Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1U1

Ccdc171, Coiled-coil domain-containing protein 171, mousemouse

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Length 1,324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc171E9Q1U1 Esp24-201ENSMUST00000180245 207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.57□□□□□ -2.32
Ccdc171E9Q1U1 Gm38361-201ENSMUST00000193419 458 ntTSL 5 BASIC0.57□□□□□ -2.32
Ccdc171E9Q1U1 Gm36956-201ENSMUST00000193830 214 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
Ccdc171E9Q1U1 Gm5034-201ENSMUST00000199115 634 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
Ccdc171E9Q1U1 AC147101.2-201ENSMUST00000219756 184 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
Ccdc171E9Q1U1 Gm45815-201ENSMUST00000220241 146 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
Ccdc171E9Q1U1 Mir19b-2-201ENSMUST00000083539 84 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
Ccdc171E9Q1U1 Gm24523-201ENSMUST00000083965 132 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
Ccdc171E9Q1U1 Gm10477-201ENSMUST00000101552 165 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.56□□□□□ -2.32
Ccdc171E9Q1U1 Gm12255-201ENSMUST00000117184 284 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
Ccdc171E9Q1U1 Gm11410-201ENSMUST00000120053 1143 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
Ccdc171E9Q1U1 Gm24241-201ENSMUST00000157787 145 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
Ccdc171E9Q1U1 Gm24085-201ENSMUST00000175172 116 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
Ccdc171E9Q1U1 Gm17067-202ENSMUST00000180131 123 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
Ccdc171E9Q1U1 Gm26200-201ENSMUST00000180273 79 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
Ccdc171E9Q1U1 Gm43432-201ENSMUST00000196352 121 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
Ccdc171E9Q1U1 Gm44734-201ENSMUST00000206025 237 ntTSL 5 BASIC0.56□□□□□ -2.32
Ccdc171E9Q1U1 Gm45403-201ENSMUST00000209453 276 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
Ccdc171E9Q1U1 1700024I08Rik-202ENSMUST00000222074 407 ntTSL 5 BASIC0.56□□□□□ -2.32
Ccdc171E9Q1U1 Stfa2l1-201ENSMUST00000079184 414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.56□□□□□ -2.32
Ccdc171E9Q1U1 Gm24966-201ENSMUST00000082443 79 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
Ccdc171E9Q1U1 Gm25789-201ENSMUST00000083294 76 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
Ccdc171E9Q1U1 Mir155-201ENSMUST00000083463 65 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
Ccdc171E9Q1U1 Gm22834-201ENSMUST00000102021 79 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
Ccdc171E9Q1U1 Mir1b-201ENSMUST00000117012 122 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
Ccdc171E9Q1U1 Gm11248-201ENSMUST00000119568 201 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
Ccdc171E9Q1U1 Gm14980-201ENSMUST00000121247 736 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
Ccdc171E9Q1U1 Gm13577-201ENSMUST00000121365 205 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
Ccdc171E9Q1U1 Mir15a-201ENSMUST00000175266 84 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
Ccdc171E9Q1U1 Gm28343-201ENSMUST00000185386 112 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
Ccdc171E9Q1U1 Gm44325-201ENSMUST00000196757 77 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
Ccdc171E9Q1U1 Gm43220-201ENSMUST00000199299 282 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
Ccdc171E9Q1U1 mt-Tm-201ENSMUST00000082395 69 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
Ccdc171E9Q1U1 Gm24152-201ENSMUST00000082764 163 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
Ccdc171E9Q1U1 Gm25207-201ENSMUST00000093745 107 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
Ccdc171E9Q1U1 Gm11794-201ENSMUST00000119446 237 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
Ccdc171E9Q1U1 Gm22818-201ENSMUST00000157446 104 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
Ccdc171E9Q1U1 Gm23672-201ENSMUST00000157471 107 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
Ccdc171E9Q1U1 Gm24901-201ENSMUST00000158125 110 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
Ccdc171E9Q1U1 4930579O11Rik-202ENSMUST00000168243 672 ntTSL 3 BASIC0.54□□□□□ -2.32
Ccdc171E9Q1U1 Gm24308-201ENSMUST00000177773 114 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
Ccdc171E9Q1U1 Gm22166-201ENSMUST00000178419 121 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
Ccdc171E9Q1U1 Gm23288-201ENSMUST00000179213 121 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
Ccdc171E9Q1U1 Gm36953-201ENSMUST00000195295 268 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
Ccdc171E9Q1U1 Gm20144-201ENSMUST00000203031 165 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
Ccdc171E9Q1U1 Gm44921-201ENSMUST00000205290 301 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
Ccdc171E9Q1U1 AC134334.1-201ENSMUST00000214277 255 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
Ccdc171E9Q1U1 Zfp654-201ENSMUST00000052588 4741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.53□□□□□ -2.32
Ccdc171E9Q1U1 Gm22149-201ENSMUST00000104442 136 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
