Protein–RNA interactions for Protein: O35054

Cldn4, Claudin-4, mousemouse

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn4O35054 AC154552.7-201ENSMUST00000222824 156 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Cldn4O35054 CT033785.1-201ENSMUST00000224872 272 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Cldn4O35054 AC161250.2-201ENSMUST00000215114 3107 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Cldn4O35054 Gm23492-201ENSMUST00000116837 115 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Cldn4O35054 Gm14748-201ENSMUST00000119819 411 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Cldn4O35054 Gm6829-201ENSMUST00000119858 360 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Cldn4O35054 n-R5s150-201ENSMUST00000122705 108 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Cldn4O35054 Gm25113-201ENSMUST00000157185 143 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Cldn4O35054 Gm22083-201ENSMUST00000157586 102 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Cldn4O35054 Gm24053-201ENSMUST00000158620 105 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Cldn4O35054 Gm25488-201ENSMUST00000158728 118 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Cldn4O35054 Gm22259-201ENSMUST00000178926 107 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Cldn4O35054 Mir7679-201ENSMUST00000183379 63 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Cldn4O35054 Gm29406-201ENSMUST00000186400 235 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
Cldn4O35054 Gm24204-201ENSMUST00000082950 107 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Cldn4O35054 Gm25789-201ENSMUST00000083294 76 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Cldn4O35054 Snora69-201ENSMUST00000083708 131 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Cldn4O35054 Gm42664-201ENSMUST00000199417 3239 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Cldn4O35054 Gpr174-207ENSMUST00000178838 4955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
Cldn4O35054 Gm18795-201ENSMUST00000222371 3266 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
Cldn4O35054 Gm22193-201ENSMUST00000116868 76 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Cldn4O35054 Gm13885-201ENSMUST00000117569 187 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Cldn4O35054 Gm12143-201ENSMUST00000119666 332 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Cldn4O35054 Gm24896-201ENSMUST00000122741 135 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Cldn4O35054 Gm25888-201ENSMUST00000157778 302 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Cldn4O35054 Gm24006-201ENSMUST00000158462 132 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Cldn4O35054 Mir1936-201ENSMUST00000158699 93 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Cldn4O35054 Gm25933-201ENSMUST00000178943 108 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Cldn4O35054 Mir7016-201ENSMUST00000184308 72 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Cldn4O35054 Gm28076-201ENSMUST00000188337 410 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
Cldn4O35054 Gm43676-201ENSMUST00000197532 540 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Cldn4O35054 AC163289.1-201ENSMUST00000215919 262 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Cldn4O35054 AC166830.2-201ENSMUST00000225821 196 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Cldn4O35054 AC168062.3-201ENSMUST00000227025 165 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Cldn4O35054 Mir30d-201ENSMUST00000083503 82 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Cldn4O35054 Olfr389-203ENSMUST00000215418 3417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
Cldn4O35054 Zfp273-201ENSMUST00000012725 2277 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
Cldn4O35054 Traj39-201ENSMUST00000103703 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.99□□□□□ -2.09
Cldn4O35054 Traj37-201ENSMUST00000103705 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.99□□□□□ -2.09
Cldn4O35054 Gm25421-201ENSMUST00000104218 164 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Cldn4O35054 Gm23469-201ENSMUST00000157131 104 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Cldn4O35054 Gm25711-201ENSMUST00000158633 128 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Cldn4O35054 Gm24573-201ENSMUST00000175499 112 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Cldn4O35054 Gm29262-201ENSMUST00000190084 196 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Cldn4O35054 Gm38064-201ENSMUST00000194032 444 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
Cldn4O35054 Gm20005-201ENSMUST00000202583 299 ntTSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
Cldn4O35054 Olfr454-ps1-201ENSMUST00000205206 348 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Cldn4O35054 Gm45508-201ENSMUST00000209298 299 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Cldn4O35054 Gm11351-202ENSMUST00000225724 478 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Cldn4O35054 1700019M22Rik-201ENSMUST00000073560 354 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Cldn4O35054 Gm24977-201ENSMUST00000083106 163 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Cldn4O35054 Gm24164-201ENSMUST00000093663 104 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Cldn4O35054 Gm44114-201ENSMUST00000203270 2727 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Cldn4O35054 Olfr1442-203ENSMUST00000208494 3593 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
Cldn4O35054 Gm15303-201ENSMUST00000118676 2624 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Cldn4O35054 Trgj3-201ENSMUST00000103562 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.98□□□□□ -2.09
Cldn4O35054 Gm25938-201ENSMUST00000104139 166 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Cldn4O35054 Gm6897-201ENSMUST00000117714 138 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
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Cldn4O35054 Gm21060-201ENSMUST00000179346 168 ntAPPRIS P1 BASIC1.98□□□□□ -2.09
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Cldn4O35054 Gm32175-201ENSMUST00000193641 346 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
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Cldn4O35054 CT009696.2-201ENSMUST00000216668 432 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Cldn4O35054 Gm7214-201ENSMUST00000222428 272 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
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Cldn4O35054 Gm10203-201ENSMUST00000087348 198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
Cldn4O35054 Zfp735-201ENSMUST00000080407 3746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
Cldn4O35054 Olfr229-202ENSMUST00000214904 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
Cldn4O35054 Mir767-201ENSMUST00000103256 107 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Cldn4O35054 Gm12512-201ENSMUST00000119620 217 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Cldn4O35054 Gm12721-201ENSMUST00000120621 268 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
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Cldn4O35054 Gm23536-201ENSMUST00000157541 134 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Cldn4O35054 Gm23864-201ENSMUST00000177607 107 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Cldn4O35054 Gm29604-201ENSMUST00000187176 163 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Cldn4O35054 Gm22972-201ENSMUST00000083297 131 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Cldn4O35054 Mir340-201ENSMUST00000083483 98 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Cldn4O35054 Mir93-201ENSMUST00000083593 88 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Cldn4O35054 Gm10719-202ENSMUST00000099049 675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
Cldn4O35054 Vmn1r178-202ENSMUST00000226450 2880 ntAPPRIS P1 BASIC1.96□□□□□ -2.09
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Cldn4O35054 Gm22494-201ENSMUST00000104495 128 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Cldn4O35054 Gm24594-201ENSMUST00000122502 99 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Cldn4O35054 Gm11192-201ENSMUST00000127017 151 ntTSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
Cldn4O35054 Gm22281-201ENSMUST00000157198 103 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Cldn4O35054 Gm28020-201ENSMUST00000157739 67 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Cldn4O35054 Gm22551-201ENSMUST00000157795 103 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Cldn4O35054 Gm22097-201ENSMUST00000157929 278 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Cldn4O35054 Snord50b-201ENSMUST00000178497 72 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Cldn4O35054 Gm26864-201ENSMUST00000181346 156 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Cldn4O35054 Mir6352-201ENSMUST00000184495 116 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Cldn4O35054 Gm27979-201ENSMUST00000185126 56 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
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