Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Mir1936-201ENSMUST00000158699 93 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Hoxd10P28359 Vmn2r-ps65-201ENSMUST00000173309 220 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Hoxd10P28359 Gm20438-201ENSMUST00000174441 329 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Hoxd10P28359 Gm23090-201ENSMUST00000177331 78 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Hoxd10P28359 4930598A11Rik-201ENSMUST00000180742 628 ntTSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
Hoxd10P28359 Gm28008-201ENSMUST00000184021 186 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Hoxd10P28359 Gm37338-201ENSMUST00000191986 127 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Hoxd10P28359 1700016B01Rik-201ENSMUST00000197688 270 ntTSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
Hoxd10P28359 Gm45616-201ENSMUST00000211711 319 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Hoxd10P28359 AC164161.1-201ENSMUST00000214076 639 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Hoxd10P28359 AC154245.1-201ENSMUST00000224615 601 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Hoxd10P28359 Gm11351-202ENSMUST00000225724 478 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Hoxd10P28359 Gm24977-201ENSMUST00000083106 163 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Hoxd10P28359 Gm22972-201ENSMUST00000083297 131 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Hoxd10P28359 Slco6c1-201ENSMUST00000027569 2747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
Hoxd10P28359 mt-Nd4-201ENSMUST00000082414 1378 ntAPPRIS P1 BASIC1.6□□□□□ -2.15
Hoxd10P28359 Ighv3-1-201ENSMUST00000103478 350 ntAPPRIS P1 BASIC1.6□□□□□ -2.15
Hoxd10P28359 Gm23214-201ENSMUST00000122716 157 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Hoxd10P28359 Gm14773-201ENSMUST00000125932 451 ntTSL 2 BASIC1.6□□□□□ -2.15
Hoxd10P28359 Gm23474-201ENSMUST00000158884 75 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Hoxd10P28359 Gm22565-201ENSMUST00000175540 69 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Hoxd10P28359 Gm25450-201ENSMUST00000179144 107 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Hoxd10P28359 Gm20144-201ENSMUST00000203031 165 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Hoxd10P28359 Gm44858-201ENSMUST00000207360 154 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Hoxd10P28359 Gm44655-201ENSMUST00000207768 423 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Hoxd10P28359 2210407C18Rik-201ENSMUST00000048801 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
Hoxd10P28359 Gm25930-201ENSMUST00000082785 107 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Hoxd10P28359 Mir181a-2-201ENSMUST00000083489 76 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Hoxd10P28359 Snhg14-209ENSMUST00000188976 2193 ntTSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.15
Hoxd10P28359 Ppp4r3c-ps-201ENSMUST00000151416 2445 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Hoxd10P28359 AC161250.2-201ENSMUST00000215114 3107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Hoxd10P28359 Mir669l-201ENSMUST00000103771 98 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Hoxd10P28359 Gm23015-201ENSMUST00000104145 128 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Hoxd10P28359 Gm15002-201ENSMUST00000118406 452 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Hoxd10P28359 Gm11862-201ENSMUST00000119678 659 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Hoxd10P28359 n-R5s187-201ENSMUST00000122769 111 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Hoxd10P28359 Gm23636-201ENSMUST00000175070 95 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Hoxd10P28359 Gm24390-201ENSMUST00000179578 62 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Hoxd10P28359 Gm17067-202ENSMUST00000180131 123 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Hoxd10P28359 Gm18357-201ENSMUST00000188184 580 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Hoxd10P28359 Gm19777-201ENSMUST00000191940 358 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Hoxd10P28359 Gm35736-201ENSMUST00000203681 313 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Hoxd10P28359 Vmn1r-ps16-201ENSMUST00000204747 105 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Hoxd10P28359 Gm45456-201ENSMUST00000210841 243 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Hoxd10P28359 Gm46997-201ENSMUST00000222108 217 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Hoxd10P28359 Gm5899-201ENSMUST00000071770 270 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Hoxd10P28359 Gm24252-201ENSMUST00000083700 132 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Hoxd10P28359 Gm10542-201ENSMUST00000097586 273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
Hoxd10P28359 Gm15102-201ENSMUST00000118740 1502 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
Hoxd10P28359 Gm15101-201ENSMUST00000178818 1502 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
