Protein–RNA interactions for Protein: E9Q414

Apob, Apolipoprotein B-100, mousemouse

Predictions only

Length 4,505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobE9Q414 Mir7651-201ENSMUST00000184154 64 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
ApobE9Q414 Gm43140-201ENSMUST00000197317 456 ntTSL 2 BASIC-0.81□□□□□ -2.54
ApobE9Q414 Gm13729-201ENSMUST00000120328 406 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
ApobE9Q414 Gm24910-201ENSMUST00000157289 272 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
ApobE9Q414 AC154257.2-201ENSMUST00000224166 340 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
ApobE9Q414 Gm14887-201ENSMUST00000119522 663 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
ApobE9Q414 Gm15266-201ENSMUST00000119635 255 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
ApobE9Q414 Vmn2r-ps18-201ENSMUST00000177972 380 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
ApobE9Q414 Vmn2r-ps17-201ENSMUST00000178733 375 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
ApobE9Q414 Gm28196-201ENSMUST00000187719 640 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
ApobE9Q414 7330423F06Rik-201ENSMUST00000197499 301 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
ApobE9Q414 Gm39473-201ENSMUST00000223498 522 ntTSL 3 BASIC-0.82□□□□□ -2.54
ApobE9Q414 Gm26043-201ENSMUST00000116912 91 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
ApobE9Q414 Gm22678-201ENSMUST00000116974 101 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
ApobE9Q414 Gm25783-201ENSMUST00000122525 190 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
ApobE9Q414 Gm43367-201ENSMUST00000199986 625 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
ApobE9Q414 Gm22063-201ENSMUST00000082560 107 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
ApobE9Q414 Snord69-201ENSMUST00000104024 80 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
ApobE9Q414 Gm20405-201ENSMUST00000174002 229 ntTSL 5 BASIC-0.83□□□□□ -2.54
ApobE9Q414 Gm24308-201ENSMUST00000177773 114 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
ApobE9Q414 Gm12102-201ENSMUST00000118251 604 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
ApobE9Q414 Gm12591-201ENSMUST00000122407 1177 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
ApobE9Q414 Gm25323-201ENSMUST00000122555 103 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
ApobE9Q414 Gm23090-201ENSMUST00000177331 78 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
ApobE9Q414 Gm29216-201ENSMUST00000187117 492 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
ApobE9Q414 Gm34662-201ENSMUST00000220502 215 ntTSL 3 BASIC-0.83□□□□□ -2.54
ApobE9Q414 Gm2020-201ENSMUST00000145242 579 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
ApobE9Q414 Mir1933-201ENSMUST00000158930 88 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
ApobE9Q414 Gm20415-201ENSMUST00000172877 423 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
ApobE9Q414 Gm44085-201ENSMUST00000205056 372 ntTSL 3 BASIC-0.83□□□□□ -2.54
ApobE9Q414 Gm6293-201ENSMUST00000050339 195 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
ApobE9Q414 Mir18b-201ENSMUST00000103923 83 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
ApobE9Q414 Gm26233-201ENSMUST00000175530 70 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
ApobE9Q414 Gm37750-201ENSMUST00000193563 129 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
ApobE9Q414 Gm46367-202ENSMUST00000222771 501 ntTSL 5 BASIC-0.84□□□□□ -2.54
ApobE9Q414 Mir6339-201ENSMUST00000185120 117 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
ApobE9Q414 Gm44429-201ENSMUST00000203542 186 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
ApobE9Q414 AC151902.1-201ENSMUST00000227800 375 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
ApobE9Q414 Gm23442-201ENSMUST00000082919 134 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
ApobE9Q414 Gm26195-201ENSMUST00000175035 101 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
ApobE9Q414 Stfa2-201ENSMUST00000023619 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.84□□□□□ -2.54
ApobE9Q414 Gm22031-201ENSMUST00000116945 126 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.54
ApobE9Q414 Mir1931-201ENSMUST00000158589 119 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.54
ApobE9Q414 Gm26501-201ENSMUST00000178307 107 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.54
ApobE9Q414 Gm24565-201ENSMUST00000180099 107 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.54
ApobE9Q414 Gm19885-201ENSMUST00000212853 343 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.54
ApobE9Q414 Gm24460-201ENSMUST00000082731 106 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.54
ApobE9Q414 Gm26125-201ENSMUST00000083357 107 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.54
ApobE9Q414 Gm23103-201ENSMUST00000083725 107 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.54
