Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Defb50-201ENSMUST00000078879 373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
Ccl20O89093 Gm25409-201ENSMUST00000083764 131 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Ccl20O89093 Zfp788-207ENSMUST00000170770 2499 ntTSL 1 (best) BASIC1.07□□□□□ -2.24
Ccl20O89093 Gm23010-201ENSMUST00000104151 126 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Ccl20O89093 Gm13967-201ENSMUST00000120404 380 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Ccl20O89093 Gm25318-201ENSMUST00000122554 314 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Ccl20O89093 Nell1os-202ENSMUST00000136672 491 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
Ccl20O89093 Gm17215-201ENSMUST00000170074 277 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
Ccl20O89093 Gm21905-201ENSMUST00000177616 87 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
Ccl20O89093 Gm28008-201ENSMUST00000184021 186 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Ccl20O89093 Gm28579-201ENSMUST00000186143 369 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Ccl20O89093 Gm34015-201ENSMUST00000194908 451 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Ccl20O89093 Gm44483-201ENSMUST00000197203 97 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Ccl20O89093 Gm25820-202ENSMUST00000197479 128 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Ccl20O89093 4930598N05Rik-207ENSMUST00000208997 83 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
Ccl20O89093 Gm45616-201ENSMUST00000211711 319 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Ccl20O89093 Gm29818-201ENSMUST00000218070 165 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Ccl20O89093 AC166341.3-201ENSMUST00000221861 114 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Ccl20O89093 AC126691.1-201ENSMUST00000226534 202 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Ccl20O89093 Mir211-201ENSMUST00000083651 106 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Ccl20O89093 Gm23845-201ENSMUST00000083834 152 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Ccl20O89093 Olfr188-ps1-201ENSMUST00000205766 4706 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
Ccl20O89093 Olfr821-203ENSMUST00000214177 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
Ccl20O89093 AC164629.4-201ENSMUST00000218505 3247 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Ccl20O89093 Gm14761-201ENSMUST00000121363 262 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Ccl20O89093 Gm23214-201ENSMUST00000122716 157 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Ccl20O89093 Gm22082-201ENSMUST00000157587 161 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Ccl20O89093 Gm22242-201ENSMUST00000175224 118 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Ccl20O89093 Mir5624-201ENSMUST00000176635 61 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Ccl20O89093 Mir7017-201ENSMUST00000184894 62 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Ccl20O89093 Gm27997-201ENSMUST00000184942 69 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Ccl20O89093 Gm29512-201ENSMUST00000185544 315 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Ccl20O89093 Gm28110-201ENSMUST00000185782 315 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Ccl20O89093 Gm29057-201ENSMUST00000186468 315 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Ccl20O89093 Gm29661-201ENSMUST00000186781 315 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Ccl20O89093 Gm28737-201ENSMUST00000186808 315 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Ccl20O89093 Gm29118-201ENSMUST00000186908 315 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Ccl20O89093 Gm28433-201ENSMUST00000187085 315 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Ccl20O89093 Gm28759-201ENSMUST00000187621 315 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Ccl20O89093 Gm28831-201ENSMUST00000187739 315 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Ccl20O89093 Gm28200-201ENSMUST00000187778 315 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Ccl20O89093 Gm28752-201ENSMUST00000188340 315 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Ccl20O89093 Gm29378-201ENSMUST00000188723 315 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Ccl20O89093 Gm28569-201ENSMUST00000188748 315 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Ccl20O89093 Gm28120-201ENSMUST00000188812 315 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Ccl20O89093 Gm28369-201ENSMUST00000188993 315 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Ccl20O89093 Gm28909-201ENSMUST00000189406 315 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Ccl20O89093 Gm28861-201ENSMUST00000189681 315 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Ccl20O89093 Gm29180-201ENSMUST00000190003 315 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Ccl20O89093 Gm29575-201ENSMUST00000190597 315 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Ccl20O89093 Gm29469-201ENSMUST00000191448 315 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Ccl20O89093 Gm44858-201ENSMUST00000207360 154 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Ccl20O89093 AC152414.2-201ENSMUST00000219620 537 ntTSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
