Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Snhg14-209ENSMUST00000188976 2193 ntTSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
Grik3B1AS29 Agmo-201ENSMUST00000049874 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
Grik3B1AS29 Gm26135-201ENSMUST00000101993 72 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Grik3B1AS29 Mir466b-8-201ENSMUST00000103883 86 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Grik3B1AS29 Gm23492-201ENSMUST00000116837 115 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Grik3B1AS29 Gm22731-201ENSMUST00000158086 94 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Grik3B1AS29 Gm17052-201ENSMUST00000165496 289 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Grik3B1AS29 Snord50b-201ENSMUST00000178497 72 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Grik3B1AS29 Gm26435-201ENSMUST00000179026 107 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Grik3B1AS29 Gm21060-201ENSMUST00000179346 168 ntAPPRIS P1 BASIC2.04□□□□□ -2.08
Grik3B1AS29 Gm24390-201ENSMUST00000179578 62 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Grik3B1AS29 Gm27545-201ENSMUST00000184755 202 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Grik3B1AS29 Mir7678-201ENSMUST00000185076 71 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Grik3B1AS29 Mir466e-201ENSMUST00000198862 84 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Grik3B1AS29 Gm44408-201ENSMUST00000200205 66 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Grik3B1AS29 Mir466c-1-201ENSMUST00000200654 84 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Grik3B1AS29 Gm45365-201ENSMUST00000209489 256 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Grik3B1AS29 AC164086.1-201ENSMUST00000221038 289 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Grik3B1AS29 CT030687.1-201ENSMUST00000221854 162 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Grik3B1AS29 Gm6020-201ENSMUST00000092094 66 ntAPPRIS P1 BASIC2.04□□□□□ -2.08
Grik3B1AS29 Gm18795-201ENSMUST00000222371 3266 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
Grik3B1AS29 Traj39-201ENSMUST00000103703 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.03□□□□□ -2.08
Grik3B1AS29 Gm14748-201ENSMUST00000119819 411 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Grik3B1AS29 Gm14922-201ENSMUST00000121131 163 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Grik3B1AS29 n-R5s150-201ENSMUST00000122705 108 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Grik3B1AS29 Gm25113-201ENSMUST00000157185 143 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Grik3B1AS29 Gm26150-201ENSMUST00000157426 151 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Grik3B1AS29 Gm22338-201ENSMUST00000157715 129 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Grik3B1AS29 Gm24510-201ENSMUST00000174965 94 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Grik3B1AS29 Gm25615-201ENSMUST00000177836 94 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Grik3B1AS29 4930598A11Rik-201ENSMUST00000180742 628 ntTSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
Grik3B1AS29 Mir7225-201ENSMUST00000184178 54 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Grik3B1AS29 Mir3961-201ENSMUST00000198795 59 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Grik3B1AS29 AC165157.3-201ENSMUST00000220815 103 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Grik3B1AS29 Rny1-201ENSMUST00000083767 112 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Grik3B1AS29 Olfr1253-203ENSMUST00000215185 4984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
Grik3B1AS29 Zfp980-202ENSMUST00000180014 1938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
Grik3B1AS29 Olfr1208-202ENSMUST00000214121 2823 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.09
Grik3B1AS29 AC122828.3-201ENSMUST00000223019 3915 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Grik3B1AS29 n-R5s158-201ENSMUST00000104095 118 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Grik3B1AS29 Gm14846-201ENSMUST00000121868 216 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Grik3B1AS29 Gm25184-201ENSMUST00000157753 163 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Grik3B1AS29 Gm26024-201ENSMUST00000158657 322 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Grik3B1AS29 Gm22450-201ENSMUST00000179641 107 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Grik3B1AS29 Gm25473-201ENSMUST00000180191 107 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Grik3B1AS29 Gm44578-201ENSMUST00000207236 3835 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Grik3B1AS29 Gm7214-201ENSMUST00000222428 272 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Grik3B1AS29 AC239878.2-201ENSMUST00000224048 464 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Grik3B1AS29 Gm25636-201ENSMUST00000082666 133 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Grik3B1AS29 Gm24856-201ENSMUST00000082809 107 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Grik3B1AS29 Gm26493-201ENSMUST00000083155 136 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Grik3B1AS29 Gm26071-201ENSMUST00000083261 107 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Grik3B1AS29 Mir93-201ENSMUST00000083593 88 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Grik3B1AS29 Gm23039-201ENSMUST00000083870 161 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Grik3B1AS29 Gm24521-201ENSMUST00000083958 107 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Grik3B1AS29 mt-Nd5-201ENSMUST00000082418 1824 ntAPPRIS P1 BASIC2.02□□□□□ -2.09
