Protein–RNA interactions for Protein: O35943

Fxn, Frataxin, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FxnO35943 Gm15190-201ENSMUST00000120855 276 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
FxnO35943 Gm23983-201ENSMUST00000157142 114 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
FxnO35943 Gm24717-201ENSMUST00000157522 124 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
FxnO35943 Mir1927-201ENSMUST00000158579 109 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
FxnO35943 Gm27934-201ENSMUST00000158795 63 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
FxnO35943 Gm20538-201ENSMUST00000166808 225 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
FxnO35943 Gm37081-201ENSMUST00000192034 196 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
FxnO35943 Gm44491-201ENSMUST00000196794 96 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
FxnO35943 Gm42785-201ENSMUST00000202316 3835 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
FxnO35943 Gm44555-201ENSMUST00000209008 148 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
FxnO35943 AC125350.4-201ENSMUST00000225895 273 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
FxnO35943 Gm22979-201ENSMUST00000082609 159 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
FxnO35943 Gm24461-201ENSMUST00000082735 103 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
FxnO35943 Gm24533-201ENSMUST00000083138 196 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
FxnO35943 Olfr652-203ENSMUST00000216131 4773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
FxnO35943 N4bp2l2-201ENSMUST00000118316 8982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
FxnO35943 Gm45844-205ENSMUST00000210333 3861 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
FxnO35943 Vmn1r13-203ENSMUST00000227298 5203 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
FxnO35943 Cox20-ps-201ENSMUST00000119872 353 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
FxnO35943 Gm12976-202ENSMUST00000153817 412 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
FxnO35943 Gm26277-201ENSMUST00000157097 152 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
FxnO35943 Rnu7-201ENSMUST00000158458 62 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
FxnO35943 Gm22946-201ENSMUST00000158558 82 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
FxnO35943 Gm20672-201ENSMUST00000176605 261 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
FxnO35943 Gm29452-201ENSMUST00000187996 313 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
FxnO35943 Gm35736-201ENSMUST00000203681 313 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
FxnO35943 Gm36776-201ENSMUST00000207006 203 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
FxnO35943 Gm45386-201ENSMUST00000210194 218 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
FxnO35943 Gm25815-201ENSMUST00000082755 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
FxnO35943 Olfr298-202ENSMUST00000213223 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
FxnO35943 AC153966.1-201ENSMUST00000220106 3764 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
FxnO35943 Gm25270-201ENSMUST00000122606 138 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
FxnO35943 Gm23168-201ENSMUST00000157156 143 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
FxnO35943 Gm26150-201ENSMUST00000157426 151 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
FxnO35943 Gm22535-201ENSMUST00000158174 119 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
FxnO35943 Gm25748-201ENSMUST00000175487 70 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
FxnO35943 Gm26061-201ENSMUST00000175584 108 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
FxnO35943 Gm22510-201ENSMUST00000179304 79 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
FxnO35943 Gm26336-201ENSMUST00000179449 79 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
FxnO35943 Gm26390-201ENSMUST00000179628 79 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
FxnO35943 Mir7658-201ENSMUST00000184043 57 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
FxnO35943 Gm27893-201ENSMUST00000184408 194 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
FxnO35943 Gm37377-201ENSMUST00000191733 304 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
FxnO35943 Gm19118-201ENSMUST00000222554 98 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
FxnO35943 mt-Ta-201ENSMUST00000082398 69 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
FxnO35943 Mir29c-201ENSMUST00000083614 88 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
FxnO35943 Ifi214-203ENSMUST00000139092 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
FxnO35943 Olfr1042-201ENSMUST00000099908 4119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
FxnO35943 Ccdc18-201ENSMUST00000047677 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
FxnO35943 AC104897.1-201ENSMUST00000222638 3628 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
FxnO35943 AC122828.3-201ENSMUST00000223019 3915 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
FxnO35943 Gm25828-201ENSMUST00000157087 95 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
FxnO35943 Gm23865-201ENSMUST00000157723 97 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
FxnO35943 Gm27991-201ENSMUST00000184804 137 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
FxnO35943 Gm37085-201ENSMUST00000193780 196 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
FxnO35943 Igkv5-40-1-201ENSMUST00000196457 359 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
FxnO35943 S100z-201ENSMUST00000022186 399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
FxnO35943 Snord61-201ENSMUST00000083176 71 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
FxnO35943 Olfr789-201ENSMUST00000213236 4235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
FxnO35943 Zfp735-201ENSMUST00000080407 3746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
FxnO35943 Gm22115-201ENSMUST00000103976 133 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
FxnO35943 Gm23923-201ENSMUST00000104108 133 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
FxnO35943 Gm24375-201ENSMUST00000104397 132 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
FxnO35943 Gm14567-201ENSMUST00000117155 174 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
FxnO35943 Gm2830-201ENSMUST00000140330 385 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
FxnO35943 Gm24010-201ENSMUST00000157731 282 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
FxnO35943 Gm25371-201ENSMUST00000158162 101 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
FxnO35943 Gm27672-201ENSMUST00000183751 204 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
FxnO35943 Gm29044-201ENSMUST00000188916 283 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
FxnO35943 Gm18665-201ENSMUST00000189783 270 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
FxnO35943 Gm44921-201ENSMUST00000205290 301 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
FxnO35943 Gm38407-201ENSMUST00000218017 474 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
FxnO35943 AC142499.1-201ENSMUST00000220036 374 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
FxnO35943 Gm3333-201ENSMUST00000221637 452 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
FxnO35943 AC124739.2-201ENSMUST00000222201 109 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
FxnO35943 CT025689.3-201ENSMUST00000223817 301 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
FxnO35943 Gm23297-201ENSMUST00000083184 127 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
FxnO35943 Gm23249-201ENSMUST00000083369 161 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
FxnO35943 Olfr898-203ENSMUST00000217063 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
FxnO35943 Muc16-204ENSMUST00000208663 25437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
FxnO35943 Vmn2r70-201ENSMUST00000168230 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
FxnO35943 Gm33962-201ENSMUST00000182643 2592 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
FxnO35943 Gm43540-201ENSMUST00000196320 3848 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
FxnO35943 Vmn2r65-201ENSMUST00000044583 2538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
FxnO35943 Gm43373-201ENSMUST00000202552 2870 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
FxnO35943 Olfr229-202ENSMUST00000214904 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
FxnO35943 AC152951.2-201ENSMUST00000218293 3587 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
FxnO35943 Gm26624-201ENSMUST00000181486 3769 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
FxnO35943 Gm22731-201ENSMUST00000158086 94 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
FxnO35943 Gm23090-201ENSMUST00000177331 78 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
FxnO35943 Gm26297-201ENSMUST00000179464 132 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
FxnO35943 Mir6350-201ENSMUST00000183639 105 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
FxnO35943 Gm29347-201ENSMUST00000186695 449 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
FxnO35943 Gm37796-201ENSMUST00000195327 134 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
FxnO35943 Gm44028-201ENSMUST00000205205 355 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
FxnO35943 Gm44976-201ENSMUST00000205543 261 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
FxnO35943 Gm24536-201ENSMUST00000083144 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
FxnO35943 Gpr174-203ENSMUST00000118820 5112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
FxnO35943 Zfy2-201ENSMUST00000115891 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
FxnO35943 Mir673-201ENSMUST00000102361 91 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.4 ms