Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Gm23435-201ENSMUST00000157183 156 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
Ggta1P23336 Gm25750-201ENSMUST00000175483 112 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
Ggta1P23336 Gm28506-201ENSMUST00000189937 150 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
Ggta1P23336 Gm20144-201ENSMUST00000203031 165 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
Ggta1P23336 AC147101.1-201ENSMUST00000217964 312 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
Ggta1P23336 Stfa2l1-201ENSMUST00000079184 414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.58□□□□□ -2.32
Ggta1P23336 Gm22884-201ENSMUST00000083127 140 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
Ggta1P23336 Mir155-201ENSMUST00000083463 65 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
Ggta1P23336 Gm21750-201ENSMUST00000098874 1497 ntAPPRIS P1 BASIC0.58□□□□□ -2.32
Ggta1P23336 AC164297.1-201ENSMUST00000224484 1561 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
Ggta1P23336 Gm14296-202ENSMUST00000108931 750 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
Ggta1P23336 Mir1b-201ENSMUST00000117012 122 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
Ggta1P23336 Gm11410-201ENSMUST00000120053 1143 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
Ggta1P23336 Gm14269-201ENSMUST00000120455 306 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
Ggta1P23336 Gm14980-201ENSMUST00000121247 736 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
Ggta1P23336 Gm27926-201ENSMUST00000157180 66 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
Ggta1P23336 Gm26358-201ENSMUST00000158215 97 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
Ggta1P23336 2210418O10Rik-204ENSMUST00000166464 750 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
Ggta1P23336 Gm24618-201ENSMUST00000177718 94 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
Ggta1P23336 Gm10715-202ENSMUST00000177969 681 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC0.57□□□□□ -2.32
Ggta1P23336 Gm23953-201ENSMUST00000178214 94 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
Ggta1P23336 Gm26332-201ENSMUST00000179813 94 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
Ggta1P23336 Gm22863-201ENSMUST00000180265 94 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
Ggta1P23336 Gm23448-201ENSMUST00000083151 104 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
Ggta1P23336 Mir10b-201ENSMUST00000083566 68 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
Ggta1P23336 Sycp1-ps1-201ENSMUST00000207882 2768 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
Ggta1P23336 Snord98-201ENSMUST00000116819 65 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
Ggta1P23336 Gm16265-201ENSMUST00000134558 108 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
Ggta1P23336 Gm10721-201ENSMUST00000143083 669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.56□□□□□ -2.32
Ggta1P23336 Gm24799-201ENSMUST00000178431 79 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
Ggta1P23336 Gm28992-201ENSMUST00000190534 139 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
Ggta1P23336 Gm44325-201ENSMUST00000196757 77 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
Ggta1P23336 Gm43220-201ENSMUST00000199299 282 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
Ggta1P23336 Gm5001-201ENSMUST00000204361 331 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
Ggta1P23336 DQ267101-201ENSMUST00000082562 73 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
Ggta1P23336 Gm23515-201ENSMUST00000082829 107 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
Ggta1P23336 Gm10718-201ENSMUST00000099046 681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.56□□□□□ -2.32
Ggta1P23336 Gm15102-201ENSMUST00000118740 1502 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
Ggta1P23336 Gm15101-201ENSMUST00000178818 1502 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
Ggta1P23336 Gm25507-201ENSMUST00000116981 144 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
Ggta1P23336 Gm23991-201ENSMUST00000117033 93 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
Ggta1P23336 1700120G11Rik-201ENSMUST00000150273 491 ntTSL 1 (best) BASIC0.55□□□□□ -2.32
Ggta1P23336 Mir6985-201ENSMUST00000184641 61 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
Ggta1P23336 Rpl23a-ps9-201ENSMUST00000188369 463 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
Ggta1P23336 Rpl23a-ps11-201ENSMUST00000191583 463 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
Ggta1P23336 Gm44458-201ENSMUST00000196594 143 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
Ggta1P23336 Gm44960-201ENSMUST00000207403 141 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
Ggta1P23336 Gm18213-201ENSMUST00000207850 178 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
Ggta1P23336 AC144733.1-201ENSMUST00000222893 1289 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