Ccdc171E9Q1U1 Gm13059-201ENSMUST00000119881 398 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
Ccdc171E9Q1U1 Gm15719-201ENSMUST00000120619 635 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
Ccdc171E9Q1U1 Gm23542-201ENSMUST00000158208 96 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
Ccdc171E9Q1U1 Gm25486-201ENSMUST00000158726 63 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
Ccdc171E9Q1U1 Gm28992-201ENSMUST00000190534 139 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
Ccdc171E9Q1U1 Gm44976-201ENSMUST00000205543 261 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
Ccdc171E9Q1U1 Gm40604-202ENSMUST00000219541 522 ntTSL 5 BASIC0.53□□□□□ -2.32
Ccdc171E9Q1U1 Gm22704-201ENSMUST00000083027 137 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
Ccdc171E9Q1U1 Mir344-201ENSMUST00000083634 95 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
Ccdc171E9Q1U1 Gm23991-201ENSMUST00000117033 93 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
Ccdc171E9Q1U1 Gm11859-201ENSMUST00000118099 455 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
Ccdc171E9Q1U1 Gm22796-201ENSMUST00000157234 106 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
Ccdc171E9Q1U1 Olfr1478-ps1-201ENSMUST00000208393 391 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
Ccdc171E9Q1U1 Olfr865-ps1-201ENSMUST00000212071 85 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
Ccdc171E9Q1U1 Gm25586-201ENSMUST00000082499 112 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
Ccdc171E9Q1U1 Gm12433-201ENSMUST00000119659 255 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
Ccdc171E9Q1U1 Gm22522-201ENSMUST00000158271 151 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
Ccdc171E9Q1U1 Gm24678-201ENSMUST00000158756 104 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
Ccdc171E9Q1U1 Gm25163-201ENSMUST00000158905 104 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
Ccdc171E9Q1U1 Gm16577-201ENSMUST00000161579 471 ntTSL 3 BASIC0.51□□□□□ -2.33
Ccdc171E9Q1U1 Gm24618-201ENSMUST00000177718 94 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
Ccdc171E9Q1U1 Gm23953-201ENSMUST00000178214 94 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
Ccdc171E9Q1U1 Gm26332-201ENSMUST00000179813 94 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
Ccdc171E9Q1U1 Gm22863-201ENSMUST00000180265 94 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
Ccdc171E9Q1U1 Mir8116-201ENSMUST00000184134 97 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
Ccdc171E9Q1U1 Gm27226-201ENSMUST00000184676 511 ntTSL 2 BASIC0.51□□□□□ -2.33
Ccdc171E9Q1U1 Gm28435-201ENSMUST00000185496 108 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
Ccdc171E9Q1U1 Gm18296-201ENSMUST00000192475 783 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
Ccdc171E9Q1U1 Gm44960-201ENSMUST00000207403 141 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
Ccdc171E9Q1U1 AC154636.2-201ENSMUST00000222538 161 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
Ccdc171E9Q1U1 Gm15102-201ENSMUST00000118740 1502 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
Ccdc171E9Q1U1 Gm15101-201ENSMUST00000178818 1502 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
Ccdc171E9Q1U1 Gm14846-201ENSMUST00000121868 216 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
Ccdc171E9Q1U1 n-R5s70-201ENSMUST00000122650 116 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
Ccdc171E9Q1U1 Gm27926-201ENSMUST00000157180 66 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
Ccdc171E9Q1U1 Gm24962-201ENSMUST00000157917 109 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
Ccdc171E9Q1U1 Gm18588-201ENSMUST00000177308 492 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
Ccdc171E9Q1U1 Gm24799-201ENSMUST00000178431 79 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
Ccdc171E9Q1U1 Gm29229-201ENSMUST00000188874 323 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
Ccdc171E9Q1U1 AC147101.1-201ENSMUST00000217964 312 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
Ccdc171E9Q1U1 Gm5581-201ENSMUST00000072940 2550 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
Ccdc171E9Q1U1 Gm25378-201ENSMUST00000104333 129 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
Ccdc171E9Q1U1 Gm12584-201ENSMUST00000117109 1105 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
Ccdc171E9Q1U1 Gm28921-201ENSMUST00000190219 378 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
Ccdc171E9Q1U1 Sprr2c-ps-201ENSMUST00000195581 301 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
Ccdc171E9Q1U1 Trbv17-201ENSMUST00000103275 374 ntAPPRIS P1 BASIC0.48□□□□□ -2.33
Ccdc171E9Q1U1 Gm24342-201ENSMUST00000103907 104 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Ccdc171E9Q1U1 Gm14568-201ENSMUST00000119321 294 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Ccdc171E9Q1U1 Gm14269-201ENSMUST00000120455 306 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Ccdc171E9Q1U1 Gm28408-201ENSMUST00000191557 463 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Ccdc171E9Q1U1 AC157476.1-201ENSMUST00000215555 169 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
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