Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Olfr498-201ENSMUST00000217616 2260 ntAPPRIS P1 BASIC3.72□□□□□ -1.81
Chmp3Q9CQ10 Olfr1044-202ENSMUST00000215171 3266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
Chmp3Q9CQ10 Gm12513-201ENSMUST00000118617 352 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
Chmp3Q9CQ10 Gm12213-201ENSMUST00000119924 353 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
Chmp3Q9CQ10 Gm23380-201ENSMUST00000158448 103 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
Chmp3Q9CQ10 Gm20438-201ENSMUST00000174441 329 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
Chmp3Q9CQ10 Gm38364-201ENSMUST00000191814 179 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
Chmp3Q9CQ10 Gm43602-201ENSMUST00000196772 300 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
Chmp3Q9CQ10 Gm43239-201ENSMUST00000200131 201 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
Chmp3Q9CQ10 AC153512.4-201ENSMUST00000217783 426 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
Chmp3Q9CQ10 Gm25797-201ENSMUST00000082640 107 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
Chmp3Q9CQ10 Olfr609-202ENSMUST00000216075 3429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
Chmp3Q9CQ10 Gm14387-201ENSMUST00000121827 2055 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
Chmp3Q9CQ10 Olfr1097-201ENSMUST00000111576 4705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
Chmp3Q9CQ10 Olfr1107-202ENSMUST00000214049 4388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
Chmp3Q9CQ10 n-R5s158-201ENSMUST00000104095 118 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Chmp3Q9CQ10 Gm25376-201ENSMUST00000104340 133 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Chmp3Q9CQ10 Gm26011-201ENSMUST00000104410 104 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Chmp3Q9CQ10 Gm15067-201ENSMUST00000119534 156 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Chmp3Q9CQ10 Gm23858-201ENSMUST00000158384 106 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Chmp3Q9CQ10 Gm22946-201ENSMUST00000158558 82 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Chmp3Q9CQ10 Gm24634-201ENSMUST00000158672 107 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Chmp3Q9CQ10 Mir3106-201ENSMUST00000175401 82 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Chmp3Q9CQ10 Ttn-225ENSMUST00000190813 300 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
Chmp3Q9CQ10 Gm37428-201ENSMUST00000193886 137 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Chmp3Q9CQ10 Gm24350-202ENSMUST00000198309 132 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Chmp3Q9CQ10 Gm44482-201ENSMUST00000199232 103 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Chmp3Q9CQ10 Gm38997-201ENSMUST00000205669 304 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
Chmp3Q9CQ10 Gm44666-201ENSMUST00000208544 391 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Chmp3Q9CQ10 AC149294.9-201ENSMUST00000227256 164 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Chmp3Q9CQ10 AC130477.2-201ENSMUST00000228158 274 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Chmp3Q9CQ10 mt-Ta-201ENSMUST00000082398 69 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Chmp3Q9CQ10 Snord61-201ENSMUST00000083176 71 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Chmp3Q9CQ10 Mirlet7f-2-201ENSMUST00000083668 83 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Chmp3Q9CQ10 Olfr1447-203ENSMUST00000216989 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
Chmp3Q9CQ10 Scai-201ENSMUST00000038874 10709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
Chmp3Q9CQ10 Gm43268-201ENSMUST00000201536 4055 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Chmp3Q9CQ10 Zfp934-202ENSMUST00000101547 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
Chmp3Q9CQ10 Gm23015-201ENSMUST00000104145 128 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
Chmp3Q9CQ10 mt-Tt-201ENSMUST00000082422 67 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
Chmp3Q9CQ10 Gm23445-201ENSMUST00000082800 107 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
Chmp3Q9CQ10 Fam111a-203ENSMUST00000144662 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
Chmp3Q9CQ10 Gm37566-201ENSMUST00000192363 4355 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
Chmp3Q9CQ10 Zfp987-201ENSMUST00000091878 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
Chmp3Q9CQ10 Gm3848-202ENSMUST00000151564 301 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
Chmp3Q9CQ10 Gm23434-201ENSMUST00000157179 100 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
Chmp3Q9CQ10 Gm22221-201ENSMUST00000157362 103 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
Chmp3Q9CQ10 Gm24390-201ENSMUST00000179578 62 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
Chmp3Q9CQ10 Gm28282-201ENSMUST00000186072 186 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
Chmp3Q9CQ10 Gm29604-201ENSMUST00000187176 163 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