Ccl20O89093 Sva-201ENSMUST00000024059 651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
Ccl20O89093 Gm22980-201ENSMUST00000082608 70 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Ccl20O89093 Gm24042-201ENSMUST00000083114 103 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Ccl20O89093 Mir155-201ENSMUST00000083463 65 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Ccl20O89093 Vmn1r73-202ENSMUST00000226516 6155 ntAPPRIS P1 BASIC1.05□□□□□ -2.24
Ccl20O89093 Mir223-201ENSMUST00000102112 110 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Ccl20O89093 Mir293-201ENSMUST00000104841 80 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Ccl20O89093 Gm24440-201ENSMUST00000157236 63 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Ccl20O89093 Gm25831-201ENSMUST00000158924 163 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Ccl20O89093 Gm2962-201ENSMUST00000159266 336 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Ccl20O89093 Gm17036-201ENSMUST00000168187 254 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
Ccl20O89093 Gm17919-201ENSMUST00000173344 312 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Ccl20O89093 Gm24512-201ENSMUST00000174963 65 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Ccl20O89093 Gm27517-201ENSMUST00000184347 236 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Ccl20O89093 Gm27421-201ENSMUST00000184729 167 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Ccl20O89093 Gm29603-201ENSMUST00000186792 334 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Ccl20O89093 Gm19855-201ENSMUST00000210145 249 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Ccl20O89093 Gm7240-201ENSMUST00000220769 664 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Ccl20O89093 AC115735.2-201ENSMUST00000227135 351 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Ccl20O89093 Gm10092-201ENSMUST00000077110 180 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Ccl20O89093 Gm24164-201ENSMUST00000093663 104 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Ccl20O89093 Gm10509-201ENSMUST00000097384 259 ntAPPRIS P1 BASIC1.05□□□□□ -2.24
Ccl20O89093 Olfr730-202ENSMUST00000205837 4903 ntAPPRIS ALT1 BASIC1.05□□□□□ -2.24
Ccl20O89093 8030445P17Rik-201ENSMUST00000192614 2741 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Ccl20O89093 Olfr307-203ENSMUST00000217494 4515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
Ccl20O89093 Olfr805-203ENSMUST00000216794 3199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
Ccl20O89093 Gm13339-201ENSMUST00000120651 510 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Ccl20O89093 Mup-ps22-201ENSMUST00000121611 243 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Ccl20O89093 Gm10722-201ENSMUST00000151376 651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
Ccl20O89093 Gm15327-202ENSMUST00000153958 467 ntTSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
Ccl20O89093 Gm24724-201ENSMUST00000158230 107 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Ccl20O89093 Gm24501-201ENSMUST00000158452 62 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Ccl20O89093 Gm28881-201ENSMUST00000187710 470 ntTSL 3 BASIC1.04□□□□□ -2.24
Ccl20O89093 Gm28434-201ENSMUST00000187738 500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
Ccl20O89093 Gm29665-201ENSMUST00000191457 528 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Ccl20O89093 Mir3535-201ENSMUST00000197651 147 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Ccl20O89093 Olfr1070-ps1-201ENSMUST00000215939 388 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Ccl20O89093 AC154636.2-201ENSMUST00000222538 161 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Ccl20O89093 AC173482.5-201ENSMUST00000224181 327 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Ccl20O89093 CT485608.2-201ENSMUST00000227210 291 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Ccl20O89093 Gm24966-201ENSMUST00000082443 79 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Ccl20O89093 Gm23039-201ENSMUST00000083870 161 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Ccl20O89093 4921511C20Rik-201ENSMUST00000051530 1606 ntAPPRIS P1 BASIC1.04□□□□□ -2.24
Ccl20O89093 Mir669d-2-201ENSMUST00000116854 86 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Ccl20O89093 Gm25541-201ENSMUST00000116888 126 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Ccl20O89093 Gm25509-201ENSMUST00000116985 106 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Ccl20O89093 Gm12512-201ENSMUST00000119620 217 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
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