Hoxd10P28359 Gm24079-201ENSMUST00000104352 132 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Hoxd10P28359 Gm9059-201ENSMUST00000118319 183 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Hoxd10P28359 Gm17052-201ENSMUST00000165496 289 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Hoxd10P28359 Gm22862-201ENSMUST00000178593 121 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Hoxd10P28359 Gm29147-201ENSMUST00000186846 315 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Hoxd10P28359 Gm29227-201ENSMUST00000187139 315 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Hoxd10P28359 Gm29034-201ENSMUST00000188099 315 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Hoxd10P28359 Gm28160-201ENSMUST00000191229 315 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Hoxd10P28359 Gm37129-201ENSMUST00000195791 315 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Hoxd10P28359 Gm44458-201ENSMUST00000196594 143 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Hoxd10P28359 Gm18546-201ENSMUST00000197245 676 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Hoxd10P28359 Vmn1r-ps13-201ENSMUST00000204697 134 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Hoxd10P28359 CT009696.1-201ENSMUST00000215745 256 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Hoxd10P28359 Gm18188-201ENSMUST00000219386 478 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Hoxd10P28359 Gm24615-201ENSMUST00000083268 113 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Hoxd10P28359 Mir669i-201ENSMUST00000117007 127 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Hoxd10P28359 Gm12417-201ENSMUST00000119153 403 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Hoxd10P28359 Gm11794-201ENSMUST00000119446 237 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Hoxd10P28359 Gm22814-201ENSMUST00000157452 104 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Hoxd10P28359 Gm21738-201ENSMUST00000177817 681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
Hoxd10P28359 Gm27793-201ENSMUST00000183405 76 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Hoxd10P28359 Gm27711-201ENSMUST00000183802 118 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Hoxd10P28359 Gm43220-201ENSMUST00000199299 282 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Hoxd10P28359 AC163033.1-201ENSMUST00000218608 157 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Hoxd10P28359 AC122367.2-201ENSMUST00000220987 534 ntTSL 2 BASIC1.57□□□□□ -2.16
Hoxd10P28359 AC154552.1-201ENSMUST00000222969 202 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Hoxd10P28359 AC102369.2-201ENSMUST00000219725 1679 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Hoxd10P28359 Olfr1431-202ENSMUST00000213759 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
Hoxd10P28359 Gm26624-201ENSMUST00000181486 3769 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
Hoxd10P28359 Olfr141-201ENSMUST00000216117 2935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
Hoxd10P28359 Gm24598-201ENSMUST00000122510 74 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Hoxd10P28359 Gm12434-201ENSMUST00000141580 653 ntTSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
Hoxd10P28359 Gm22215-201ENSMUST00000157558 96 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Hoxd10P28359 Gm25333-201ENSMUST00000158035 246 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Hoxd10P28359 Gm26029-201ENSMUST00000158659 132 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Hoxd10P28359 Gm16405-201ENSMUST00000169247 468 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
Hoxd10P28359 Gm7958-201ENSMUST00000178255 468 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Hoxd10P28359 Gm7950-201ENSMUST00000179633 468 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Hoxd10P28359 Gm29603-201ENSMUST00000186792 334 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Hoxd10P28359 Mir3961-201ENSMUST00000198795 59 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Hoxd10P28359 Mir196b-201ENSMUST00000083509 85 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Hoxd10P28359 Gm23845-201ENSMUST00000083834 152 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Hoxd10P28359 AC124456.1-201ENSMUST00000217391 2597 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Hoxd10P28359 AC160115.1-201ENSMUST00000224678 1574 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Hoxd10P28359 Olfr1151-202ENSMUST00000217376 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
Hoxd10P28359 Gm22221-201ENSMUST00000157362 103 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Hoxd10P28359 Gm22217-201ENSMUST00000157556 313 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Hoxd10P28359 Gm22537-201ENSMUST00000158172 199 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Hoxd10P28359 Mir5624-201ENSMUST00000176635 61 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Hoxd10P28359 Vmn2r-ps18-201ENSMUST00000177972 380 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83 ms