Grik3B1AS29 Zfp966-201ENSMUST00000108949 2939 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
Grik3B1AS29 2210417A02Rik-201ENSMUST00000150265 550 ntTSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
Grik3B1AS29 Gm24394-201ENSMUST00000158141 123 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Grik3B1AS29 Gm17161-201ENSMUST00000169187 524 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Grik3B1AS29 Gm25024-201ENSMUST00000179667 104 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Grik3B1AS29 Gm27511-201ENSMUST00000183502 127 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Grik3B1AS29 Mir6352-201ENSMUST00000184495 116 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Grik3B1AS29 Gm27979-201ENSMUST00000185126 56 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Grik3B1AS29 Gm42672-201ENSMUST00000197821 352 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Grik3B1AS29 Olfr515-ps1-201ENSMUST00000208389 189 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Grik3B1AS29 Gm3333-201ENSMUST00000221637 452 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
Grik3B1AS29 Gm24536-201ENSMUST00000083144 107 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Grik3B1AS29 Gm23219-201ENSMUST00000158123 87 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Grik3B1AS29 Gm24392-201ENSMUST00000158136 103 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Grik3B1AS29 Gm24667-201ENSMUST00000158938 103 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Grik3B1AS29 Gm26157-201ENSMUST00000158974 126 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Grik3B1AS29 Mir9-3-201ENSMUST00000175497 90 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Grik3B1AS29 Gm23289-201ENSMUST00000175615 108 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Grik3B1AS29 Mir7679-201ENSMUST00000183379 63 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Grik3B1AS29 Ranbp2-ps7-201ENSMUST00000183924 384 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Grik3B1AS29 Mir7021-201ENSMUST00000197026 63 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Grik3B1AS29 Gm43427-201ENSMUST00000198188 331 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Grik3B1AS29 Olfr454-ps1-201ENSMUST00000205206 348 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Grik3B1AS29 Gm24165-201ENSMUST00000082718 128 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Grik3B1AS29 Gm22683-201ENSMUST00000082854 137 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Grik3B1AS29 Mir181b-2-201ENSMUST00000083644 89 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Grik3B1AS29 AC124456.1-201ENSMUST00000217391 2597 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Grik3B1AS29 Gm25938-201ENSMUST00000104139 166 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Grik3B1AS29 Snord70-201ENSMUST00000104157 87 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Grik3B1AS29 Gm24283-201ENSMUST00000104233 107 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Grik3B1AS29 Gm15067-201ENSMUST00000119534 156 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Grik3B1AS29 n-R5s15-201ENSMUST00000122635 111 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Grik3B1AS29 U6.1-201ENSMUST00000157443 101 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Grik3B1AS29 Gm25664-201ENSMUST00000157697 107 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Grik3B1AS29 Gm25491-201ENSMUST00000158733 308 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Grik3B1AS29 Gm44491-201ENSMUST00000196794 96 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Grik3B1AS29 AC122428.1-201ENSMUST00000213709 217 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
Grik3B1AS29 Olfr6-204ENSMUST00000219365 951 ntAPPRIS P1 BASIC1.99□□□□□ -2.09
Grik3B1AS29 Gm25788-201ENSMUST00000082721 131 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Grik3B1AS29 Mir300-201ENSMUST00000083485 79 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Grik3B1AS29 Olfr1225-203ENSMUST00000217054 5517 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
Grik3B1AS29 Gm22784-201ENSMUST00000104088 132 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Grik3B1AS29 Gm14491-201ENSMUST00000121919 199 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Grik3B1AS29 Gm25235-201ENSMUST00000179933 107 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
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