190534 139 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Sh3bp1P55194 Gm44666-201ENSMUST00000208544 391 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Sh3bp1P55194 Gm44938-201ENSMUST00000208614 427 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Sh3bp1P55194 AC133598.3-201ENSMUST00000224322 568 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Sh3bp1P55194 CT485608.2-201ENSMUST00000227210 291 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Sh3bp1P55194 Mir181b-2-201ENSMUST00000083644 89 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Sh3bp1P55194 Gm24164-201ENSMUST00000093663 104 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Sh3bp1P55194 Gm43484-201ENSMUST00000198333 5966 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Sh3bp1P55194 Vmn1r185-210ENSMUST00000228367 6982 ntAPPRIS P1 BASIC2.27□□□□□ -2.05
Sh3bp1P55194 Gm14327-202ENSMUST00000108935 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
Sh3bp1P55194 Trgj3-201ENSMUST00000103562 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.27□□□□□ -2.05
Sh3bp1P55194 Gm25943-201ENSMUST00000103791 90 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Sh3bp1P55194 Mir466b-7-201ENSMUST00000103804 88 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Sh3bp1P55194 Mir466b-5-201ENSMUST00000103900 88 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Sh3bp1P55194 Mir467g-201ENSMUST00000116906 120 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Sh3bp1P55194 Gm12143-201ENSMUST00000119666 332 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Sh3bp1P55194 Gm13433-201ENSMUST00000121701 240 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Sh3bp1P55194 Mir466b-4-201ENSMUST00000178801 90 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Sh3bp1P55194 Gm25285-201ENSMUST00000178951 90 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Sh3bp1P55194 Mir466b-6-201ENSMUST00000180061 90 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Sh3bp1P55194 Mir466c-2-201ENSMUST00000180211 90 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Sh3bp1P55194 Olfr375-ps1-201ENSMUST00000198131 249 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Sh3bp1P55194 Olfr1041-ps1-201ENSMUST00000215884 271 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Sh3bp1P55194 AC122367.2-201ENSMUST00000220987 534 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
Sh3bp1P55194 Gm24977-201ENSMUST00000083106 163 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Sh3bp1P55194 Gm26077-201ENSMUST00000104064 123 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Sh3bp1P55194 Gm24010-201ENSMUST00000157731 282 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Sh3bp1P55194 Gm24900-201ENSMUST00000158128 134 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Sh3bp1P55194 Gm23858-201ENSMUST00000158384 106 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Sh3bp1P55194 Gm29022-201ENSMUST00000190702 225 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Sh3bp1P55194 Vmn2r-ps50-201ENSMUST00000209317 120 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Sh3bp1P55194 AC122428.1-201ENSMUST00000213709 217 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
Sh3bp1P55194 Gm24625-201ENSMUST00000082622 130 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Sh3bp1P55194 Gm22972-201ENSMUST00000083297 131 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Sh3bp1P55194 Mir322-201ENSMUST00000083484 95 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Sh3bp1P55194 Catsperb-201ENSMUST00000055156 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
Sh3bp1P55194 Zfp273-201ENSMUST00000012725 2277 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
Sh3bp1P55194 Gm23492-201ENSMUST00000116837 115 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Sh3bp1P55194 Gm23841-201ENSMUST00000116951 114 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Sh3bp1P55194 Gm12815-201ENSMUST00000121737 135 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Sh3bp1P55194 Gm22281-201ENSMUST00000157198 103 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Sh3bp1P55194 Gm25460-201ENSMUST00000157954 127 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Sh3bp1P55194 Gm20630-201ENSMUST00000177387 551 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Sh3bp1P55194 Gm23002-201ENSMUST00000179221 107 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Sh3bp1P55194 Gm25253-201ENSMUST00000179958 107 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Sh3bp1P55194 Ighv12-2-201ENSMUST00000191949 362 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Sh3bp1P55194 Gm37918-201ENSMUST00000192071 120 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Sh3bp1P55194 Gm42774-201ENSMUST00000198854 283 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Sh3bp1P55194 CT954323.1-201ENSMUST00000222774 229 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Sh3bp1P55194 Defb50-201ENSMUST00000078879 373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
Sh3bp1P55194 Lipi-201ENSMUST00000062721 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
Sh3bp1P55194 Gm12417-201ENSMUST00000119153 403 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Sh3bp1P55194 Gm24729-201ENSMUST00000158225 137 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Sh3bp1P55194 Gm23258-201ENSMUST00000158319 106 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Sh3bp1P55194 Gm22433-201ENSMUST00000158550 142 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Sh3bp1P55194 Gm23548-201ENSMUST00000158963 106 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Sh3bp1P55194 Gm25749-201ENSMUST00000175485 111 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Sh3bp1P55194 Igkv14-118-1-201ENSMUST00000198645 334 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Sh3bp1P55194 Mir767-201ENSMUST00000103256 107 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Sh3bp1P55194 Gm24283-201ENSMUST00000104233 107 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Sh3bp1P55194 Gm15611-201ENSMUST00000146928 406 ntTSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
Sh3bp1P55194 Gm25115-201ENSMUST00000157187 140 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Sh3bp1P55194 Gm24237-201ENSMUST00000157790 132 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Sh3bp1P55194 Gm2962-201ENSMUST00000159266 336 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Sh3bp1P55194 Gm17052-201ENSMUST00000165496 289 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Sh3bp1P55194 Gm24333-201ENSMUST00000175101 84 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Sh3bp1P55194 Gm25035-201ENSMUST00000175414 77 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Sh3bp1P55194 Gm22621-201ENSMUST00000179678 74 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Sh3bp1P55194 Mir6997-201ENSMUST00000184313 71 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Sh3bp1P55194 Ighv1-1-201ENSMUST00000194912 291 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Sh3bp1P55194 Vmn1r-ps6-202ENSMUST00000202526 135 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
Sh3bp1P55194 5430435K18Rik-201ENSMUST00000202597 661 ntTSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
Sh3bp1P55194 Mir429-201ENSMUST00000083493 83 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Sh3bp1P55194 Ighv3-1-201ENSMUST00000103478 350 ntAPPRIS P1 BASIC2.22□□□□□ -2.05
Sh3bp1P55194 Gm23836-201ENSMUST00000104434 129 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Sh3bp1P55194 Gm15162-201ENSMUST00000119325 283 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Sh3bp1P55194 Gm23172-201ENSMUST00000157160 124 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Sh3bp1P55194 Gm23536-201ENSMUST00000157541 134 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Sh3bp1P55194 Gm23219-201ENSMUST00000158123 87 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Sh3bp1P55194 Gm27694-201ENSMUST00000184740 86 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Sh3bp1P55194 Mir7226-201ENSMUST00000184953 60 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Sh3bp1P55194 Gm19123-201ENSMUST00000190716 651 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Sh3bp1P55194 Gm42834-201ENSMUST00000196845 256 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Sh3bp1P55194 AC159896.1-201ENSMUST00000215264 215 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Sh3bp1P55194 AC098718.2-201ENSMUST00000226822 285 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Sh3bp1P55194 Gm26493-201ENSMUST00000083155 136 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Sh3bp1P55194 Gm10360-201ENSMUST00000097219 272 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Sh3bp1P55194 Vmn1r75-205ENSMUST00000228268 4376 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
Sh3bp1P55194 Gm37602-201ENSMUST00000195187 3310 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 116.8 ms