ApobE9Q414 Gm14600-201ENSMUST00000121032 630 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
ApobE9Q414 Gm11575-201ENSMUST00000122243 228 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
ApobE9Q414 Gm22972-201ENSMUST00000083297 131 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
ApobE9Q414 Mir29b-2-201ENSMUST00000083478 81 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
ApobE9Q414 Gm24060-201ENSMUST00000157494 95 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
ApobE9Q414 Mir344-2-201ENSMUST00000175446 80 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
ApobE9Q414 Gm28838-201ENSMUST00000186338 315 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
ApobE9Q414 Gm29635-201ENSMUST00000187221 315 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
ApobE9Q414 Gm29026-201ENSMUST00000187787 315 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
ApobE9Q414 Gm28797-201ENSMUST00000188543 315 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
ApobE9Q414 Gm28855-201ENSMUST00000188680 315 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
ApobE9Q414 Gm28705-201ENSMUST00000189548 315 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
ApobE9Q414 Gm28939-201ENSMUST00000190351 315 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
ApobE9Q414 Gm28223-201ENSMUST00000190469 315 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
ApobE9Q414 Gm29092-201ENSMUST00000190768 315 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
ApobE9Q414 1700014F14Rik-201ENSMUST00000199566 197 ntTSL 1 (best) BASIC-0.85□□□□□ -2.55
ApobE9Q414 CT030684.2-201ENSMUST00000228946 826 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
ApobE9Q414 Gm11254-201ENSMUST00000122368 653 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
ApobE9Q414 Gm22887-201ENSMUST00000178586 107 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
ApobE9Q414 AC122905.2-201ENSMUST00000220325 269 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
ApobE9Q414 Gm15654-201ENSMUST00000152660 300 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
ApobE9Q414 Gm28648-201ENSMUST00000190092 343 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
ApobE9Q414 Sult1c2-ps2-201ENSMUST00000196414 276 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
ApobE9Q414 Gm36189-201ENSMUST00000204113 523 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
ApobE9Q414 Stfa3-201ENSMUST00000068182 412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.86□□□□□ -2.55
ApobE9Q414 Olfr1094-202ENSMUST00000217509 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.86□□□□□ -2.55
ApobE9Q414 Gm10772-201ENSMUST00000167981 255 ntAPPRIS P1 BASIC-0.86□□□□□ -2.55
ApobE9Q414 Mir7015-201ENSMUST00000199525 64 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
ApobE9Q414 Gm43124-201ENSMUST00000201878 278 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
ApobE9Q414 AC159297.2-201ENSMUST00000219567 1075 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
ApobE9Q414 AC115735.2-201ENSMUST00000227135 351 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
ApobE9Q414 Gm14412-201ENSMUST00000108959 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.86□□□□□ -2.55
ApobE9Q414 Gm14766-201ENSMUST00000121689 367 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
ApobE9Q414 Gm24726-201ENSMUST00000158232 121 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
ApobE9Q414 AC153522.1-201ENSMUST00000220047 1090 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
ApobE9Q414 Gm24163-201ENSMUST00000093660 132 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
ApobE9Q414 Gm25756-201ENSMUST00000103990 136 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
ApobE9Q414 1700124M09Rik-201ENSMUST00000217047 305 ntTSL 1 (best) BASIC-0.87□□□□□ -2.55
ApobE9Q414 Gm26062-201ENSMUST00000083379 107 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
ApobE9Q414 Gm23206-201ENSMUST00000122720 184 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
ApobE9Q414 Gm22200-201ENSMUST00000158614 67 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
ApobE9Q414 AC164612.2-202ENSMUST00000216314 253 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
ApobE9Q414 Gm22747-201ENSMUST00000082495 107 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
ApobE9Q414 Gm24884-201ENSMUST00000158784 119 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
ApobE9Q414 Gm26359-201ENSMUST00000158873 101 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
ApobE9Q414 Gm24168-201ENSMUST00000178825 107 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
ApobE9Q414 Gm45738-201ENSMUST00000203645 233 ntTSL 5 BASIC-0.87□□□□□ -2.55
ApobE9Q414 AC153512.4-201ENSMUST00000217783 426 ntTSL 3 BASIC-0.87□□□□□ -2.55
ApobE9Q414 mt-Nd2-201ENSMUST00000082396 1038 ntAPPRIS P1 BASIC-0.87□□□□□ -2.55
ApobE9Q414 Gm15878-201ENSMUST00000127561 306 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
ApobE9Q414 AC122335.1-201ENSMUST00000217587 175 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.2 ms