Chmp3Q9CQ10 AF357341-201ENSMUST00000083088 75 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
Chmp3Q9CQ10 Gm23246-201ENSMUST00000083371 67 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
Chmp3Q9CQ10 Olfr1293-ps-203ENSMUST00000217845 3628 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
Chmp3Q9CQ10 Olfr65-201ENSMUST00000106864 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
Chmp3Q9CQ10 Olfr347-202ENSMUST00000216882 3385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
Chmp3Q9CQ10 5330434G04Rik-203ENSMUST00000142109 3449 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
Chmp3Q9CQ10 Traj30-201ENSMUST00000103711 59 ntAPPRIS P1 BASIC3.67□□□□□ -1.82
Chmp3Q9CQ10 Gm25407-201ENSMUST00000104102 134 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
Chmp3Q9CQ10 Gm22213-201ENSMUST00000157564 119 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
Chmp3Q9CQ10 Gm18665-201ENSMUST00000189783 270 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
Chmp3Q9CQ10 Mir7657-201ENSMUST00000196051 57 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
Chmp3Q9CQ10 Ptp4a1-206ENSMUST00000202889 135 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
Chmp3Q9CQ10 Gm43898-201ENSMUST00000204456 424 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
Chmp3Q9CQ10 AC124537.1-201ENSMUST00000222890 159 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
Chmp3Q9CQ10 Gm22249-201ENSMUST00000082485 136 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
Chmp3Q9CQ10 AC125374.3-201ENSMUST00000214983 2810 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
Chmp3Q9CQ10 Vmn2r70-201ENSMUST00000168230 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
Chmp3Q9CQ10 Olfr576-201ENSMUST00000098213 3132 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
Chmp3Q9CQ10 A230004M16Rik-202ENSMUST00000139508 4468 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
Chmp3Q9CQ10 Gm6954-201ENSMUST00000117416 225 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Chmp3Q9CQ10 Gm11644-201ENSMUST00000119735 150 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Chmp3Q9CQ10 Gm25882-201ENSMUST00000157784 85 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Chmp3Q9CQ10 Gm26088-201ENSMUST00000157896 131 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Chmp3Q9CQ10 Gm27934-201ENSMUST00000158795 63 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Chmp3Q9CQ10 1700109G14Rik-203ENSMUST00000190737 801 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
Chmp3Q9CQ10 Gm25130-201ENSMUST00000082650 156 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Chmp3Q9CQ10 Gm24615-201ENSMUST00000083268 113 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Chmp3Q9CQ10 Mir184-201ENSMUST00000083662 69 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Chmp3Q9CQ10 Olfr789-202ENSMUST00000213992 4421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
Chmp3Q9CQ10 AC164164.1-201ENSMUST00000223245 2340 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Chmp3Q9CQ10 Olfr1153-202ENSMUST00000217436 2144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.82
Chmp3Q9CQ10 Gm37402-201ENSMUST00000194525 5000 ntBASIC3.65□□□□□ -1.82
Chmp3Q9CQ10 Olfr786-202ENSMUST00000204529 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.82
Chmp3Q9CQ10 Gm24747-201ENSMUST00000157835 87 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Chmp3Q9CQ10 Gm25373-201ENSMUST00000158156 115 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Chmp3Q9CQ10 AC115735.1-201ENSMUST00000226633 350 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Chmp3Q9CQ10 Gm5239-201ENSMUST00000081864 369 ntAPPRIS P1 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Chmp3Q9CQ10 Gm22738-201ENSMUST00000083440 147 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Chmp3Q9CQ10 Gm25513-201ENSMUST00000083861 162 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Chmp3Q9CQ10 Olfr65-203ENSMUST00000214300 2855 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Chmp3Q9CQ10 AC158979.1-201ENSMUST00000223594 2252 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Chmp3Q9CQ10 AC167721.1-201ENSMUST00000217088 279 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Chmp3Q9CQ10 Gm8219-201ENSMUST00000218309 242 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Chmp3Q9CQ10 Gm19563-201ENSMUST00000222031 270 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Chmp3Q9CQ10 Vmn1r185-211ENSMUST00000228467 6915 ntAPPRIS P1 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Chmp3Q9CQ10 Gm44846-201ENSMUST00000207127 3243 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Chmp3Q9CQ10 Wnk3-201ENSMUST00000096285 8551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Chmp3Q9CQ10 Gm26081-201ENSMUST00000104068 132 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Chmp3Q9CQ10 Snord100-201ENSMUST00000116836 74 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Chmp3Q9CQ10 Gm30534-201ENSMUST00000217928 207 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 124.6 ms