Ggta1P23336 Gm24356-201ENSMUST00000082859 106 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
Ggta1P23336 Gm24523-201ENSMUST00000083965 132 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
Ggta1P23336 Gm23130-201ENSMUST00000104252 74 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
Ggta1P23336 Gm23203-201ENSMUST00000104374 107 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
Ggta1P23336 Gm11794-201ENSMUST00000119446 237 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
Ggta1P23336 Gm11248-201ENSMUST00000119568 201 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
Ggta1P23336 Gm14287-201ENSMUST00000121060 117 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
Ggta1P23336 Gm14766-201ENSMUST00000121689 367 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
Ggta1P23336 Gm22482-201ENSMUST00000122563 359 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
Ggta1P23336 Gm23212-201ENSMUST00000122718 60 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
Ggta1P23336 Gm16405-201ENSMUST00000169247 468 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC0.54□□□□□ -2.32
Ggta1P23336 Gm26236-201ENSMUST00000175536 137 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
Ggta1P23336 Gm16404-201ENSMUST00000177739 468 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
Ggta1P23336 Gm7958-201ENSMUST00000178255 468 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
Ggta1P23336 Gm7950-201ENSMUST00000179633 468 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
Ggta1P23336 Gm14598-201ENSMUST00000180109 468 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
Ggta1P23336 Gm14625-201ENSMUST00000180231 468 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
Ggta1P23336 Gm34015-201ENSMUST00000194908 451 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
Ggta1P23336 Gm44921-201ENSMUST00000205290 301 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
Ggta1P23336 Gm23542-201ENSMUST00000158208 96 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
Ggta1P23336 Mir3070a-201ENSMUST00000175468 89 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
Ggta1P23336 Gm44010-201ENSMUST00000204432 331 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
Ggta1P23336 Gm44734-201ENSMUST00000206025 237 ntTSL 5 BASIC0.53□□□□□ -2.32
Ggta1P23336 AC154636.2-201ENSMUST00000222538 161 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
Ggta1P23336 Gm24152-201ENSMUST00000082764 163 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
Ggta1P23336 Gm22704-201ENSMUST00000083027 137 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
Ggta1P23336 Snord33-201ENSMUST00000083694 84 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
Ggta1P23336 Gm22149-201ENSMUST00000104442 136 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
Ggta1P23336 Gm12433-201ENSMUST00000119659 255 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
Ggta1P23336 Mir6364-201ENSMUST00000183396 86 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
Ggta1P23336 Gm28408-201ENSMUST00000191557 463 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
Ggta1P23336 Olfr1035-ps1-202ENSMUST00000213364 288 ntTSL 5 BASIC0.52□□□□□ -2.33
Ggta1P23336 Gm40604-202ENSMUST00000219541 522 ntTSL 5 BASIC0.52□□□□□ -2.33
Ggta1P23336 AC155712.1-201ENSMUST00000219704 160 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
Ggta1P23336 Gm24355-201ENSMUST00000082858 122 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
Ggta1P23336 Mir133a-1-201ENSMUST00000083465 68 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
Ggta1P23336 Gm11859-201ENSMUST00000118099 455 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
Ggta1P23336 Gm26424-201ENSMUST00000122530 104 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
Ggta1P23336 Gm16358-201ENSMUST00000146046 210 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
Ggta1P23336 Gm17148-201ENSMUST00000164702 249 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
Ggta1P23336 Mir15a-201ENSMUST00000175266 84 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
Ggta1P23336 Gm26335-201ENSMUST00000178449 107 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
Ggta1P23336 Gm37128-201ENSMUST00000192599 232 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
Ggta1P23336 Gm36956-201ENSMUST00000193830 214 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
Ggta1P23336 Gm38060-201ENSMUST00000194822 464 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
Ggta1P23336 AC132918.1-201ENSMUST00000227877 925 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
Ggta1P23336 Mir19b-2-201ENSMUST00000083539 84 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
Ggta1P23336 Gm26500-201ENSMUST00000101867 106 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
Ggta1P23336 Gm29229-201ENSMUST00000188874 323 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
Ggta1P23336 AC157476.1-201ENSMUST00000215555 169 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
Ggta1P23336 AC147101.2-201ENSMUST00000219756 184 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.2 ms